MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 3086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017622	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017622	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017622	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017622	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017622	ACT	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017622	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017622	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017622	GTT	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017622	GAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017622	AAT	2	6	9764	9769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017622	AGG	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017622	AAC	2	6	13085	13090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017622	CTA	2	6	13646	13651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017622	CAA	2	6	15947	15952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017622	GAA	2	6	16535	16540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017622	ATA	2	6	16623	16628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017622	TAA	2	6	16721	16726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017622	GGC	2	6	17006	17011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017622	GCA	2	6	17325	17330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017622	CGC	2	6	17372	17377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017622	TGT	2	6	17411	17416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017622	AGA	2	6	17420	17425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017622	AGA	2	6	17432	17437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017622	CAG	2	6	17494	17499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017622	GGA	2	6	17684	17689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017622	GAA	2	6	17948	17953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017622	GGT	2	6	18022	18027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017622	GTC	2	6	18036	18041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017622	CAT	2	6	18104	18109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017622	TAA	2	6	18139	18144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017622	GGA	2	6	18148	18153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017622	ATC	2	6	18172	18177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017622	CGC	2	6	18338	18343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017622	CAC	2	6	18383	18388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017622	GAT	2	6	18454	18459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017622	CCT	2	6	18510	18515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017622	TCT	2	6	18545	18550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017622	AGG	2	6	18611	18616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017622	AAC	2	6	18646	18651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017622	GTT	2	6	18656	18661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017622	ATC	2	6	18849	18854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017622	AGT	2	6	18857	18862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017622	ACG	2	6	18987	18992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017622	TAG	2	6	19158	19163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017622	AGG	2	6	19180	19185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017622	GAG	2	6	19193	19198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017622	CTC	2	6	19203	19208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017622	AGA	2	6	19245	19250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017622	TCG	2	6	19348	19353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017622	GGA	2	6	19361	19366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017622	ACA	2	6	19479	19484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017622	ATG	2	6	19546	19551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017622	TAT	2	6	19611	19616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017622	GGA	2	6	19679	19684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017622	ACC	2	6	19945	19950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017622	AAT	2	6	19965	19970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017622	AGC	2	6	20025	20030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017622	AAG	2	6	20162	20167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017622	GAG	2	6	20177	20182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017622	ACA	2	6	20332	20337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017622	GAT	2	6	20736	20741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017622	AGG	2	6	20781	20786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017622	CGG	2	6	20827	20832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017622	TAC	2	6	21097	21102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017622	CCT	2	6	21185	21190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017622	GGT	2	6	21321	21326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017622	TCG	2	6	21436	21441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017622	CGT	2	6	21516	21521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017622	CAG	2	6	21958	21963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017622	AGT	2	6	21984	21989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017622	ACC	2	6	22507	22512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017622	CGT	2	6	22544	22549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017622	CGC	2	6	22937	22942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017622	GGA	2	6	23041	23046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017622	TCC	2	6	23124	23129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017622	TAT	2	6	23134	23139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017622	AGC	2	6	23150	23155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017622	TCG	2	6	23164	23169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017622	CGG	2	6	23276	23281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017622	CGG	2	6	23347	23352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017622	CTA	2	6	23447	23452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017622	AGC	2	6	23464	23469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017622	TCG	2	6	23478	23483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017622	CGG	2	6	23590	23595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017622	TAT	2	6	23638	23643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017622	GGT	2	6	23696	23701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017622	TAA	2	6	25227	25232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017622	GAG	2	6	25288	25293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017622	AGG	2	6	26654	26659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017622	CTT	2	6	27656	27661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017622	TAT	2	6	27684	27689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017622	AAC	2	6	30943	30948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017622	TGT	2	6	30957	30962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017622	AAG	2	6	37054	37059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017622	GGT	2	6	37102	37107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017622	GCA	2	6	37267	37272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017622	GTA	2	6	37342	37347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017622	AGG	2	6	37505	37510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017622	CAG	2	6	37669	37674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017622	GAA	2	6	37786	37791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017622	TCC	2	6	37805	37810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017622	GAA	2	6	37852	37857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017622	GAA	2	6	37942	37947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017622	TCA	2	6	37994	37999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017622	TTA	2	6	43099	43104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017622	AGG	2	6	47078	47083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017622	TAT	2	6	47139	47144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017622	TCG	2	6	47157	47162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017622	GTC	2	6	47165	47170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017622	ATT	2	6	47199	47204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017622	ATT	2	6	47242	47247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017622	AAG	2	6	47249	47254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017622	ATC	2	6	47282	47287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017622	CGC	2	6	47300	47305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017622	GTC	2	6	47307	47312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017622	TAA	3	9	52575	52583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017622	TGA	2	6	52594	52599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017622	TAA	2	6	55630	55635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017622	AAG	2	6	55659	55664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017622	GAA	2	6	56651	56656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017622	GTC	2	6	56732	56737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017622	GAA	2	6	56764	56769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017622	ATT	2	6	56774	56779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017622	ATG	2	6	56804	56809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017622	AAT	2	6	56829	56834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017622	ATG	2	6	56900	56905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017622	AGG	2	6	57021	57026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017622	CAA	2	6	58304	58309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017622	GTT	2	6	58323	58328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017622	AGT	2	6	58454	58459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017622	TGA	2	6	58661	58666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017622	TAT	2	6	58733	58738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017622	GAT	2	6	58807	58812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017622	TTC	2	6	58858	58863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017622	AGG	2	6	59801	59806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017622	ATA	2	6	61191	61196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017622	GAA	2	6	61216	61221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017622	ATG	2	6	65647	65652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017622	AAT	2	6	65871	65876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017622	AGG	2	6	66752	66757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_017622	TCT	2	6	221155	221160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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