MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus MN-ZLW-002 chromosome

Total Repeats: 7919

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017927	AACT	2	8	849281	849288	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_017927	TGC	2	6	849326	849331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_017927	TTTGA	2	10	849918	849927	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017927	TA	3	6	849951	849956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017927	TCA	2	6	850247	850252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_017927	TCT	2	6	850313	850318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_017927	CGT	2	6	850350	850355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_017927	ATA	2	6	850361	850366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_017927	TGT	2	6	850387	850392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017927	TTTA	2	8	850399	850406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_017927	CTG	2	6	850473	850478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_017927	GA	3	6	850507	850512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017927	TCGT	2	8	850530	850537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3514	NC_017927	ATT	2	6	850540	850545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_017927	ACG	2	6	850555	850560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_017927	AT	3	6	850567	850572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017927	ATA	2	6	855339	855344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017927	T	7	7	855417	855423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017927	TATC	2	8	855429	855436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3520	NC_017927	ATA	2	6	855468	855473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017927	CAT	2	6	855515	855520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_017927	TAA	2	6	855598	855603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_017927	AGG	2	6	855609	855614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_017927	A	6	6	855644	855649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_017927	TTA	2	6	855811	855816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_017927	AATTT	2	10	856019	856028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_017927	T	6	6	856049	856054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_017927	TGGT	2	8	856412	856419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_017927	T	6	6	856438	856443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_017927	A	6	6	856549	856554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_017927	T	7	7	860389	860395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017927	A	6	6	860401	860406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017927	ATAA	2	8	860438	860445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_017927	TGT	2	6	860723	860728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_017927	GAA	2	6	860783	860788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_017927	TTCT	2	8	860797	860804	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3537	NC_017927	TTCT	2	8	860809	860816	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3538	NC_017927	CAT	2	6	860824	860829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_017927	AAG	4	12	861504	861515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017927	ATC	2	6	861562	861567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_017927	T	6	6	861581	861586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017927	TAT	2	6	861589	861594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_017927	AAT	2	6	861603	861608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_017927	AGA	2	6	862789	862794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_017927	GAAA	2	8	862834	862841	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_017927	ATT	2	6	864003	864008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_017927	TAT	2	6	864011	864016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_017927	TTTA	2	8	864044	864051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_017927	AAAC	2	8	864095	864102	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3550	NC_017927	T	6	6	864123	864128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_017927	ATT	2	6	866762	866767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_017927	TCC	2	6	871744	871749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_017927	TGT	2	6	871754	871759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017927	AT	3	6	871784	871789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_017927	ATTAA	2	10	871803	871812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_017927	A	7	7	873189	873195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_017927	TA	3	6	873241	873246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_017927	ATG	2	6	874255	874260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017927	AAT	2	6	874276	874281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017927	ATT	2	6	874742	874747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_017927	AAC	2	6	876619	876624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_017927	CCT	2	6	876633	876638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_017927	GAA	2	6	876653	876658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017927	ACT	2	6	876667	876672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_017927	AAAG	2	8	876717	876724	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017927	CAG	2	6	876782	876787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3568	NC_017927	GTA	2	6	876987	876992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_017927	CAT	2	6	877001	877006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_017927	TTA	2	6	877009	877014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_017927	GAT	2	6	877037	877042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_017927	ATTT	2	8	877118	877125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_017927	T	6	6	877123	877128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_017927	GAT	2	6	877173	877178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3576	NC_017927	ATC	2	6	877277	877282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3578	NC_017927	TAAG	2	8	877309	877316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_017927	CTT	2	6	877324	877329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3583	NC_017927	TAA	2	6	877592	877597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3586	NC_017927	CTT	2	6	877714	877719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_017927	CAT	2	6	877841	877846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3589	NC_017927	ATG	2	6	877919	877924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_017927	TTACC	2	10	878069	878078	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3592	NC_017927	TGAA	2	8	878195	878202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_017927	A	8	8	878201	878208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_017927	CAA	2	6	878212	878217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3598	NC_017927	TAA	2	6	878946	878951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_017927	A	7	7	878956	878962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3601	NC_017927	T	6	6	879492	879497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_017927	AGT	2	6	879556	879561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_017927	T	6	6	879566	879571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017927	TAGG	2	8	879621	879628	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_017927	AT	3	6	879651	879656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017927	GTTT	2	8	879812	879819	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017927	AAC	2	6	879870	879875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_017927	GAAA	2	8	879940	879947	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_017927	ATC	2	6	879987	879992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3611	NC_017927	AGA	2	6	880047	880052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_017927	CAC	2	6	880097	880102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_017927	ACT	2	6	880114	880119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_017927	AAT	2	6	880185	880190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_017927	TCCA	2	8	880269	880276	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_017927	A	6	6	880310	880315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_017927	AGCT	2	8	881684	881691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_017927	T	6	6	881704	881709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_017927	AGGG	2	8	881721	881728	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_017927	CTA	2	6	884097	884102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3622	NC_017927	A	7	7	884147	884153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_017927	TGTT	2	8	884170	884177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_017927	TAA	2	6	884196	884201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_017927	GA	3	6	884226	884231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_017927	T	6	6	884276	884281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_017927	TA	3	6	884285	884290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_017927	T	6	6	884318	884323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_017927	ATG	2	6	884328	884333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3631	NC_017927	AAT	2	6	884346	884351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_017927	TCA	2	6	884364	884369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_017927	GA	3	6	884397	884402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_017927	AGACA	2	10	884424	884433	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3635	NC_017927	T	6	6	885947	885952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3636	NC_017927	CTA	2	6	885980	885985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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