MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 6122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017622	T	6	6	261824	261829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017622	GCTG	2	8	261838	261845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_017622	A	6	6	261853	261858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017622	AGG	2	6	262696	262701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017622	GGAA	2	8	262716	262723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017622	ACC	2	6	264207	264212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_017622	AGC	2	6	264251	264256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017622	ACC	2	6	264327	264332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_017622	CCG	2	6	264401	264406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_017622	TAA	2	6	264438	264443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017622	TA	3	6	264870	264875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017622	A	6	6	265078	265083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017622	TGT	2	6	265118	265123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017622	TCC	2	6	265481	265486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_017622	T	6	6	265567	265572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017622	GTAAA	2	10	265573	265582	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017622	T	7	7	265596	265602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017622	T	6	6	265606	265611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017622	AGG	2	6	265642	265647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017622	GAA	2	6	265700	265705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017622	GCT	2	6	267038	267043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017622	TTTTA	2	10	267047	267056	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017622	A	6	6	267063	267068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017622	CTT	2	6	267087	267092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_017622	CCT	2	6	268145	268150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_017622	GTT	2	6	268191	268196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017622	AGG	2	6	268246	268251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017622	TAC	2	6	268288	268293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017622	A	7	7	268303	268309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017622	AGAA	2	8	268360	268367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017622	A	6	6	268523	268528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017622	TAG	2	6	268529	268534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017622	GGA	2	6	268579	268584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017622	TAGG	2	8	271393	271400	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017622	AGT	2	6	271401	271406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017622	TTGT	2	8	271498	271505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017622	TGG	2	6	271516	271521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017622	TCTA	2	8	271583	271590	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_017622	TAGAA	2	10	271619	271628	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017622	A	6	6	271627	271632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017622	T	6	6	271637	271642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017622	ATTT	2	8	273145	273152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017622	GTTT	2	8	273178	273185	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017622	TTAAA	2	10	273198	273207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017622	TA	3	6	273237	273242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017622	TA	3	6	280649	280654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017622	AAC	2	6	280678	280683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_017622	GT	3	6	280737	280742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017622	TAG	2	6	280769	280774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017622	AG	3	6	284939	284944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017622	CAA	2	6	284967	284972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017622	A	6	6	284984	284989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017622	AAAG	2	8	288532	288539	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017622	CAAC	2	8	288555	288562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_017622	ATA	2	6	288565	288570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017622	TAGAAA	2	12	288603	288614	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017622	TAGCCG	2	12	288642	288653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_017622	AGA	2	6	288657	288662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017622	AT	3	6	288741	288746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017622	AGA	2	6	288755	288760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017622	GA	3	6	289038	289043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017622	T	6	6	290417	290422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017622	GGA	2	6	291170	291175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017622	T	8	8	291184	291191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017622	CCA	2	6	291200	291205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_017622	T	6	6	291255	291260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017622	T	6	6	291283	291288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017622	A	6	6	293052	293057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017622	TTC	2	6	294967	294972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_017622	CTC	2	6	294990	294995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_017622	GCCTA	2	10	295026	295035	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1072	NC_017622	T	6	6	295077	295082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017622	ATT	2	6	295130	295135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017622	TAA	2	6	295139	295144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017622	GAAAG	2	10	295211	295220	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017622	TAT	2	6	295260	295265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017622	TG	3	6	295298	295303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017622	ACT	2	6	296557	296562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_017622	CTTT	2	8	296702	296709	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_017622	A	6	6	296715	296720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017622	T	6	6	299093	299098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017622	ATT	2	6	299106	299111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017622	TGG	2	6	299148	299153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017622	A	6	6	299171	299176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017622	GTCA	2	8	300122	300129	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_017622	GGTT	2	8	300851	300858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017622	ATG	2	6	300914	300919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017622	T	6	6	300933	300938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017622	T	6	6	300952	300957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017622	ATT	3	9	301720	301728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017622	ATA	2	6	301737	301742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017622	ATT	2	6	301754	301759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017622	AAT	2	6	301767	301772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017622	T	7	7	301789	301795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017622	A	7	7	301796	301802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017622	AAT	2	6	301804	301809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017622	CAC	2	6	301905	301910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_017622	GAT	2	6	301947	301952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017622	AAG	2	6	301953	301958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017622	GAT	2	6	301980	301985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017622	TGA	2	6	301994	301999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017622	AG	3	6	302016	302021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017622	CATAG	2	10	302103	302112	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1104	NC_017622	CGT	2	6	302141	302146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017622	CAG	2	6	302204	302209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017622	TTTC	2	8	302321	302328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_017622	GCT	2	6	302342	302347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017622	CCA	2	6	302372	302377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_017622	CCA	2	6	302387	302392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_017622	CAT	2	6	302396	302401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017622	CAG	2	6	302465	302470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_017622	CCA	2	6	302543	302548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_017622	TCT	2	6	302566	302571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_017622	AAC	2	6	302661	302666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017622	TGT	2	6	302774	302779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017622	GAA	3	9	302855	302863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017622	CCCAG	2	10	302931	302940	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1118	NC_017622	AGG	2	6	302954	302959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017622	ACC	3	9	302972	302980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_017622	CCG	2	6	303143	303148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_017622	GCCA	2	8	303160	303167	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_017622	TGA	2	6	303228	303233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017622	AGG	2	6	303275	303280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017622	TCA	2	6	303363	303368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_017622	AGC	2	6	303370	303375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_017622	T	7	7	303390	303396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017622	TTC	2	6	303406	303411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017622	AGA	2	6	303418	303423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017622	GAAGAT	2	12	303430	303441	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017622	TCCA	2	8	303455	303462	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_017622	AGC	2	6	303487	303492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017622	GACA	2	8	303511	303518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_017622	CCTT	2	8	303548	303555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_017622	TGA	2	6	303672	303677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017622	TGT	2	6	303686	303691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017622	GGTT	2	8	303696	303703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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