MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus intermedius JTH08

Total Repeats: 326

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018073	ATTGA	2	10	3471	3480	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018073	ATACT	2	10	14772	14781	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018073	TCTAT	2	10	15418	15427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018073	AACAG	2	10	15517	15526	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018073	TCGTG	2	10	20519	20528	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018073	GGGAG	2	10	21781	21790	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018073	AGGGA	2	10	23990	23999	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018073	TTGAT	2	10	33084	33093	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018073	TTTTG	2	10	48880	48889	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018073	TATGA	2	10	49060	49069	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018073	TAAAA	2	10	51675	51684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018073	AAGCA	2	10	56594	56603	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018073	TCTTT	2	10	60908	60917	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018073	CTTTT	2	10	60955	60964	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018073	ACATC	2	10	66503	66512	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_018073	CTTTT	2	10	72745	72754	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018073	AAAAT	2	10	81033	81042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018073	AATAA	2	10	86298	86307	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018073	TTATA	2	10	91975	91984	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018073	TTGGA	2	10	92006	92015	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018073	CTTTT	2	10	109373	109382	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018073	TATAA	2	10	110256	110265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018073	AGGAA	2	10	130624	130633	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018073	TGATA	2	10	132679	132688	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018073	GGGGC	2	10	133606	133615	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018073	TAAAA	2	10	143557	143566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018073	TTTTA	2	10	143595	143604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018073	TATAT	2	10	147150	147159	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018073	TAAAA	2	10	149749	149758	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018073	AGATA	2	10	151308	151317	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018073	TTTTG	2	10	156162	156171	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018073	GAGTA	2	10	157387	157396	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018073	GGAAA	2	10	163855	163864	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018073	GAGTT	2	10	168617	168626	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018073	TTGAA	2	10	173763	173772	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018073	GAAAT	2	10	174573	174582	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018073	AAGGA	2	10	176820	176829	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018073	AATAA	2	10	181673	181682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018073	AGAGA	2	10	189847	189856	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018073	ACAAT	2	10	197043	197052	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018073	TGATA	2	10	202611	202620	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018073	TCTTT	2	10	209870	209879	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018073	TATTC	2	10	219402	219411	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018073	CTTTT	2	10	220736	220745	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018073	ATCCT	2	10	237866	237875	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_018073	TTCTA	2	10	242185	242194	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018073	CCCTG	2	10	244477	244486	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_018073	ATTTT	2	10	258137	258146	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018073	AATGA	2	10	258206	258215	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018073	TATAA	2	10	260005	260014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018073	ATTGA	2	10	261837	261846	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018073	ACAAA	2	10	264697	264706	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018073	GATAA	2	10	276911	276920	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018073	TCTAT	2	10	279586	279595	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018073	TCAGT	2	10	295973	295982	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018073	ATAAA	2	10	308564	308573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018073	TCGTG	2	10	311901	311910	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018073	GGGAG	2	10	313163	313172	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018073	AGGGA	2	10	315372	315381	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018073	AAAAT	2	10	315977	315986	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018073	AAAGA	2	10	317580	317589	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018073	TAATT	2	10	317628	317637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018073	GAAGG	2	10	320489	320498	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018073	TATAA	2	10	342028	342037	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018073	AAAAG	2	10	345699	345708	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018073	AAATA	2	10	346520	346529	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018073	AGAAA	2	10	354099	354108	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018073	AGATG	2	10	360481	360490	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018073	CAGAA	2	10	360565	360574	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018073	TATAA	2	10	360621	360630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018073	GTGTC	2	10	362156	362165	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018073	TTTTG	2	10	362181	362190	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018073	ATTTT	2	10	367623	367632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018073	TTCGG	2	10	372937	372946	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018073	ATAAA	2	10	376734	376743	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018073	AAAGG	2	10	381879	381888	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018073	ACAAA	2	10	386539	386548	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018073	AAATG	2	10	389526	389535	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018073	GCACC	2	10	398316	398325	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_018073	ATTTT	2	10	414548	414557	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018073	TGATG	2	10	441623	441632	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018073	GATAA	2	10	443303	443312	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018073	CTTTT	2	10	458481	458490	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018073	ATATT	2	10	475080	475089	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018073	AATTG	2	10	475526	475535	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018073	AAAAT	2	10	475683	475692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018073	AATTT	2	10	485112	485121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018073	TATAG	2	10	489752	489761	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018073	ATTCT	2	10	517610	517619	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018073	AATAC	2	10	517716	517725	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018073	GTTAT	2	10	523244	523253	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018073	ATTGG	2	10	531212	531221	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018073	TTATG	2	10	531279	531288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018073	TAAAA	2	10	531530	531539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018073	GTCTT	2	10	537662	537671	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018073	ATTTT	2	10	547289	547298	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018073	GCTTT	2	10	559648	559657	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018073	TTAGA	2	10	569334	569343	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018073	AGAAT	2	10	573000	573009	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018073	TTATT	2	10	577550	577559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018073	ATATA	2	10	582652	582661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018073	AGAAA	2	10	588045	588054	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018073	GATTT	2	10	601323	601332	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018073	ATTGG	2	10	601781	601790	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018073	TTTTA	2	10	640593	640602	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018073	TATAA	2	10	695612	695621	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018073	TTAAA	2	10	695644	695653	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018073	TCTTT	2	10	697687	697696	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018073	TTTTA	2	10	699059	699068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018073	ATTTT	2	10	711836	711845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018073	GAAAA	2	10	715948	715957	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018073	GCAGA	2	10	732046	732055	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018073	GAACT	2	10	734053	734062	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018073	TAACG	2	10	750624	750633	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018073	TAACG	2	10	750924	750933	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_018073	CATAG	2	10	755093	755102	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018073	TAAAA	2	10	755239	755248	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018073	GTTTT	2	10	760291	760300	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018073	TAAAA	2	10	773342	773351	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018073	CAAGA	2	10	777018	777027	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018073	ATATT	2	10	779242	779251	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018073	TAACT	2	10	780134	780143	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018073	GTGAG	2	10	785083	785092	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018073	GTAAA	2	10	785646	785655	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018073	GAGCA	7	35	806179	806213	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018073	ATAAA	2	10	811719	811728	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018073	AGAAA	2	10	813919	813928	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018073	TTGTT	2	10	814753	814762	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018073	TCAAT	2	10	814837	814846	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018073	AATGC	2	10	814926	814935	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_018073	ATTTC	2	10	818351	818360	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018073	AAAAT	2	10	820972	820981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018073	AGAAA	2	10	822002	822011	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018073	TATAA	2	10	827349	827358	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018073	ATTAT	2	10	841467	841476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018073	ACCAA	2	10	842312	842321	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_018073	ATAAA	2	10	847269	847278	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018073	GATTG	2	10	854505	854514	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018073	CATTA	2	10	856566	856575	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018073	GAAGA	2	10	858610	858619	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018073	TCTGC	2	10	859656	859665	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_018073	ATGAT	2	10	862576	862585	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018073	ATTTA	2	10	868518	868527	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018073	TAAAG	2	10	888970	888979	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018073	GAAAT	2	10	894516	894525	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018073	CTTGT	2	10	900145	900154	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_018073	TTGAT	2	10	910604	910613	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018073	CTTAT	2	10	911288	911297	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_018073	AAATA	2	10	921578	921587	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018073	AAATA	2	10	931832	931841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018073	CAGTC	2	10	942614	942623	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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289	NC_018073	TTTTA	2	10	1720133	1720142	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_018073	ACCAA	2	10	1723125	1723134	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
291	NC_018073	AAATG	2	10	1723503	1723512	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
292	NC_018073	TTTTA	2	10	1733156	1733165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_018073	TAAAA	2	10	1737767	1737776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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320	NC_018073	AAAAC	2	10	1888573	1888582	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
321	NC_018073	CATTA	2	10	1897550	1897559	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
322	NC_018073	GTGCT	2	10	1905119	1905128	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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324	NC_018073	TAATT	2	10	1916058	1916067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_018073	AAATC	2	10	1930289	1930298	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
326	NC_018073	TTTTA	2	10	1931172	1931181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.