MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017621	TA	3	6	2732	2737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017621	TA	3	6	16582	16587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017621	AT	3	6	17745	17750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017621	CT	3	6	17776	17781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017621	AC	3	6	18266	18271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017621	AC	3	6	18435	18440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017621	AG	3	6	19227	19232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017621	CT	3	6	19341	19346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017621	TC	3	6	19719	19724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017621	GA	3	6	20261	20266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017621	GA	3	6	20557	20562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017621	CT	3	6	20673	20678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017621	GA	3	6	20880	20885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017621	GA	3	6	21695	21700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017621	TA	3	6	22898	22903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017621	AT	3	6	22989	22994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017621	AT	3	6	23515	23520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017621	GA	3	6	24911	24916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017621	AT	3	6	26290	26295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017621	TG	3	6	30617	30622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017621	AG	3	6	34462	34467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017621	TG	3	6	36925	36930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017621	AT	3	6	47932	47937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017621	TA	3	6	48281	48286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017621	TA	3	6	48380	48385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017621	AT	3	6	48453	48458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017621	AC	3	6	50047	50052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017621	TA	3	6	57660	57665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017621	AT	3	6	61406	61411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017621	AC	3	6	66420	66425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017621	GT	3	6	70328	70333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017621	GA	3	6	81212	81217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017621	TG	3	6	81571	81576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017621	AG	3	6	86923	86928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017621	TA	3	6	89759	89764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017621	AT	3	6	90824	90829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017621	CT	3	6	90855	90860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017621	AC	3	6	91345	91350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017621	AC	3	6	91514	91519	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017621	AG	3	6	92306	92311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017621	CT	3	6	92420	92425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017621	TC	3	6	92798	92803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017621	GA	3	6	93340	93345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017621	GA	3	6	93636	93641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017621	CT	3	6	93752	93757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017621	GA	3	6	93959	93964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017621	GA	3	6	94774	94779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017621	GA	3	6	95684	95689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017621	CT	4	8	95753	95760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017621	TA	3	6	99176	99181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017621	GT	3	6	105086	105091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017621	TA	3	6	106527	106532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017621	AC	3	6	106618	106623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017621	GT	3	6	114890	114895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017621	TA	3	6	115067	115072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017621	TG	3	6	115411	115416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017621	TG	3	6	115615	115620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017621	TG	3	6	115819	115824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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60	NC_017621	AT	4	8	123698	123705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017621	AT	3	6	131202	131207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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65	NC_017621	AG	3	6	134480	134485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017621	TC	3	6	141516	141521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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68	NC_017621	TA	3	6	141610	141615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017621	AG	3	6	145114	145119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017621	AT	4	8	145247	145254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017621	TA	3	6	145381	145386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017621	AT	3	6	156473	156478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017621	TA	3	6	156567	156572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017621	GT	3	6	164554	164559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017621	AG	3	6	164724	164729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017621	AG	3	6	165438	165443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017621	TC	3	6	167776	167781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017621	TA	3	6	173321	173326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017621	GA	3	6	173409	173414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017621	AG	3	6	182274	182279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017621	AG	3	6	182380	182385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017621	TA	4	8	193052	193059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017621	TG	3	6	209075	209080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017621	AT	3	6	210856	210861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017621	GT	3	6	211442	211447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_017621	CT	3	6	215333	215338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017621	GA	3	6	217154	217159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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91	NC_017621	AT	5	10	228871	228880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017621	TA	3	6	229758	229763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017621	AT	3	6	229847	229852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017621	GA	3	6	235301	235306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017621	AG	4	8	242795	242802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017621	CT	3	6	242814	242819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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98	NC_017621	AT	3	6	244080	244085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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101	NC_017621	TA	3	6	254360	254365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017621	TA	3	6	254377	254382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_017621	GA	3	6	258665	258670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_017621	AG	3	6	277795	277800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_017621	TA	3	6	280732	280737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017621	AT	3	6	283773	283778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_017621	AG	3	6	288422	288427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017621	GA	3	6	292521	292526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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118	NC_017621	AT	3	6	294700	294705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017621	TA	3	6	299007	299012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017621	TG	3	6	299081	299086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017621	GT	3	6	302837	302842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017621	TA	3	6	302995	303000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017621	GT	4	8	303987	303994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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125	NC_017621	AG	3	6	316387	316392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017621	AG	3	6	317128	317133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_017621	TA	4	8	338488	338495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017621	AT	3	6	338762	338767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017621	AT	3	6	340183	340188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017621	TA	3	6	340517	340522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017621	GA	3	6	341065	341070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017621	AT	3	6	341917	341922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_017621	AC	3	6	342607	342612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017621	AG	3	6	343399	343404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017621	CT	3	6	343513	343518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017621	TC	3	6	343891	343896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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144	NC_017621	GA	3	6	344729	344734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_017621	GA	3	6	345052	345057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_017621	TC	3	6	348571	348576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017621	AT	4	8	348596	348603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017621	CT	3	6	348910	348915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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