MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 6897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017950	GTT	2	6	270143	270148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017950	AGG	2	6	270198	270203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017950	GAAT	2	8	270207	270214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017950	TAC	2	6	270240	270245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_017950	A	7	7	270255	270261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017950	AGAA	2	8	270312	270319	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017950	CAAA	2	8	270360	270367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_017950	A	6	6	270441	270446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017950	AAATA	2	10	270465	270474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017950	A	6	6	270474	270479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017950	TAG	2	6	270480	270485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017950	AACA	2	8	270506	270513	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_017950	GGA	2	6	270530	270535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017950	TAGG	2	8	273344	273351	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017950	AGT	2	6	273352	273357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017950	TTGT	2	8	273449	273456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017950	TGG	2	6	273467	273472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017950	TCTA	2	8	273534	273541	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_017950	TAGAA	2	10	273570	273579	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017950	A	6	6	273578	273583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017950	T	6	6	273588	273593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017950	ATTT	2	8	275096	275103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017950	GTTT	2	8	275129	275136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017950	TTAAA	2	10	275149	275158	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017950	TA	3	6	275188	275193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1029	NC_017950	AAGA	2	8	276978	276985	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017950	CAA	2	6	276991	276996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_017950	TTTGC	2	10	277060	277069	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_017950	GGT	2	6	277082	277087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017950	GGC	2	6	277253	277258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017950	GAT	2	6	277340	277345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017950	GGA	2	6	277349	277354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1040	NC_017950	TGG	2	6	277735	277740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017950	TGG	2	6	277783	277788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017950	CCT	2	6	277823	277828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_017950	CTT	2	6	277856	277861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1050	NC_017950	TCTTG	2	10	278269	278278	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1051	NC_017950	CAT	2	6	278305	278310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1053	NC_017950	CAG	2	6	278397	278402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_017950	TGA	2	6	278464	278469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017950	TCT	2	6	278544	278549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017950	TA	3	6	282599	282604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1059	NC_017950	TAG	2	6	282883	282888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1064	NC_017950	ATA	2	6	292155	292160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1068	NC_017950	AGA	2	6	292345	292350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017950	GA	3	6	292628	292633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1071	NC_017950	TA	3	6	294020	294025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017950	GGA	2	6	294760	294765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1074	NC_017950	T	6	6	294846	294851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017950	T	6	6	294874	294879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017950	TA	3	6	294896	294901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1103	NC_017950	TGG	2	6	307949	307954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017950	A	6	6	307964	307969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017950	T	6	6	309102	309107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017950	TTGC	2	8	309159	309166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_017950	TAA	2	6	309307	309312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017950	GTCA	2	8	309355	309362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_017950	T	7	7	310166	310172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017950	T	6	6	310186	310191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1114	NC_017950	AAT	2	6	310998	311003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017950	T	7	7	311020	311026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017950	A	7	7	311027	311033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1120	NC_017950	ATT	2	6	312964	312969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1123	NC_017950	AAT	2	6	313024	313029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1130	NC_017950	TAT	2	6	317174	317179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017950	ACT	2	6	317214	317219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017950	CTA	2	6	317261	317266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_017950	TGAG	2	8	317286	317293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017950	TCA	2	6	317489	317494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_017950	AGT	2	6	317576	317581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_017950	TTGAT	2	10	373134	373143	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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