MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfurospirillum barnesii SES-3 chromosome

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018002	TTTTG	2	10	13633	13642	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018002	TATTT	2	10	32763	32772	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018002	TTATG	2	10	32815	32824	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018002	GCTTT	2	10	48013	48022	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018002	CTTTT	2	10	50832	50841	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018002	CTTTT	2	10	87266	87275	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018002	AAAAT	2	10	87320	87329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018002	GGTTT	2	10	88253	88262	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018002	TAAAA	2	10	88793	88802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018002	TTATT	2	10	140425	140434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018002	ATTTT	2	10	166977	166986	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018002	AATAA	2	10	173424	173433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018002	AAAGA	2	10	199857	199866	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018002	CTTCT	2	10	232623	232632	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_018002	TAAAA	2	10	258601	258610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018002	CAGGG	2	10	283111	283120	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018002	GCTTT	2	10	285007	285016	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018002	AAATT	2	10	307098	307107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018002	TCCTT	2	10	322295	322304	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_018002	TGGTG	2	10	326051	326060	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018002	GCTTT	2	10	328471	328480	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018002	TTTTG	2	10	349002	349011	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018002	TTAAG	2	10	350748	350757	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018002	CTTAA	2	10	362854	362863	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018002	ATAAA	2	10	362908	362917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018002	ATAAA	2	10	410072	410081	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018002	CAAAA	2	10	410119	410128	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018002	AAAGA	2	10	431940	431949	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018002	TTTTA	2	10	443143	443152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018002	ATTTT	2	10	449633	449642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018002	GCTTT	2	10	471655	471664	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018002	ACTTT	2	10	486788	486797	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018002	GTAAA	2	10	487031	487040	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018002	ACTTT	2	10	487156	487165	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018002	AAACA	2	10	496885	496894	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018002	TGTTT	2	10	554615	554624	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018002	TAAAG	2	10	563066	563075	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018002	ATAGA	2	10	591110	591119	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018002	TATAT	2	10	642543	642552	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018002	TATGC	2	10	652154	652163	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018002	TAATG	2	10	704707	704716	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018002	AAAAT	2	10	714633	714642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018002	TAATT	2	10	753291	753300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018002	GCTTT	2	10	754011	754020	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018002	TGAAA	2	10	772741	772750	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018002	CTAAA	2	10	776529	776538	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018002	ATGGC	2	10	781751	781760	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018002	AAAGC	2	10	786261	786270	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018002	TTGCA	2	10	787156	787165	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018002	AAAGC	2	10	803251	803260	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018002	TTAAA	2	10	813637	813646	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018002	CTTTG	2	10	814437	814446	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018002	TGAAG	2	10	821733	821742	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018002	CTTCA	2	10	822436	822445	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_018002	AAATG	2	10	823262	823271	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018002	TCACT	2	10	839219	839228	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_018002	AAAGG	2	10	866783	866792	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018002	ATTTT	2	10	892442	892451	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018002	AGTTT	2	10	934303	934312	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018002	TAAAA	2	10	937530	937539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018002	GTGTT	2	10	939511	939520	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018002	ATAAA	2	10	966739	966748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018002	TAAAA	2	10	971573	971582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018002	GAAAA	2	10	973164	973173	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018002	TAGAG	2	10	999254	999263	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018002	GCTTT	2	10	1009855	1009864	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018002	CTCTT	2	10	1013312	1013321	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_018002	AATTT	2	10	1014257	1014266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018002	AATAT	2	10	1015401	1015410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018002	ATAAA	2	10	1036793	1036802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018002	GTAAG	2	10	1049351	1049360	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018002	AAATG	2	10	1075142	1075151	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018002	TTTTG	2	10	1077777	1077786	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018002	TTGTT	2	10	1082997	1083006	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018002	AGCAC	2	10	1105325	1105334	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_018002	AATTT	2	10	1128621	1128630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018002	AAATT	2	10	1143549	1143558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018002	ATTTA	2	10	1144430	1144439	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018002	CTATG	2	10	1146785	1146794	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018002	ATTAA	2	10	1155488	1155497	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018002	GTAAT	2	10	1158463	1158472	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018002	TTTTA	2	10	1163481	1163490	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018002	GTATT	2	10	1165347	1165356	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018002	GTTTT	2	10	1165903	1165912	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018002	GCGAT	2	10	1166197	1166206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018002	AATAA	2	10	1239085	1239094	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018002	TTTTA	2	10	1293080	1293089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018002	AATTA	2	10	1294819	1294828	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018002	TAACA	2	10	1295952	1295961	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018002	TTTTG	2	10	1311435	1311444	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018002	TATCT	2	10	1315231	1315240	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018002	GAAAC	2	10	1315792	1315801	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018002	ACAAA	2	10	1318849	1318858	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018002	AAATT	2	10	1326762	1326771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018002	TAGAA	2	10	1336280	1336289	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018002	TACAT	2	10	1336420	1336429	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018002	TGACA	2	10	1363436	1363445	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018002	CTCTT	2	10	1363487	1363496	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_018002	TTAGG	2	10	1418096	1418105	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018002	TTTTA	2	10	1480747	1480756	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018002	TTGTA	2	10	1495242	1495251	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018002	ATTGT	2	10	1511657	1511666	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018002	ATAAA	2	10	1596646	1596655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018002	TAACA	2	10	1630271	1630280	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018002	AAATT	2	10	1638256	1638265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018002	ACAAA	2	10	1682573	1682582	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018002	AGTAA	2	10	1717316	1717325	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018002	AGCTT	2	10	1717395	1717404	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018002	ATCTA	2	10	1718996	1719005	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018002	CTTCG	2	10	1719797	1719806	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_018002	TTCAC	2	10	1720323	1720332	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_018002	CACGA	2	10	1721522	1721531	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018002	GGCAA	2	10	1733243	1733252	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018002	ATTAA	2	10	1740825	1740834	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018002	AAAAC	2	10	1752181	1752190	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_018002	TTATT	2	10	1767566	1767575	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018002	CTTTT	2	10	1825417	1825426	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018002	TTTCT	2	10	1834273	1834282	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018002	TTTTA	2	10	1844360	1844369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018002	ATTTT	2	10	1887552	1887561	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018002	ATGTA	2	10	1906409	1906418	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018002	ATACT	2	10	1953729	1953738	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018002	ATTTT	2	10	1991335	1991344	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018002	AAAGA	2	10	1993262	1993271	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018002	CTAAG	2	10	2020555	2020564	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018002	ATTAA	2	10	2024988	2024997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018002	TTTAT	2	10	2036291	2036300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018002	TTATT	2	10	2052565	2052574	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018002	AAAGC	2	10	2053730	2053739	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018002	CTTCG	2	10	2062857	2062866	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_018002	CAATA	2	10	2078977	2078986	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018002	TAAAT	2	10	2081139	2081148	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018002	TTAAT	2	10	2081154	2081163	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018002	GCTTT	2	10	2081265	2081274	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018002	ACTTA	2	10	2081354	2081363	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018002	TTAAA	2	10	2085229	2085238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018002	TTTTA	2	10	2106419	2106428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018002	AAATC	2	10	2124594	2124603	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_018002	AACCA	2	10	2150197	2150206	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_018002	GCTTT	2	10	2156555	2156564	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018002	ATAAA	2	10	2166109	2166118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018002	TATTG	2	10	2208191	2208200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018002	TTTTA	2	10	2248726	2248735	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018002	GTAAA	2	10	2285241	2285250	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018002	TTTTA	2	10	2286186	2286195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018002	CAAAT	2	10	2292541	2292550	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_018002	ATATA	2	10	2295902	2295911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018002	ATTTA	2	10	2295963	2295972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018002	AATAC	2	10	2315043	2315052	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_018002	CGAAG	2	10	2324206	2324215	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_018002	CTTCG	2	10	2326447	2326456	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_018002	AAGCG	2	10	2332868	2332877	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_018002	GCTTT	2	10	2336793	2336802	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_018002	AAACA	2	10	2341716	2341725	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_018002	TTTAC	2	10	2378402	2378411	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_018002	CATAA	2	10	2384638	2384647	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_018002	TGATT	2	10	2436167	2436176	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018002	GAAGA	2	10	2437687	2437696	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018002	TAAAA	2	10	2439744	2439753	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018002	TGATT	2	10	2439813	2439822	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018002	CAAAA	2	10	2457689	2457698	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_018002	AAAGA	2	10	2463785	2463794	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018002	GAAAA	2	10	2463804	2463813	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018002	ATTTG	2	10	2464594	2464603	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018002	AGTAA	2	10	2473061	2473070	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018002	AGCTT	2	10	2473350	2473359	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
167	NC_018002	ATCTA	2	10	2474951	2474960	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_018002	CTTCG	2	10	2475752	2475761	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
169	NC_018002	TTCAC	2	10	2476278	2476287	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
170	NC_018002	CACGA	2	10	2477477	2477486	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.