MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 19072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018000	CGC	2	6	2065587	2065592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_018000	CAA	2	6	2065965	2065970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_018000	AAG	2	6	2065996	2066001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_018000	GTT	2	6	2066512	2066517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_018000	GA	3	6	2066522	2066527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_018000	GGGT	2	8	2066533	2066540	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_018000	CT	3	6	2066586	2066591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_018000	GAT	2	6	2066604	2066609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_018000	AGCG	2	8	2066618	2066625	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5510	NC_018000	ATT	2	6	2066718	2066723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_018000	CTC	2	6	2066729	2066734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_018000	GACCG	2	10	2066738	2066747	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5513	NC_018000	GC	4	8	2066790	2066797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_018000	CAC	2	6	2066830	2066835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_018000	GCC	2	6	2066853	2066858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_018000	GCT	2	6	2066877	2066882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_018000	GTA	2	6	2066903	2066908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_018000	ACCAG	2	10	2066965	2066974	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5519	NC_018000	GAA	2	6	2066981	2066986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_018000	AT	3	6	2066998	2067003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_018000	GT	3	6	2067011	2067016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_018000	GCAG	2	8	2067024	2067031	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5523	NC_018000	TGC	2	6	2067041	2067046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_018000	GGAT	2	8	2067077	2067084	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_018000	CAT	2	6	2067089	2067094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_018000	GAA	2	6	2067127	2067132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_018000	CGA	2	6	2067181	2067186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_018000	ACC	3	9	2067210	2067218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_018000	CG	3	6	2067272	2067277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_018000	GCC	2	6	2067353	2067358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_018000	GT	3	6	2067397	2067402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_018000	CCA	2	6	2067403	2067408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_018000	TCG	2	6	2067561	2067566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_018000	GCC	2	6	2067689	2067694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5535	NC_018000	ATC	2	6	2067698	2067703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_018000	GCT	2	6	2068021	2068026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_018000	CAG	2	6	2068105	2068110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_018000	CGT	2	6	2068301	2068306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_018000	CCT	2	6	2068363	2068368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_018000	GAC	2	6	2068416	2068421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_018000	CGT	2	6	2069306	2069311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_018000	AAG	2	6	2069326	2069331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_018000	GGC	2	6	2069372	2069377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_018000	GC	3	6	2069423	2069428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_018000	CGAA	2	8	2069429	2069436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5546	NC_018000	GCC	2	6	2069497	2069502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5547	NC_018000	CGC	2	6	2069533	2069538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_018000	GATC	2	8	2069572	2069579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5549	NC_018000	AAG	2	6	2070617	2070622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_018000	CG	3	6	2070636	2070641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5551	NC_018000	TGCGGG	2	12	2070806	2070817	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5552	NC_018000	GGC	2	6	2070874	2070879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_018000	CGG	2	6	2071146	2071151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_018000	GAC	2	6	2071152	2071157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_018000	TC	3	6	2071173	2071178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_018000	CGG	2	6	2071186	2071191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_018000	GCT	2	6	2071245	2071250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_018000	AGCG	2	8	2071765	2071772	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5559	NC_018000	CG	3	6	2071771	2071776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_018000	TGA	2	6	2071886	2071891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_018000	CAGGC	2	10	2071965	2071974	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5562	NC_018000	CCGA	2	8	2072028	2072035	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5563	NC_018000	GGC	2	6	2072057	2072062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_018000	GTT	2	6	2072220	2072225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_018000	CGTT	2	8	2073205	2073212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5566	NC_018000	TAG	2	6	2073230	2073235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_018000	CGG	2	6	2073236	2073241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_018000	TCTG	2	8	2073292	2073299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5569	NC_018000	CCG	2	6	2073323	2073328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_018000	CCG	2	6	2073350	2073355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_018000	CAA	2	6	2073377	2073382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_018000	GC	3	6	2073411	2073416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_018000	GGTA	2	8	2073493	2073500	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_018000	TGA	2	6	2073509	2073514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_018000	GGATT	2	10	2073543	2073552	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_018000	GC	3	6	2073579	2073584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_018000	TCA	2	6	2073614	2073619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_018000	GCC	2	6	2073638	2073643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5579	NC_018000	TC	3	6	2073695	2073700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_018000	CAA	2	6	2073704	2073709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_018000	CA	3	6	2073720	2073725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_018000	CTGC	2	8	2073763	2073770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5583	NC_018000	GCA	2	6	2073778	2073783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_018000	TC	3	6	2073812	2073817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_018000	TCC	2	6	2073846	2073851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_018000	CTC	2	6	2073967	2073972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5587	NC_018000	A	6	6	2073978	2073983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_018000	ACC	2	6	2074017	2074022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5589	NC_018000	T	6	6	2074052	2074057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_018000	GGGC	2	8	2074058	2074065	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5591	NC_018000	GCTCA	2	10	2074083	2074092	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5592	NC_018000	GCT	2	6	2074184	2074189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_018000	CCG	2	6	2074202	2074207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5594	NC_018000	CG	3	6	2074225	2074230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_018000	TGA	2	6	2074263	2074268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_018000	GGA	2	6	2074285	2074290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_018000	A	7	7	2074295	2074301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_018000	TG	3	6	2074328	2074333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_018000	AAC	2	6	2074349	2074354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_018000	TGC	2	6	2074909	2074914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_018000	CTT	2	6	2074926	2074931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_018000	CGC	2	6	2074974	2074979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_018000	GCA	2	6	2075062	2075067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_018000	GCG	2	6	2075074	2075079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_018000	CG	3	6	2075078	2075083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5606	NC_018000	CAT	2	6	2075097	2075102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_018000	GTT	2	6	2076407	2076412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_018000	ACG	2	6	2076435	2076440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_018000	CGG	2	6	2076448	2076453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_018000	ATC	2	6	2076575	2076580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_018000	TCAT	2	8	2076665	2076672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5612	NC_018000	AGG	2	6	2076694	2076699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_018000	CCT	2	6	2076737	2076742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5614	NC_018000	CGA	2	6	2078350	2078355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_018000	A	6	6	2078430	2078435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_018000	CG	4	8	2078516	2078523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5617	NC_018000	TGA	2	6	2078524	2078529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_018000	GC	3	6	2078569	2078574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5619	NC_018000	CT	3	6	2078585	2078590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5620	NC_018000	CGC	2	6	2079253	2079258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5621	NC_018000	GTT	2	6	2079308	2079313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5624	NC_018000	GCG	2	6	2079356	2079361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_018000	ACG	2	6	2079425	2079430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_018000	GCC	2	6	2079450	2079455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5627	NC_018000	CGT	2	6	2079542	2079547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5630	NC_018000	CGA	2	6	2079586	2079591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5631	NC_018000	CGA	2	6	2079594	2079599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5632	NC_018000	GTC	2	6	2079600	2079605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5635	NC_018000	CGGAG	2	10	2079745	2079754	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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5661	NC_018000	GC	3	6	2084754	2084759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5662	NC_018000	TCG	2	6	2084806	2084811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5755	NC_018000	CCTGT	2	10	2100070	2100079	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5760	NC_018000	TCG	2	6	2103140	2103145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5762	NC_018000	TGT	2	6	2103274	2103279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5878	NC_018000	TGATCC	2	12	2136458	2136469	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5880	NC_018000	TGAG	2	8	2136541	2136548	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5881	NC_018000	GC	3	6	2136555	2136560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5882	NC_018000	GCC	2	6	2136565	2136570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5883	NC_018000	TCG	2	6	2136772	2136777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5884	NC_018000	GA	3	6	2136813	2136818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5885	NC_018000	GCG	2	6	2136823	2136828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5886	NC_018000	GAAG	2	8	2137743	2137750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5887	NC_018000	GCA	3	9	2137755	2137763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5889	NC_018000	CTG	2	6	2139913	2139918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5997	NC_018000	GCA	2	6	2164926	2164931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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