MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 19072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018000	TG	4	8	1922625	1922632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_018000	CAT	2	6	1922695	1922700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_018000	GCT	2	6	1922704	1922709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_018000	CG	3	6	1922770	1922775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_018000	CG	3	6	1922790	1922795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_018000	GAT	2	6	1922883	1922888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_018000	TG	4	8	1922947	1922954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_018000	TGC	2	6	1923018	1923023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_018000	GCA	2	6	1923028	1923033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_018000	GGC	2	6	1923043	1923048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_018000	CCT	2	6	1923937	1923942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_018000	TGA	2	6	1923949	1923954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_018000	TCT	2	6	1925349	1925354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_018000	TGA	2	6	1925435	1925440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_018000	GC	3	6	1925553	1925558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_018000	GGCT	2	8	1925565	1925572	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_018000	G	6	6	1925591	1925596	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_018000	GCCAA	2	10	1927391	1927400	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5019	NC_018000	CTG	2	6	1927456	1927461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_018000	GCCA	2	8	1927485	1927492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_018000	TCA	2	6	1927539	1927544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_018000	GGA	2	6	1927575	1927580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_018000	GTT	2	6	1927589	1927594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_018000	GCAT	2	8	1927608	1927615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5025	NC_018000	GAA	2	6	1927686	1927691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_018000	GA	3	6	1927822	1927827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_018000	GTT	2	6	1927864	1927869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_018000	GGC	2	6	1928030	1928035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_018000	T	6	6	1928052	1928057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_018000	GCCAG	2	10	1928058	1928067	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5031	NC_018000	TCG	2	6	1928091	1928096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_018000	TGG	2	6	1928104	1928109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_018000	GCATC	2	10	1928141	1928150	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5034	NC_018000	GGA	2	6	1928246	1928251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_018000	CTG	2	6	1928266	1928271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_018000	ATT	2	6	1928324	1928329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_018000	GGC	2	6	1932152	1932157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_018000	TCC	2	6	1934119	1934124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_018000	CTGA	2	8	1934226	1934233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_018000	GCGTG	2	10	1934256	1934265	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5041	NC_018000	ATG	2	6	1935106	1935111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_018000	TGC	2	6	1935137	1935142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_018000	CT	3	6	1936568	1936573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_018000	CCT	2	6	1936603	1936608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_018000	CGC	3	9	1936640	1936648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_018000	CCGC	2	8	1940841	1940848	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5047	NC_018000	TTC	2	6	1942120	1942125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_018000	CAC	2	6	1942133	1942138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_018000	GAA	2	6	1942391	1942396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_018000	GGC	2	6	1942411	1942416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_018000	GGT	2	6	1942429	1942434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_018000	CGC	2	6	1942496	1942501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_018000	GC	3	6	1942531	1942536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5054	NC_018000	GTGCG	2	10	1942549	1942558	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5055	NC_018000	GAAA	2	8	1942598	1942605	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_018000	GAC	2	6	1942619	1942624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_018000	GGC	2	6	1942679	1942684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_018000	CCAA	2	8	1942717	1942724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_018000	GC	3	6	1942746	1942751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_018000	GAA	2	6	1942789	1942794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_018000	CCG	2	6	1942857	1942862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_018000	AG	3	6	1942864	1942869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_018000	TCA	2	6	1942874	1942879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_018000	CGG	2	6	1942955	1942960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_018000	GC	3	6	1942970	1942975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_018000	GCCG	2	8	1942996	1943003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_018000	GGCTT	2	10	1943045	1943054	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5068	NC_018000	CGT	2	6	1943057	1943062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_018000	ATT	2	6	1943178	1943183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_018000	GCC	2	6	1946289	1946294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_018000	TA	3	6	1946431	1946436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_018000	TGC	2	6	1946455	1946460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_018000	C	8	8	1946575	1946582	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5074	NC_018000	AAG	2	6	1946703	1946708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_018000	CTCTC	2	10	1946791	1946800	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5076	NC_018000	GTA	2	6	1946907	1946912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_018000	ACCG	2	8	1946931	1946938	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_018000	GTC	2	6	1946965	1946970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_018000	GTC	2	6	1946983	1946988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_018000	CCA	2	6	1947116	1947121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_018000	GGC	2	6	1947154	1947159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_018000	GCC	2	6	1947166	1947171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_018000	CTTG	2	8	1947172	1947179	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_018000	CGA	2	6	1947214	1947219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_018000	ATCG	2	8	1947243	1947250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_018000	CT	3	6	1947330	1947335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5087	NC_018000	CTC	2	6	1947372	1947377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5088	NC_018000	ACC	3	9	1947436	1947444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_018000	TC	3	6	1947457	1947462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_018000	CCT	2	6	1947464	1947469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_018000	AAGG	2	8	1947622	1947629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_018000	TAC	2	6	1950813	1950818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_018000	CT	3	6	1950845	1950850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5094	NC_018000	CCG	2	6	1950973	1950978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_018000	CG	3	6	1950985	1950990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5096	NC_018000	GC	3	6	1951003	1951008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_018000	TGCGA	2	10	1952348	1952357	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5098	NC_018000	CA	3	6	1952418	1952423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_018000	T	6	6	1952439	1952444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_018000	AAC	2	6	1952471	1952476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_018000	GTT	2	6	1952574	1952579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_018000	GGA	2	6	1952584	1952589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_018000	GCT	2	6	1952715	1952720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_018000	AAAGC	2	10	1952775	1952784	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5105	NC_018000	CAT	2	6	1952794	1952799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_018000	GC	3	6	1952881	1952886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_018000	TGT	2	6	1952902	1952907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_018000	GTG	2	6	1952950	1952955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_018000	TGA	2	6	1953005	1953010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_018000	ACC	2	6	1953015	1953020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_018000	CGA	2	6	1953027	1953032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_018000	TGA	2	6	1953035	1953040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_018000	GCTT	2	8	1953047	1953054	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5114	NC_018000	TGC	2	6	1953078	1953083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_018000	GAT	2	6	1953088	1953093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_018000	TGG	2	6	1953113	1953118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_018000	CACCG	2	10	1953180	1953189	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5118	NC_018000	ACG	2	6	1953243	1953248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_018000	GGCG	2	8	1953305	1953312	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5120	NC_018000	CAT	2	6	1953313	1953318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_018000	GCC	2	6	1953345	1953350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_018000	TCT	2	6	1954307	1954312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_018000	GGC	2	6	1956166	1956171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_018000	CG	3	6	1956237	1956242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5125	NC_018000	CTC	2	6	1957382	1957387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_018000	CGC	2	6	1958440	1958445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_018000	ACA	2	6	1958465	1958470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_018000	ACC	2	6	1958495	1958500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_018000	AT	3	6	1958508	1958513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_018000	ACA	2	6	1958515	1958520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_018000	GAT	2	6	1958582	1958587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_018000	TAT	2	6	1958646	1958651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5134	NC_018000	GCCAA	2	10	1960277	1960286	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5241	NC_018000	CCACC	2	10	2014979	2014988	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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5259	NC_018000	GGCG	2	8	2022942	2022949	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5260	NC_018000	AGC	2	6	2022960	2022965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5262	NC_018000	GCCGC	2	10	2023003	2023012	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5263	NC_018000	CAC	2	6	2023056	2023061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5264	NC_018000	GGC	2	6	2023062	2023067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5265	NC_018000	CAA	2	6	2023165	2023170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5266	NC_018000	CCA	2	6	2023192	2023197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5267	NC_018000	GC	3	6	2023251	2023256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5268	NC_018000	CT	3	6	2024750	2024755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5269	NC_018000	T	7	7	2024786	2024792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5270	NC_018000	GAA	2	6	2024826	2024831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5271	NC_018000	TCA	2	6	2024835	2024840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5272	NC_018000	TCG	2	6	2025293	2025298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5273	NC_018000	AAC	2	6	2025304	2025309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5274	NC_018000	CCAA	2	8	2025798	2025805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5275	NC_018000	TCG	2	6	2026774	2026779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5276	NC_018000	GCT	2	6	2026789	2026794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5277	NC_018000	A	8	8	2026804	2026811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5278	NC_018000	GA	3	6	2026849	2026854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5279	NC_018000	GACCA	2	10	2027852	2027861	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5280	NC_018000	GCCG	2	8	2027867	2027874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5281	NC_018000	TCAGG	2	10	2027910	2027919	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5283	NC_018000	AGA	2	6	2028922	2028927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5284	NC_018000	CCG	4	12	2028928	2028939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5285	NC_018000	TAT	2	6	2028948	2028953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5286	NC_018000	CAA	2	6	2029726	2029731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5287	NC_018000	TGT	2	6	2029735	2029740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5288	NC_018000	CGC	2	6	2029894	2029899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5290	NC_018000	GAA	2	6	2030643	2030648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5292	NC_018000	GCCG	2	8	2032101	2032108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5293	NC_018000	GGA	2	6	2032149	2032154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5294	NC_018000	CAAGC	2	10	2032267	2032276	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5297	NC_018000	GAC	2	6	2034365	2034370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5300	NC_018000	GAT	2	6	2035695	2035700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5301	NC_018000	CG	4	8	2035719	2035726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5302	NC_018000	CGA	3	9	2035730	2035738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5303	NC_018000	A	6	6	2035749	2035754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5304	NC_018000	GC	3	6	2035809	2035814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5305	NC_018000	CAGC	2	8	2035823	2035830	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5306	NC_018000	TGC	2	6	2035887	2035892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5332	NC_018000	TCG	2	6	2039155	2039160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5387	NC_018000	GCGCG	2	10	2051218	2051227	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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5389	NC_018000	GGC	2	6	2051267	2051272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5393	NC_018000	CAGGG	2	10	2051535	2051544	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5394	NC_018000	ACCGC	2	10	2051562	2051571	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5395	NC_018000	CAC	2	6	2051638	2051643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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