MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 14448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017623	C	6	6	286975	286980	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1002	NC_017623	A	7	7	287004	287010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017623	TGAT	2	8	287122	287129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017623	CCCATA	2	12	288134	288145	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_017623	CCG	3	9	288149	288157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_017623	GAT	2	6	288159	288164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017623	GGC	2	6	288672	288677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017623	CG	3	6	288758	288763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_017623	GAA	2	6	288776	288781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017623	TAAG	2	8	288798	288805	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017623	ATC	2	6	292894	292899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017623	GCG	2	6	294546	294551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_017623	GCA	2	6	294724	294729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017623	CAG	2	6	294764	294769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017623	CGG	2	6	294800	294805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_017623	CA	3	6	294819	294824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_017623	CGGT	2	8	294831	294838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_017623	TG	3	6	294959	294964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017623	GGC	2	6	295113	295118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017623	AGC	2	6	295153	295158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017623	TGC	2	6	295160	295165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017623	ACT	2	6	295227	295232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017623	G	6	6	295275	295280	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017623	TTG	2	6	295325	295330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017623	CGA	2	6	295353	295358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017623	GCA	2	6	295427	295432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017623	GAA	2	6	295486	295491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017623	GGA	2	6	295522	295527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017623	TAA	2	6	295540	295545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017623	AGA	2	6	295569	295574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017623	CAG	2	6	295595	295600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_017623	GAA	2	6	296000	296005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017623	TGC	2	6	296076	296081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017623	GTC	2	6	296088	296093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017623	TTG	2	6	296149	296154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017623	GGA	2	6	296201	296206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017623	TCA	2	6	296226	296231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_017623	AC	3	6	296252	296257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_017623	CGT	2	6	296320	296325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_017623	AC	3	6	296421	296426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_017623	GTAG	2	8	296462	296469	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017623	CCT	2	6	296562	296567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_017623	AAG	2	6	296575	296580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017623	CA	3	6	296597	296602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_017623	TGA	2	6	296610	296615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017623	CGG	2	6	296693	296698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_017623	AAC	2	6	296846	296851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1049	NC_017623	TC	3	6	296868	296873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_017623	GAT	2	6	296889	296894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017623	GCG	2	6	297168	297173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017623	GAG	2	6	297184	297189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017623	TG	3	6	297209	297214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017623	GC	3	6	297236	297241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_017623	G	6	6	297329	297334	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1057	NC_017623	CTGA	2	8	297359	297366	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_017623	GTAC	2	8	297443	297450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_017623	CAC	2	6	297466	297471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1061	NC_017623	AAG	2	6	297550	297555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017623	GTG	2	6	297569	297574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017623	GGA	2	6	297749	297754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017623	AC	3	6	297967	297972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_017623	CGTC	2	8	297985	297992	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_017623	AAC	2	6	298004	298009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_017623	AGC	2	6	298094	298099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_017623	CAT	2	6	298100	298105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1070	NC_017623	TG	3	6	298197	298202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017623	TTG	2	6	298203	298208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017623	GT	3	6	298239	298244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017623	G	6	6	298444	298449	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017623	GT	4	8	298502	298509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1078	NC_017623	GA	3	6	298674	298679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1080	NC_017623	GCTG	2	8	298788	298795	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1088	NC_017623	AGG	2	6	299339	299344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017623	GGT	2	6	299421	299426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017623	CGG	2	6	299508	299513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1095	NC_017623	GT	3	6	299869	299874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_017623	GGC	2	6	300020	300025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_017623	AAGGA	2	10	300031	300040	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017623	TGAC	2	8	300060	300067	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_017623	CGC	2	6	300085	300090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_017623	GGC	2	6	300135	300140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017623	GGT	2	6	300149	300154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017623	GAG	2	6	300324	300329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017623	CCG	2	6	300337	300342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_017623	GCA	2	6	300363	300368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017623	CGCC	2	8	300394	300401	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1108	NC_017623	GAA	2	6	300427	300432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017623	CGTC	2	8	300436	300443	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_017623	CTT	2	6	300452	300457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017623	GT	3	6	300461	300466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017623	AGCGC	2	10	300494	300503	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1113	NC_017623	CCG	2	6	300520	300525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_017623	GCA	2	6	300567	300572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017623	ACT	2	6	300575	300580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017623	TAAAT	2	10	300587	300596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017623	CAA	2	6	300598	300603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017623	CCG	2	6	301202	301207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_017623	T	6	6	302165	302170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017623	TCA	2	6	302187	302192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_017623	ATTTA	2	10	302202	302211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017623	AATTA	2	10	302237	302246	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017623	TTTTGA	2	12	302261	302272	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017623	AGT	2	6	302283	302288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017623	TTCG	2	8	302324	302331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_017623	CAA	2	6	302352	302357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_017623	GAG	2	6	302359	302364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017623	ATG	2	6	302369	302374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017623	TGA	2	6	302395	302400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017623	CAA	2	6	304020	304025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017623	GAA	2	6	304029	304034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017623	GTG	2	6	305388	305393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017623	A	6	6	305406	305411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017623	GCGCT	2	10	308474	308483	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1135	NC_017623	GCC	2	6	308505	308510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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