MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017950	TTGG	2	8	5584	5591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017950	TTAT	2	8	15745	15752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017950	AAAT	2	8	15851	15858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017950	GTGA	2	8	17483	17490	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017950	AGCG	2	8	17654	17661	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017950	AGCC	2	8	18536	18543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017950	GTAA	2	8	19116	19123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017950	TCAC	2	8	19173	19180	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017950	GCGA	2	8	19272	19279	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017950	ATTC	2	8	20138	20145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017950	CTAA	2	8	20494	20501	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017950	CTGA	2	8	20768	20775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017950	TAGG	2	8	21150	21157	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017950	ATCG	2	8	21960	21967	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017950	GCGT	2	8	23237	23244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017950	TTTG	2	8	27847	27854	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017950	ATTT	2	8	28914	28921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017950	GCTG	2	8	32872	32879	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017950	CCAG	2	8	39044	39051	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017950	ATAA	2	8	39792	39799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017950	ACAT	2	8	50040	50047	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017950	GCTG	2	8	52227	52234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017950	AATA	2	8	52299	52306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017950	TAAG	2	8	52383	52390	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017950	GTTT	2	8	52545	52552	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017950	CATT	2	8	54169	54176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017950	AATA	2	8	54399	54406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017950	ATCT	2	8	54426	54433	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017950	TATC	2	8	57173	57180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017950	GCTG	2	8	58722	58729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017950	GACC	2	8	60398	60405	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017950	ATAG	2	8	60466	60473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017950	GAAT	2	8	60706	60713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017950	GTTA	2	8	66982	66989	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017950	AATA	2	8	68292	68299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017950	GTTT	2	8	72813	72820	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017950	GAGC	2	8	73622	73629	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017950	AAGT	2	8	78462	78469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017950	GTTT	2	8	79512	79519	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017950	TAGG	2	8	79534	79541	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017950	AAAC	2	8	85742	85749	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017950	AAAC	2	8	85783	85790	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017950	CAAC	2	8	86952	86959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017950	ATCT	2	8	87002	87009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017950	TAGA	2	8	87109	87116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017950	TTAT	2	8	97715	97722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017950	AAAT	2	8	97820	97827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017950	GTGA	2	8	99453	99460	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017950	AGCG	2	8	99624	99631	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017950	AGCC	2	8	100506	100513	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017950	GTAA	2	8	101086	101093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017950	TCAC	2	8	101143	101150	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017950	GCGA	2	8	101242	101249	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017950	ATTC	2	8	102108	102115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017950	CTAA	2	8	102464	102471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017950	CTGA	2	8	102738	102745	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017950	TAGG	2	8	103120	103127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017950	ATCG	2	8	103930	103937	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017950	GCGT	2	8	104505	104512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017950	TTAT	2	8	110996	111003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017950	TTAA	2	8	112295	112302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017950	TCTT	2	8	115827	115834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017950	GAAA	2	8	125714	125721	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017950	AAGA	2	8	130983	130990	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017950	ATCT	2	8	131026	131033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017950	AGCC	2	8	131623	131630	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017950	AACT	2	8	136974	136981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017950	TTGC	2	8	137160	137167	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017950	TTTG	2	8	140571	140578	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017950	TCTA	2	8	140945	140952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017950	AATA	2	8	144140	144147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017950	TGCC	2	8	148400	148407	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017950	TCTA	2	8	150780	150787	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017950	ACCT	2	8	150789	150796	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017950	AAAC	2	8	151204	151211	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017950	AAAC	2	8	151631	151638	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017950	AAAT	2	8	151955	151962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017950	TTTG	2	8	151985	151992	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017950	ATAG	2	8	152021	152028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017950	AAAG	2	8	152166	152173	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017950	AGAT	2	8	157915	157922	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017950	TAGG	2	8	157991	157998	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017950	CTTT	2	8	158160	158167	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017950	TTTG	2	8	158909	158916	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017950	CTTT	2	8	163512	163519	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017950	GTCT	2	8	163557	163564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017950	CTCC	2	8	166256	166263	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_017950	GCTG	2	8	170932	170939	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017950	GCTG	2	8	178162	178169	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017950	TAGA	2	8	181466	181473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017950	GCTG	2	8	185839	185846	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017950	GACA	2	8	190588	190595	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017950	TAGG	2	8	190632	190639	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017950	TCCA	2	8	191625	191632	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017950	ATTT	2	8	202856	202863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017950	TAGT	2	8	208206	208213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017950	TTGT	2	8	213777	213784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017950	TTGT	2	8	214267	214274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017950	GAGT	2	8	216903	216910	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017950	ATTG	2	8	217088	217095	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017950	TTTA	2	8	217134	217141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017950	GAAT	2	8	219073	219080	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017950	ATAG	2	8	224102	224109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017950	AACG	2	8	232792	232799	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017950	TTAT	2	8	232903	232910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017950	GTCT	2	8	232922	232929	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017950	ACTG	2	8	237709	237716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017950	GCTG	2	8	241984	241991	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017950	GTTT	2	8	243591	243598	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017950	AAGA	2	8	243613	243620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017950	GCTG	2	8	254339	254346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017950	TGAT	2	8	254398	254405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017950	ATAA	2	8	256663	256670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017950	AAAT	2	8	261445	261452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017950	TAGT	2	8	261462	261469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017950	GCTG	2	8	265032	265039	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017950	CAAA	2	8	265155	265162	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017950	GGAA	2	8	265910	265917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017950	ATCC	2	8	266654	266661	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017950	GAAT	2	8	270207	270214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017950	AGAA	2	8	270312	270319	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017950	CAAA	2	8	270360	270367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017950	AACA	2	8	270506	270513	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017950	TAGG	2	8	273344	273351	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017950	TTGT	2	8	273449	273456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017950	TCTA	2	8	273534	273541	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017950	ATTT	2	8	275096	275103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017950	GTTT	2	8	275129	275136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017950	AAGA	2	8	276978	276985	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017950	TCTG	2	8	278045	278052	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017950	AAAG	2	8	292122	292129	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017950	CAAC	2	8	292145	292152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017950	AATC	2	8	294938	294945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017950	ATCT	2	8	296069	296076	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017950	AAAG	2	8	296729	296736	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017950	CTTT	2	8	300159	300166	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017950	TTGC	2	8	309159	309166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017950	GTCA	2	8	309355	309362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017950	AAAG	2	8	313003	313010	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017950	TTAT	2	8	313016	313023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017950	TGAG	2	8	317286	317293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017950	CTAT	2	8	321557	321564	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017950	ACCA	2	8	322461	322468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017950	CTTG	2	8	324613	324620	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017950	TCTT	2	8	324782	324789	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017950	AATC	2	8	324931	324938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017950	TTGT	2	8	326265	326272	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017950	ATTC	2	8	326430	326437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017950	CAAT	2	8	327550	327557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017950	GCTG	2	8	329745	329752	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017950	AAAG	2	8	330730	330737	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017950	CAAA	2	8	338940	338947	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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