MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 19072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018000	GCC	2	6	963606	963611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2502	NC_018000	GCC	2	6	963633	963638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_018000	TCC	2	6	963884	963889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_018000	GATA	2	8	963941	963948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_018000	CAT	2	6	963977	963982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_018000	A	6	6	964006	964011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_018000	CGG	2	6	964015	964020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_018000	GCG	2	6	964070	964075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_018000	GTT	2	6	965285	965290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_018000	GGT	2	6	965339	965344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_018000	CGCC	2	8	965433	965440	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2512	NC_018000	CTG	2	6	967989	967994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_018000	CGG	2	6	967996	968001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_018000	GCC	2	6	968044	968049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_018000	CTC	2	6	968054	968059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2516	NC_018000	ATG	2	6	968092	968097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_018000	GA	3	6	968103	968108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_018000	GAA	2	6	970202	970207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_018000	AC	3	6	970220	970225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2520	NC_018000	GAGC	2	8	970238	970245	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2521	NC_018000	TTC	2	6	970259	970264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_018000	CGGGC	2	10	970325	970334	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2523	NC_018000	CGT	2	6	970814	970819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_018000	TC	3	6	970860	970865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2525	NC_018000	CTT	2	6	971907	971912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2531	NC_018000	GC	3	6	973476	973481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2532	NC_018000	TGG	2	6	973498	973503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_018000	GAG	2	6	975004	975009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_018000	CG	3	6	975013	975018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2535	NC_018000	GGA	2	6	976812	976817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2538	NC_018000	GAC	2	6	978722	978727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_018000	CGG	2	6	978779	978784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_018000	TGCAGT	2	12	979094	979105	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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2542	NC_018000	CGC	2	6	979140	979145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2543	NC_018000	CG	3	6	979166	979171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2544	NC_018000	GAG	2	6	979195	979200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_018000	GGCA	2	8	979585	979592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2547	NC_018000	GCA	2	6	979679	979684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2549	NC_018000	TCC	2	6	980990	980995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_018000	GGC	2	6	981003	981008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_018000	AGC	2	6	981098	981103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_018000	TTGC	2	8	981149	981156	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2553	NC_018000	CCG	2	6	981181	981186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2554	NC_018000	GGCC	2	8	981201	981208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2555	NC_018000	CGCT	2	8	983413	983420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2557	NC_018000	GAG	2	6	983525	983530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_018000	CGG	2	6	983559	983564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_018000	GGA	2	6	983592	983597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_018000	TGT	2	6	985793	985798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_018000	GCAGC	2	10	987010	987019	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2562	NC_018000	GGCG	2	8	987041	987048	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2563	NC_018000	AGGA	2	8	987053	987060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_018000	GTG	2	6	987702	987707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_018000	GA	3	6	987743	987748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_018000	CCAT	2	8	990318	990325	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2572	NC_018000	AGC	2	6	991146	991151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_018000	TCG	2	6	991172	991177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2575	NC_018000	GAG	2	6	991196	991201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2578	NC_018000	GC	3	6	991321	991326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2579	NC_018000	ATAC	2	8	991334	991341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2580	NC_018000	CTG	2	6	991349	991354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2599	NC_018000	ATC	2	6	993806	993811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2601	NC_018000	TCC	2	6	993951	993956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2602	NC_018000	CAT	2	6	994010	994015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_018000	GATC	2	8	998051	998058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2604	NC_018000	CAT	2	6	1002125	1002130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_018000	CGC	3	9	1002176	1002184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2609	NC_018000	TTCG	2	8	1002364	1002371	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2610	NC_018000	CGAT	2	8	1002383	1002390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2611	NC_018000	TCCT	2	8	1002427	1002434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2612	NC_018000	GCT	2	6	1002807	1002812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_018000	ACG	2	6	1002842	1002847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2615	NC_018000	CGGA	2	8	1002884	1002891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2616	NC_018000	GGA	2	6	1002899	1002904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_018000	CCGC	2	8	1004498	1004505	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2618	NC_018000	GC	4	8	1004539	1004546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2619	NC_018000	AGC	3	9	1004564	1004572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_018000	CCT	2	6	1005272	1005277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2621	NC_018000	TC	3	6	1005343	1005348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2622	NC_018000	CGA	2	6	1005396	1005401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_018000	ACA	2	6	1005413	1005418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_018000	GCA	2	6	1005522	1005527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_018000	GCG	2	6	1007092	1007097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_018000	CGG	4	12	1007482	1007493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_018000	GTAT	2	8	1007529	1007536	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_018000	TCC	2	6	1007575	1007580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2629	NC_018000	CG	3	6	1007759	1007764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2630	NC_018000	TGA	2	6	1007815	1007820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_018000	AAG	2	6	1007846	1007851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_018000	GA	3	6	1007859	1007864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_018000	TCG	2	6	1010137	1010142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2634	NC_018000	GC	3	6	1011117	1011122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2635	NC_018000	GCC	2	6	1011172	1011177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2758	NC_018000	G	6	6	1090354	1090359	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2759	NC_018000	TCGCC	2	10	1092832	1092841	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2760	NC_018000	ACA	2	6	1092896	1092901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2761	NC_018000	ATCGC	2	10	1092907	1092916	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2762	NC_018000	GC	3	6	1094455	1094460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2763	NC_018000	CT	3	6	1095446	1095451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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