MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus MN-ZLW-002 chromosome

Total Repeats: 7919

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017927	ATAA	2	8	197982	197989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017927	TGT	2	6	198051	198056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017927	AGA	2	6	198080	198085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017927	ATAAA	2	10	198109	198118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017927	A	8	8	198116	198123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017927	A	10	10	200890	200899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017927	T	6	6	200926	200931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017927	ACA	2	6	201000	201005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017927	GAGT	2	8	201375	201382	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017927	AAGA	2	8	203012	203019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017927	A	7	7	203019	203025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017927	A	7	7	203069	203075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017927	AGA	2	6	203427	203432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017927	TAT	2	6	203672	203677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017927	AATC	2	8	203711	203718	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_017927	ATG	2	6	203745	203750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017927	TCG	2	6	203773	203778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_017927	TAT	2	6	203960	203965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017927	ATT	2	6	204144	204149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017927	ACA	3	9	204150	204158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017927	TAA	2	6	204226	204231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017927	T	6	6	205485	205490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017927	T	11	11	205517	205527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017927	TTAA	2	8	205539	205546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017927	CAT	2	6	205594	205599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017927	TTG	2	6	205603	205608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017927	ATA	2	6	205649	205654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017927	GAT	2	6	205660	205665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017927	TTC	2	6	206123	206128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017927	CAT	2	6	206134	206139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_017927	CAT	2	6	206149	206154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_017927	CTG	2	6	206176	206181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017927	T	7	7	206252	206258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017927	GTTT	2	8	206271	206278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017927	GAAAGA	2	12	206519	206530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017927	AT	3	6	206559	206564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017927	GTG	2	6	206678	206683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017927	A	7	7	206742	206748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017927	TGG	2	6	206752	206757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017927	GAGT	2	8	207287	207294	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017927	AGA	2	6	208198	208203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017927	A	6	6	210624	210629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017927	ACT	2	6	210664	210669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_017927	TAG	2	6	210680	210685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017927	A	6	6	210735	210740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017927	TGCT	2	8	210976	210983	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_017927	T	6	6	210985	210990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017927	TAA	2	6	210995	211000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017927	T	6	6	211035	211040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017927	CATT	2	8	211066	211073	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_017927	AAAG	2	8	211131	211138	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017927	GA	3	6	211752	211757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017927	TCT	2	6	212309	212314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_017927	GA	3	6	212317	212322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017927	T	6	6	212330	212335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017927	A	6	6	212341	212346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017927	GTT	2	6	212405	212410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017927	CCA	2	6	212412	212417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_017927	CTT	2	6	212505	212510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_017927	ATA	2	6	212619	212624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017927	AGT	2	6	212681	212686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017927	AGA	2	6	212702	212707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017927	CTGT	2	8	212708	212715	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_017927	TGG	2	6	212740	212745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017927	TCA	2	6	212768	212773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017927	CAA	2	6	212776	212781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_017927	TAA	2	6	212832	212837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017927	GTTG	2	8	212886	212893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017927	AATCC	2	10	212896	212905	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1070	NC_017927	AGT	2	6	212952	212957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017927	TAA	2	6	212958	212963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017927	ATC	2	6	213010	213015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017927	TAGTA	2	10	214021	214030	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017927	T	6	6	214041	214046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017927	TA	3	6	214048	214053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017927	A	7	7	214061	214067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017927	GA	3	6	214163	214168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017927	TTTG	2	8	216679	216686	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017927	CTAA	2	8	216726	216733	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_017927	TTG	2	6	216746	216751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017927	GGA	2	6	216787	216792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017927	T	6	6	216793	216798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017927	CTT	2	6	216802	216807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_017927	AAG	2	6	216844	216849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017927	AAGA	2	8	216862	216869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017927	TAA	2	6	216882	216887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017927	GCTTT	2	10	216899	216908	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1088	NC_017927	AATC	2	8	216957	216964	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_017927	TTGA	2	8	216986	216993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017927	AGA	2	6	218613	218618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017927	TGGT	2	8	218665	218672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017927	AGT	2	6	218730	218735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017927	TAA	2	6	218864	218869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017927	A	6	6	218871	218876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017927	GGA	2	6	218894	218899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017927	ATAG	2	8	221716	221723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017927	TAA	2	6	221724	221729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017927	AGG	2	6	221738	221743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017927	CTT	2	6	227568	227573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017927	T	7	7	228185	228191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017927	GAA	2	6	228252	228257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017927	AAGT	2	8	228632	228639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017927	AGT	2	6	228681	228686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017927	GCGA	2	8	228737	228744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_017927	TAG	2	6	228770	228775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017927	AACG	2	8	228885	228892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_017927	GAT	2	6	228921	228926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017927	GAAG	2	8	228931	228938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017927	GAACA	2	10	228958	228967	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_017927	CTT	2	6	229017	229022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017927	AAT	2	6	229070	229075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017927	TAA	2	6	229105	229110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017927	CGA	2	6	232168	232173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_017927	T	8	8	232190	232197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017927	ATA	2	6	235435	235440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017927	ATT	2	6	235472	235477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017927	ATC	2	6	235493	235498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017927	GAC	2	6	235535	235540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017927	CGGA	2	8	235556	235563	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_017927	GAT	2	6	237653	237658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017927	GTTAC	2	10	238157	238166	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1122	NC_017927	T	6	6	238201	238206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017927	AGG	2	6	238234	238239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017927	TTAA	2	8	240232	240239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017927	ACT	2	6	240253	240258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_017927	A	6	6	240284	240289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017927	GTA	2	6	240847	240852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017927	T	6	6	240904	240909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017927	T	6	6	240973	240978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017927	TCG	2	6	241291	241296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017927	T	6	6	242672	242677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017927	T	6	6	242701	242706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017927	CAT	2	6	242735	242740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_017927	CCT	2	6	243030	243035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_017927	TTCT	2	8	243044	243051	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_017927	GAT	2	6	243869	243874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1463	NC_017927	A	6	6	345955	345960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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