MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 71193 chromosome

Total Repeats: 594

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017673	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017673	GTAGG	2	10	14401	14410	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017673	TTTTA	2	10	22211	22220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017673	TCGAT	2	10	23813	23822	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017673	ATATT	2	10	24351	24360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017673	AAAGT	2	10	42172	42181	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017673	ATTTA	2	10	45947	45956	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017673	TTTTA	2	10	46901	46910	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017673	ATTCA	2	10	52856	52865	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017673	CTAAT	2	10	53705	53714	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017673	CAATT	2	10	54812	54821	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017673	GTAAT	2	10	68806	68815	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017673	TAAAA	2	10	73117	73126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017673	TCATT	2	10	91531	91540	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017673	AAAGC	2	10	136609	136618	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017673	CGTTT	2	10	137828	137837	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017673	TATTC	2	10	146035	146044	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017673	TATCA	2	10	146404	146413	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017673	TAGAG	2	10	159807	159816	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017673	CAACT	2	10	168671	168680	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017673	GCTTT	2	10	173183	173192	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017673	TAACA	2	10	178256	178265	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017673	AATAT	2	10	197650	197659	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017673	TATTT	2	10	203640	203649	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017673	AACAT	2	10	212103	212112	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017673	GATAA	2	10	216040	216049	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017673	ATAAC	2	10	220687	220696	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017673	TGAAT	2	10	220798	220807	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017673	ATTAA	2	10	221753	221762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017673	AAAGT	2	10	225499	225508	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017673	TAAAA	2	10	227211	227220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017673	AAATT	2	10	228528	228537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017673	TAAAA	2	10	243032	243041	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017673	GAAAA	2	10	250824	250833	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017673	ATAAA	2	10	250942	250951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017673	AAATT	2	10	261203	261212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017673	TCATA	2	10	262243	262252	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017673	TGATG	2	10	275235	275244	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017673	ATTTA	2	10	276168	276177	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017673	AATAA	2	10	287036	287045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017673	GATTT	2	10	293128	293137	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017673	TAAAT	2	10	306624	306633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017673	ATTTT	2	10	312181	312190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017673	ATAGA	2	10	318424	318433	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017673	TGACA	2	10	318616	318625	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017673	GATAA	2	10	330918	330927	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017673	TTGAA	2	10	365102	365111	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017673	AGAAT	2	10	365428	365437	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017673	TAAAA	2	10	371493	371502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017673	TAAAT	2	10	374322	374331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017673	AAAAT	2	10	374958	374967	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017673	ACAGT	2	10	376894	376903	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017673	TAAAA	2	10	377391	377400	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017673	CAATT	2	10	385615	385624	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017673	CATAA	2	10	387374	387383	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017673	AATCT	2	10	388752	388761	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017673	ACAGA	2	10	395476	395485	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017673	AAATT	2	10	402645	402654	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017673	CTCAC	2	10	413121	413130	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_017673	CAAAG	2	10	413146	413155	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017673	CTTAA	2	10	430742	430751	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017673	TGGTG	2	10	448562	448571	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017673	TGTGG	2	10	448584	448593	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017673	CAACT	2	10	449128	449137	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017673	GGTAA	2	10	449602	449611	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017673	TCGTG	2	10	450421	450430	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017673	GATTG	2	10	452755	452764	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017673	GATTT	2	10	457739	457748	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017673	ATATA	2	10	460157	460166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017673	CAAAG	2	10	466705	466714	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017673	TTGAT	2	10	469867	469876	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017673	ATGAA	2	10	469938	469947	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017673	AGACA	2	10	483826	483835	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017673	AAGTA	2	10	486262	486271	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017673	GATAA	2	10	488425	488434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017673	GGTAA	2	10	493955	493964	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017673	TCGTG	2	10	494774	494783	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017673	GATTG	2	10	497108	497117	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017673	GGTAA	2	10	499195	499204	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017673	TCGTG	2	10	500014	500023	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017673	GATTG	2	10	502286	502295	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017673	ATATA	2	10	508952	508961	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017673	AAAAT	2	10	513726	513735	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017673	TTTAT	2	10	513835	513844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017673	TTATG	2	10	516841	516850	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017673	ATTTA	2	10	516986	516995	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017673	TGAAT	2	10	523260	523269	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017673	GTATA	2	10	523317	523326	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017673	TATAA	2	10	527034	527043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017673	GAAGC	2	10	548751	548760	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017673	TAAAA	2	10	553448	553457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017673	ATATT	2	10	553530	553539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017673	AATTT	2	10	556581	556590	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017673	AACCA	2	10	560981	560990	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017673	ATAAA	2	10	564860	564869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017673	TTATA	2	10	579239	579248	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017673	AATCA	2	10	579696	579705	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017673	ATGAT	2	10	588687	588696	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017673	TAATT	2	10	592174	592183	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017673	TATTG	2	10	597135	597144	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017673	TAAAT	2	10	601528	601537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017673	AAATT	2	10	603532	603541	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017673	TAAAA	2	10	610722	610731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017673	ATTAA	2	10	612910	612919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017673	TTATT	2	10	612959	612968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017673	CAATA	2	10	613025	613034	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017673	TTAAT	2	10	615651	615660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017673	ATAAA	2	10	624623	624632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017673	TTTTA	2	10	626889	626898	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017673	AAAGG	2	10	627210	627219	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017673	ATATA	2	10	630512	630521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017673	AAACT	2	10	634036	634045	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017673	TTCAC	2	10	639249	639258	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017673	GGTTG	2	10	650232	650241	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017673	AAGTT	2	10	660283	660292	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017673	AATTG	2	10	660315	660324	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017673	ATTTA	2	10	662576	662585	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017673	AAAGT	2	10	664823	664832	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017673	AATTT	2	10	667432	667441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017673	AGAAT	2	10	669374	669383	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017673	CATGA	2	10	669591	669600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017673	ATCAT	2	10	674202	674211	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017673	AATTA	2	10	685894	685903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017673	ATTTA	2	10	690076	690085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017673	AAAGT	2	10	690169	690178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017673	TTTAA	2	10	692781	692790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017673	ATTTT	2	10	702568	702577	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017673	TAAGT	2	10	705589	705598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017673	TAAAA	2	10	708405	708414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017673	GAATA	2	10	708564	708573	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017673	AAAGT	2	10	711343	711352	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017673	TAATA	2	10	724844	724853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017673	CATCC	2	10	727576	727585	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
134	NC_017673	ATATT	2	10	736806	736815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017673	CTTTA	2	10	737893	737902	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017673	TTAAT	2	10	740086	740095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017673	TTTTA	2	10	741638	741647	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017673	AGTTA	2	10	741664	741673	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017673	TCATG	2	10	741843	741852	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017673	TAAAA	2	10	743172	743181	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017673	ATGAT	2	10	747177	747186	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017673	TAAAA	2	10	748449	748458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017673	GTTAA	2	10	753135	753144	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017673	TATAA	2	10	753196	753205	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017673	TTTTA	2	10	755995	756004	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_017673	CAAGA	2	10	758816	758825	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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486	NC_017673	TTACT	2	10	2250970	2250979	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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488	NC_017673	TTACA	2	10	2267494	2267503	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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490	NC_017673	TCACC	2	10	2279778	2279787	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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492	NC_017673	AAATC	2	10	2279917	2279926	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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