MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus intermedius JTH08

Total Repeats: 6534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018073	TAAG	2	8	279542	279549	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_018073	ATA	2	6	279552	279557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_018073	TAA	2	6	279563	279568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_018073	AT	3	6	279570	279575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018073	TCTAT	2	10	279586	279595	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1006	NC_018073	AG	3	6	279626	279631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_018073	ATT	2	6	280807	280812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_018073	ATA	2	6	282164	282169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_018073	TAA	2	6	282239	282244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_018073	AG	3	6	282744	282749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_018073	ATG	2	6	282756	282761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_018073	CTTT	2	8	285209	285216	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_018073	AGA	2	6	285227	285232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_018073	GAG	2	6	285258	285263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_018073	ATT	2	6	285309	285314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_018073	AAT	2	6	285355	285360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_018073	TC	3	6	285709	285714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_018073	AGC	2	6	289230	289235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_018073	ACGC	2	8	289347	289354	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_018073	A	6	6	289355	289360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_018073	A	6	6	289375	289380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_018073	AAC	2	6	289429	289434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_018073	GTA	2	6	289462	289467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_018073	GAA	2	6	290712	290717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_018073	GAAA	2	8	295926	295933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_018073	TCT	2	6	295962	295967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_018073	TCAGT	2	10	295973	295982	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_018073	TAA	2	6	296036	296041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_018073	GTT	2	6	296082	296087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_018073	AGA	2	6	296111	296116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_018073	AGA	2	6	296126	296131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_018073	ATAG	2	8	296474	296481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_018073	AGG	2	6	298701	298706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_018073	T	6	6	299660	299665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_018073	AGA	2	6	299673	299678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_018073	A	6	6	299707	299712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_018073	AGG	2	6	299817	299822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_018073	AAT	2	6	300615	300620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_018073	TCT	2	6	300917	300922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_018073	TCCT	2	8	300983	300990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_018073	TTG	2	6	301045	301050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018073	T	6	6	301094	301099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_018073	GAA	2	6	301157	301162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_018073	AAG	2	6	301187	301192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_018073	TTG	2	6	301222	301227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_018073	AGG	2	6	301277	301282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_018073	AG	3	6	301309	301314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_018073	GGAA	2	8	301376	301383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_018073	AGG	3	9	301409	301417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018073	ACA	2	6	301817	301822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_018073	TTGA	2	8	301850	301857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_018073	TAT	2	6	301939	301944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_018073	CCT	2	6	303601	303606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_018073	TAT	2	6	303628	303633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_018073	AGAA	2	8	303687	303694	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_018073	T	6	6	306561	306566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_018073	ATT	2	6	307348	307353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_018073	TA	3	6	307415	307420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_018073	TAT	2	6	307426	307431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_018073	T	7	7	307440	307446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_018073	TAA	2	6	307451	307456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_018073	ATAAA	2	10	308564	308573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_018073	A	6	6	310103	310108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_018073	A	7	7	310625	310631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_018073	A	6	6	310636	310641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_018073	AAG	2	6	310651	310656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_018073	AGT	2	6	310657	310662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_018073	GA	3	6	310750	310755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_018073	CAGT	2	8	310756	310763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_018073	AAAT	2	8	310775	310782	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_018073	GGC	2	6	310854	310859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_018073	TAC	2	6	310904	310909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_018073	CCTG	2	8	310954	310961	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_018073	TAG	2	6	311079	311084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_018073	CGA	2	6	311107	311112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1078	NC_018073	CGC	2	6	311228	311233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_018073	GTGA	2	8	311234	311241	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_018073	TGT	2	6	311267	311272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_018073	GAA	2	6	311277	311282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_018073	CAG	2	6	311350	311355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_018073	AGCG	2	8	311405	311412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_018073	AT	3	6	311534	311539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_018073	GGA	2	6	311540	311545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_018073	CT	3	6	311565	311570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_018073	GAA	2	6	311804	311809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_018073	GGT	2	6	311878	311883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_018073	GTC	2	6	311892	311897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_018073	TCGTG	2	10	311901	311910	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1091	NC_018073	CAT	2	6	311960	311965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_018073	TAA	2	6	311995	312000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_018073	GGA	2	6	312004	312009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_018073	ATC	2	6	312028	312033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1096	NC_018073	CGC	2	6	312194	312199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_018073	AC	3	6	312224	312229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_018073	CAC	2	6	312239	312244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_018073	AGCC	2	8	312286	312293	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_018073	GAT	2	6	312309	312314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_018073	CCT	2	6	312365	312370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_018073	AGG	2	6	312469	312474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_018073	TGA	2	6	312527	312532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_018073	GAA	2	6	312690	312695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_018073	ACG	2	6	312707	312712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_018073	GTAA	2	8	312730	312737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_018073	CAG	2	6	312771	312776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_018073	GAG	2	6	312811	312816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_018073	GCG	2	6	312884	312889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_018073	AGA	2	6	312966	312971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_018073	AG	3	6	312994	312999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_018073	CGG	2	6	313050	313055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_018073	GGA	2	6	313082	313087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_018073	GGGAG	2	10	313163	313172	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_018073	ACA	2	6	313200	313205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_018073	ATG	2	6	313267	313272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_018073	TGT	2	6	313337	313342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_018073	GGA	2	6	313400	313405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_018073	TC	3	6	313486	313491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_018073	ACC	2	6	313665	313670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_018073	AAT	2	6	313685	313690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_018073	AGC	2	6	313745	313750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_018073	ATTC	2	8	313752	313759	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_018073	TG	3	6	313874	313879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_018073	GA	3	6	314025	314030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_018073	AGG	2	6	314089	314094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_018073	TAG	2	6	314208	314213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_018073	AGTG	2	8	314217	314224	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_018073	GA	3	6	314321	314326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_018073	CT	3	6	314436	314441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_018073	GAT	2	6	314454	314459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_018073	CGG	2	6	314545	314550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_018073	GA	3	6	314643	314648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_018073	TAGG	2	8	314761	314768	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_018073	TAC	2	6	314815	314820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1137	NC_018073	CCT	2	6	314903	314908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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