MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 6897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017950	ATT	2	6	125725	125730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017950	TC	4	8	129394	129401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_017950	T	6	6	129415	129420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017950	AT	4	8	129439	129446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017950	A	6	6	129897	129902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017950	T	6	6	130895	130900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017950	ATT	2	6	130901	130906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017950	A	6	6	130912	130917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017950	GAG	2	6	130955	130960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017950	AAGA	2	8	130983	130990	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017950	ATCT	2	8	131026	131033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
512	NC_017950	GAG	2	6	131107	131112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017950	CAT	2	6	131124	131129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017950	CAG	2	6	131182	131187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017950	GA	3	6	131216	131221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017950	ATGACA	2	12	131288	131299	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
517	NC_017950	GGC	2	6	131322	131327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_017950	AGA	2	6	131340	131345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017950	T	6	6	131369	131374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017950	AGG	2	6	131481	131486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017950	TGC	2	6	131490	131495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017950	TCA	3	9	131574	131582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017950	AGCC	2	8	131623	131630	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
524	NC_017950	GAG	2	6	131717	131722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017950	GAG	2	6	131769	131774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017950	GTG	2	6	131777	131782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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530	NC_017950	TTA	2	6	133548	133553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017950	AACT	2	8	136974	136981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
532	NC_017950	AT	3	6	137055	137060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017950	GT	3	6	137062	137067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017950	GGATG	2	10	137127	137136	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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540	NC_017950	A	8	8	139148	139155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017950	CATGA	2	10	140267	140276	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
542	NC_017950	TAC	2	6	140278	140283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_017950	AG	3	6	140388	140393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017950	TTA	2	6	140443	140448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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548	NC_017950	CAA	2	6	140811	140816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017950	TTG	2	6	140831	140836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017950	TCTA	2	8	140945	140952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
551	NC_017950	GTG	2	6	140972	140977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017950	GAAAG	2	10	141686	141695	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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555	NC_017950	AGG	2	6	144151	144156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017950	CTATA	2	10	144604	144613	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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573	NC_017950	TA	3	6	147461	147466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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638	NC_017950	GAC	2	6	157901	157906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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919	NC_017950	GCTG	2	8	254339	254346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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967	NC_017950	A	6	6	265650	265655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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