MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG1

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017766	CGCC	2	8	192	199	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_017766	CGCT	2	8	258	265	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017766	GCAC	2	8	410	417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017766	TCCC	2	8	3234	3241	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_017766	CTGG	2	8	3257	3264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017766	ACCC	2	8	6349	6356	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_017766	CGTC	2	8	6754	6761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017766	TCAC	2	8	6982	6989	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017766	GGGC	2	8	9743	9750	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017766	TCGA	2	8	9783	9790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017766	CCCG	2	8	11819	11826	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_017766	CCAC	2	8	11973	11980	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_017766	GCTT	2	8	14229	14236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017766	CGCC	2	8	14281	14288	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_017766	CCCA	2	8	14301	14308	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_017766	TCGC	2	8	16480	16487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017766	CCGG	2	8	16611	16618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017766	GGGT	2	8	16640	16647	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017766	GCGG	2	8	16739	16746	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017766	ACCA	2	8	16913	16920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017766	CTTC	2	8	17051	17058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017766	GGCA	2	8	18784	18791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017766	CGAC	2	8	23117	23124	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017766	CCCT	2	8	23521	23528	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_017766	GCCG	2	8	23628	23635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017766	GCCG	2	8	32550	32557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017766	CGGA	2	8	32616	32623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017766	GGGC	2	8	32734	32741	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017766	CGGG	3	12	32863	32874	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017766	GGGC	2	8	33459	33466	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017766	GCTC	2	8	34112	34119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017766	CCTA	2	8	34226	34233	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017766	GTCA	2	8	34392	34399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017766	GGGC	2	8	34781	34788	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017766	ACCC	2	8	38113	38120	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_017766	GCTC	2	8	38142	38149	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017766	CGAG	2	8	38715	38722	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017766	CGAG	2	8	40335	40342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017766	AACC	2	8	50356	50363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017766	AGTG	2	8	50718	50725	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017766	ATCG	2	8	51001	51008	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017766	GACC	2	8	51203	51210	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017766	AGTG	2	8	51781	51788	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017766	CTGT	2	8	51899	51906	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017766	CGGT	2	8	52138	52145	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017766	CGAC	2	8	52267	52274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017766	TGGC	2	8	52595	52602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017766	CGTG	2	8	52757	52764	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017766	ATGC	2	8	52869	52876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017766	AGTG	2	8	52974	52981	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017766	AGTG	2	8	55191	55198	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017766	GTGC	2	8	55474	55481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017766	AGTG	2	8	55964	55971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017766	CCGG	2	8	56498	56505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017766	CCTG	2	8	56608	56615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017766	GAAA	2	8	56632	56639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017766	AGTG	2	8	57041	57048	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017766	TTCC	2	8	58932	58939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017766	CGGG	2	8	61885	61892	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017766	CCTT	2	8	62456	62463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017766	TCCT	2	8	66738	66745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017766	GCCG	2	8	67466	67473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017766	GAGG	2	8	68491	68498	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017766	CGGG	2	8	68827	68834	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017766	GCCC	2	8	69288	69295	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_017766	CGGC	2	8	69333	69340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017766	CCGG	2	8	73642	73649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017766	GAAC	2	8	74106	74113	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017766	GAAG	2	8	75587	75594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017766	CCGG	2	8	78269	78276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017766	CGAG	2	8	79211	79218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017766	CGCC	2	8	80120	80127	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_017766	TGCT	2	8	80150	80157	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017766	CGGC	2	8	80214	80221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017766	CCCG	2	8	80222	80229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_017766	GCCA	2	8	84674	84681	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017766	AGCC	2	8	93455	93462	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017766	CCCT	2	8	93463	93470	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_017766	CCGG	2	8	95376	95383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017766	GGCC	2	8	95419	95426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017766	ACCC	2	8	98762	98769	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_017766	GCCA	2	8	102041	102048	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017766	CCCA	2	8	102074	102081	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_017766	CCCG	2	8	102414	102421	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_017766	AGCG	2	8	104849	104856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017766	CCAG	2	8	106305	106312	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017766	CTCG	2	8	106427	106434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017766	GATC	2	8	107811	107818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017766	ACCC	2	8	114358	114365	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_017766	GGGT	2	8	115140	115147	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017766	CGCC	2	8	121714	121721	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_017766	CCCG	2	8	121755	121762	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_017766	CGAA	2	8	125632	125639	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017766	CCGG	2	8	127189	127196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017766	CCTG	2	8	127286	127293	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017766	GCCA	2	8	127339	127346	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017766	CGCC	2	8	127385	127392	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_017766	GCCG	2	8	127750	127757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017766	CCGG	2	8	128253	128260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017766	CATC	2	8	129106	129113	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017766	AGGC	2	8	130984	130991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017766	CGTG	2	8	131007	131014	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017766	ATGC	2	8	131086	131093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017766	CAGA	2	8	133729	133736	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017766	GCCT	2	8	134005	134012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017766	CCGT	2	8	134570	134577	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017766	AGGG	2	8	135743	135750	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017766	CCAG	2	8	135874	135881	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017766	GCGG	2	8	137884	137891	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017766	TGAT	2	8	138047	138054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017766	TCCG	2	8	138265	138272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017766	CCGT	2	8	142249	142256	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017766	CTCG	2	8	143190	143197	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017766	CCCG	2	8	143318	143325	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_017766	CCCG	2	8	144798	144805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_017766	GCCG	2	8	144845	144852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017766	GCCA	2	8	145333	145340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017766	CAGC	2	8	145407	145414	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017766	GCAT	2	8	147594	147601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017766	GTGG	2	8	148073	148080	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017766	GCGG	2	8	148105	148112	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017766	GCAC	2	8	149529	149536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017766	CGGC	2	8	149767	149774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017766	CGCA	2	8	150130	150137	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017766	CCGC	2	8	151780	151787	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_017766	CTCG	2	8	156150	156157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017766	CCCG	2	8	156279	156286	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_017766	TCGG	2	8	156685	156692	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017766	CGGG	2	8	156897	156904	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017766	GGCT	2	8	157170	157177	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017766	TGCA	2	8	157310	157317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017766	GTCC	2	8	164082	164089	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017766	AGCC	2	8	164262	164269	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017766	CCGG	2	8	164354	164361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017766	CGGA	2	8	164415	164422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.