MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 plasmid pB182_37

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017624	A	7	7	7	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017624	TTA	2	6	37	42	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017624	TAT	2	6	139	144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017624	TCT	2	6	238	243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017624	CCA	2	6	255	260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017624	A	6	6	731	736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017624	CTATT	2	10	4511	4520	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017624	CTT	2	6	9250	9255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017624	TTCT	2	8	9281	9288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017624	GCT	2	6	9304	9309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017624	ATTTT	2	10	9333	9342	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017624	AGA	2	6	11152	11157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017624	CT	3	6	12605	12610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017624	T	6	6	17154	17159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017624	T	6	6	17228	17233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017624	AG	3	6	17833	17838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017624	TAC	2	6	17864	17869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017624	TTTC	2	8	17929	17936	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017624	T	6	6	17989	17994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017624	AATA	2	8	18073	18080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017624	GCG	2	6	19897	19902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017624	CAA	2	6	19961	19966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017624	TGT	2	6	19984	19989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017624	TACG	2	8	20002	20009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017624	AAGCGC	2	12	20082	20093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017624	AT	3	6	20105	20110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017624	C	6	6	20863	20868	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_017624	TAT	2	6	21268	21273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017624	ATT	2	6	21749	21754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017624	A	6	6	21765	21770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017624	TAT	2	6	22180	22185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017624	TGA	2	6	22250	22255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017624	ATA	2	6	22809	22814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017624	CGC	2	6	22972	22977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017624	TTG	2	6	22997	23002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017624	T	6	6	23116	23121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017624	CGAA	2	8	23152	23159	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017624	ATCA	2	8	23206	23213	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017624	CGC	2	6	23264	23269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017624	A	6	6	23354	23359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017624	TG	3	6	23377	23382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017624	TCC	2	6	23407	23412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017624	T	6	6	23447	23452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017624	T	6	6	23477	23482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017624	T	7	7	23486	23492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017624	TTA	2	6	23495	23500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017624	CTT	2	6	23503	23508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017624	ACTT	2	8	23558	23565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017624	T	6	6	23594	23599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017624	AAT	2	6	23603	23608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017624	GTT	2	6	23624	23629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017624	T	6	6	23628	23633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017624	TGG	2	6	23924	23929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017624	ACT	2	6	24020	24025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017624	TGGC	2	8	24093	24100	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017624	TGAT	2	8	24156	24163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017624	GAA	2	6	24189	24194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017624	ATTCC	2	10	24209	24218	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017624	CAA	2	6	24244	24249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017624	GAA	2	6	24260	24265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017624	TGAAG	2	10	24322	24331	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017624	AT	3	6	24333	24338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017624	ACT	2	6	24391	24396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017624	AAAC	2	8	24455	24462	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017624	A	6	6	24578	24583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017624	GA	3	6	24629	24634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017624	AAG	2	6	24639	24644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017624	CAAG	2	8	24648	24655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017624	AGG	2	6	24677	24682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017624	GAA	2	6	24797	24802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017624	TGG	2	6	24862	24867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017624	GGT	2	6	24868	24873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017624	TTC	2	6	24876	24881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017624	TTTGT	2	10	24911	24920	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017624	TGG	3	9	24953	24961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017624	TG	3	6	24967	24972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017624	TCA	2	6	24973	24978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017624	ATC	2	6	24985	24990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017624	CTG	2	6	25058	25063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017624	GCT	2	6	25081	25086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017624	CAA	2	6	25087	25092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017624	ATG	2	6	25171	25176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017624	CAG	2	6	25182	25187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017624	CCT	2	6	25199	25204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017624	CGC	2	6	25232	25237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017624	GA	3	6	25324	25329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017624	TTA	2	6	25332	25337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017624	T	6	6	25398	25403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017624	CCAG	2	8	25433	25440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017624	CTTT	2	8	25458	25465	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017624	AATT	2	8	25476	25483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017624	AAC	2	6	25520	25525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017624	GGAA	2	8	25570	25577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017624	TCT	2	6	25615	25620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017624	T	6	6	25639	25644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017624	TAT	2	6	26991	26996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017624	CA	3	6	27425	27430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017624	ACC	2	6	27605	27610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017624	TCC	2	6	27644	27649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017624	CTTA	2	8	27674	27681	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017624	TG	3	6	27775	27780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017624	AACTG	2	10	27802	27811	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017624	TGT	2	6	27825	27830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017624	TG	3	6	27838	27843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017624	GTG	2	6	27935	27940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017624	GTG	2	6	28668	28673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017624	TTA	2	6	28714	28719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017624	GGT	2	6	28729	28734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017624	AAG	2	6	28801	28806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017624	GAT	2	6	28828	28833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017624	A	7	7	29180	29186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017624	T	6	6	29192	29197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017624	GATG	2	8	29201	29208	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017624	GGT	2	6	29216	29221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017624	T	6	6	29266	29271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017624	T	7	7	29286	29292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017624	ACA	2	6	29334	29339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017624	A	6	6	29357	29362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017624	T	6	6	29372	29377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017624	CAGGG	2	10	29414	29423	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017624	TGT	2	6	29513	29518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017624	TAA	2	6	29572	29577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017624	GAT	2	6	29617	29622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017624	GCG	2	6	29744	29749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017624	GTT	2	6	30096	30101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017624	CGG	2	6	30127	30132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017624	AAT	2	6	30137	30142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017624	TAT	2	6	30147	30152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017624	A	6	6	30164	30169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017624	CGGA	2	8	30179	30186	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017624	TGGC	2	8	30514	30521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017624	GCCA	2	8	30528	30535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017624	GCG	2	6	30590	30595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017624	TGA	2	6	30621	30626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017624	ATC	2	6	31064	31069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017624	GAA	2	6	31074	31079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017624	GGA	2	6	31611	31616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017624	A	6	6	31660	31665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017624	GAA	2	6	31697	31702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017624	TG	3	6	33612	33617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017624	T	6	6	33759	33764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017624	AAC	2	6	33766	33771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017624	TTG	2	6	33776	33781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017624	A	6	6	33988	33993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017624	GAA	2	6	34080	34085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017624	TCC	2	6	34123	34128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_017624	TCA	2	6	34183	34188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017624	CCA	2	6	34624	34629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_017624	A	6	6	34649	34654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017624	T	7	7	34674	34680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017624	T	6	6	34742	34747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017624	TACT	2	8	34844	34851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_017624	A	6	6	34862	34867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017624	TTA	2	6	37431	37436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017624	TAT	2	6	37533	37538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.