MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 19072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018000	GCG	2	6	1378298	1378303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_018000	TCG	2	6	1378305	1378310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_018000	CG	3	6	1378324	1378329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_018000	CTC	2	6	1380333	1380338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_018000	AGGTG	2	10	1380405	1380414	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_018000	CAGTG	2	10	1380448	1380457	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3507	NC_018000	TGT	2	6	1380545	1380550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_018000	GC	3	6	1380584	1380589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_018000	GCGG	2	8	1382811	1382818	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3510	NC_018000	TAC	2	6	1383219	1383224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_018000	GGCA	2	8	1383309	1383316	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3512	NC_018000	A	6	6	1383643	1383648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_018000	CCT	2	6	1383667	1383672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_018000	CG	3	6	1383682	1383687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_018000	ATG	2	6	1383994	1383999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_018000	AAT	2	6	1384012	1384017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_018000	TA	4	8	1384102	1384109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_018000	ACAA	2	8	1384181	1384188	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3519	NC_018000	GGC	2	6	1385769	1385774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_018000	TGCGG	2	10	1385799	1385808	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3521	NC_018000	ATC	2	6	1386621	1386626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_018000	GCC	2	6	1386688	1386693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_018000	CTCAG	2	10	1386798	1386807	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3524	NC_018000	TTG	2	6	1386813	1386818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_018000	CG	3	6	1386955	1386960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_018000	GCC	2	6	1386985	1386990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_018000	CTC	2	6	1387025	1387030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_018000	CGG	2	6	1387051	1387056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_018000	TCCG	2	8	1387083	1387090	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_018000	TCG	2	6	1387119	1387124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_018000	CGA	2	6	1387126	1387131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_018000	GGC	2	6	1387149	1387154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_018000	GAA	2	6	1387162	1387167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_018000	CGA	2	6	1387204	1387209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_018000	CCT	2	6	1387234	1387239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_018000	GC	3	6	1387263	1387268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_018000	GC	3	6	1387281	1387286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_018000	ATA	2	6	1387288	1387293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_018000	GCA	2	6	1387305	1387310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_018000	CTT	3	9	1389028	1389036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_018000	GAC	2	6	1389051	1389056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_018000	CCG	2	6	1389061	1389066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_018000	CGT	2	6	1389075	1389080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_018000	TCC	2	6	1390397	1390402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_018000	CTC	2	6	1390437	1390442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_018000	TGTT	2	8	1390493	1390500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_018000	AAT	2	6	1390543	1390548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_018000	ACGGG	2	10	1395551	1395560	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3549	NC_018000	GCG	2	6	1395567	1395572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_018000	CCTGC	2	10	1399902	1399911	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3551	NC_018000	TGCA	2	8	1399912	1399919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3552	NC_018000	CGC	2	6	1401779	1401784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_018000	GCG	2	6	1401856	1401861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_018000	AGGC	2	8	1401893	1401900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_018000	GCG	2	6	1401971	1401976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_018000	TTA	2	6	1402791	1402796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_018000	ATTT	2	8	1402843	1402850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_018000	TGT	2	6	1402866	1402871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_018000	GCC	2	6	1402897	1402902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_018000	ATCG	2	8	1402906	1402913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_018000	CGG	3	9	1402946	1402954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_018000	CGGC	2	8	1402956	1402963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_018000	AGG	2	6	1402969	1402974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_018000	AAG	2	6	1403041	1403046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_018000	GGC	2	6	1403063	1403068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_018000	CGC	2	6	1403072	1403077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_018000	GCG	2	6	1403108	1403113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_018000	GCG	2	6	1403167	1403172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_018000	GCCT	2	8	1406502	1406509	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_018000	AAC	2	6	1406578	1406583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_018000	A	6	6	1406617	1406622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_018000	GC	3	6	1406706	1406711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_018000	CGC	2	6	1406730	1406735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_018000	AGC	2	6	1406797	1406802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_018000	AGCG	2	8	1406810	1406817	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3576	NC_018000	AGC	2	6	1408633	1408638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_018000	CG	3	6	1413616	1413621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3578	NC_018000	CAT	2	6	1413633	1413638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_018000	CTAC	2	8	1414890	1414897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_018000	CGT	2	6	1414918	1414923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_018000	TAG	2	6	1414970	1414975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_018000	TA	3	6	1415097	1415102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_018000	TTA	2	6	1415107	1415112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_018000	GTT	2	6	1415135	1415140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_018000	GCA	2	6	1420164	1420169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_018000	GCC	2	6	1420175	1420180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3587	NC_018000	CGAC	2	8	1420249	1420256	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_018000	CAC	2	6	1420293	1420298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_018000	CCG	2	6	1420301	1420306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_018000	GTCGCT	2	12	1420326	1420337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_018000	GCCCCG	2	12	1420443	1420454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_018000	GC	3	6	1420455	1420460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_018000	GCC	2	6	1421394	1421399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_018000	CGAC	2	8	1422381	1422388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_018000	GACG	2	8	1422457	1422464	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3596	NC_018000	CGCGC	2	10	1423794	1423803	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3597	NC_018000	CGG	2	6	1423807	1423812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_018000	AAC	2	6	1423820	1423825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_018000	CGAT	2	8	1423850	1423857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3600	NC_018000	CTTG	2	8	1423897	1423904	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3601	NC_018000	AAG	2	6	1423906	1423911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_018000	TCC	2	6	1424763	1424768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_018000	TCC	2	6	1428524	1428529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_018000	CAC	2	6	1429336	1429341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_018000	CCAT	2	8	1429345	1429352	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_018000	A	7	7	1429373	1429379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_018000	CA	3	6	1429404	1429409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_018000	TTG	2	6	1429460	1429465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_018000	GAC	2	6	1429472	1429477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_018000	GGAG	2	8	1429504	1429511	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_018000	GAGG	2	8	1434772	1434779	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_018000	GGT	2	6	1435868	1435873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_018000	CGA	2	6	1435921	1435926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_018000	GAA	3	9	1435997	1436005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_018000	TTG	2	6	1436361	1436366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_018000	CAG	2	6	1436386	1436391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_018000	TGC	2	6	1436626	1436631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_018000	GGA	2	6	1436642	1436647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_018000	CCT	2	6	1436750	1436755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_018000	GC	3	6	1436788	1436793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_018000	GA	3	6	1436834	1436839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_018000	CCG	2	6	1436841	1436846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_018000	TAAT	2	8	1436944	1436951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_018000	AT	3	6	1436980	1436985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_018000	TCGCA	2	10	1437009	1437018	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3626	NC_018000	TC	3	6	1437026	1437031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3627	NC_018000	GA	3	6	1437033	1437038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_018000	TA	3	6	1437052	1437057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_018000	T	6	6	1437078	1437083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_018000	GAC	2	6	1437087	1437092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_018000	CAC	2	6	1437118	1437123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3632	NC_018000	AAG	2	6	1437186	1437191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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