MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 3584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017621	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017621	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017621	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017621	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017621	CTG	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017621	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017621	ATT	2	6	4323	4328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017621	ATT	2	6	4337	4342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017621	TTC	2	6	5564	5569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017621	GTT	2	6	5570	5575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017621	GAT	2	6	5649	5654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017621	AAT	2	6	9796	9801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017621	AGG	2	6	10557	10562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017621	AAC	2	6	13117	13122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017621	CTA	2	6	13678	13683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017621	TAT	2	6	13684	13689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017621	ATT	2	6	13733	13738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017621	ATT	2	6	13742	13747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017621	AGT	2	6	13822	13827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017621	ATA	2	6	13842	13847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017621	TTC	2	6	14144	14149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017621	ATG	4	12	14150	14161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017621	GTG	2	6	14169	14174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017621	GTG	2	6	14181	14186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017621	GAA	2	6	14270	14275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017621	GTT	2	6	14294	14299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017621	CAG	2	6	14349	14354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017621	CTA	2	6	14360	14365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017621	TCC	2	6	14371	14376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017621	TTC	2	6	14432	14437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017621	TTG	2	6	14457	14462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017621	ATT	2	6	14500	14505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017621	GCA	2	6	14522	14527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017621	ATT	2	6	14534	14539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017621	GTG	2	6	14611	14616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017621	ACG	2	6	14635	14640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017621	ATT	2	6	14703	14708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017621	CTT	2	6	14751	14756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017621	GAA	2	6	14837	14842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017621	AGC	2	6	14852	14857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017621	TAG	2	6	14875	14880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017621	CAA	2	6	14883	14888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017621	TTG	2	6	14899	14904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017621	AGC	2	6	14933	14938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017621	AGA	2	6	14996	15001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017621	AGA	2	6	15185	15190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017621	CTT	2	6	15198	15203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017621	AGA	2	6	15209	15214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017621	GGT	2	6	15243	15248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017621	GAA	2	6	15258	15263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017621	ATT	2	6	15264	15269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017621	TGG	2	6	15401	15406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017621	CAA	2	6	15488	15493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017621	ATT	2	6	15504	15509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017621	TGA	3	9	15629	15637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017621	AGT	2	6	15691	15696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017621	CAA	2	6	16013	16018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017621	AGA	2	6	16601	16606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017621	GAT	2	6	16689	16694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017621	AGA	2	6	16774	16779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017621	AGA	2	6	16928	16933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017621	GGC	2	6	17073	17078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017621	GCA	2	6	17392	17397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017621	CGC	2	6	17439	17444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017621	TGT	2	6	17478	17483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017621	AGA	2	6	17487	17492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017621	AGA	2	6	17499	17504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017621	CAG	2	6	17561	17566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017621	GGA	2	6	17751	17756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017621	GAA	2	6	18015	18020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017621	GGT	2	6	18089	18094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017621	GTC	2	6	18103	18108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017621	CAT	2	6	18171	18176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017621	TAA	2	6	18206	18211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017621	GGA	2	6	18215	18220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017621	ATC	2	6	18239	18244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017621	CGC	2	6	18405	18410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017621	CAC	2	6	18450	18455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017621	GAT	2	6	18521	18526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017621	CCT	2	6	18577	18582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017621	TCT	2	6	18612	18617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017621	AGG	2	6	18678	18683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017621	AAC	2	6	18713	18718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017621	GTT	2	6	18723	18728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017621	TAA	2	6	18871	18876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017621	ACG	2	6	18941	18946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017621	TAG	2	6	19112	19117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017621	GAG	2	6	19147	19152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017621	CTC	2	6	19157	19162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017621	AGA	2	6	19199	19204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017621	TCG	2	6	19302	19307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017621	GGA	2	6	19315	19320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017621	ACA	2	6	19433	19438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017621	ATG	2	6	19500	19505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017621	TAT	2	6	19565	19570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017621	GGA	2	6	19633	19638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017621	ACC	2	6	19899	19904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017621	AAT	2	6	19919	19924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017621	AGC	2	6	19979	19984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017621	TGG	2	6	20110	20115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017621	AAG	2	6	20116	20121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017621	GAG	2	6	20131	20136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017621	ACA	2	6	20287	20292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017621	GAT	2	6	20691	20696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017621	AGG	2	6	20736	20741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017621	CGG	2	6	20782	20787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017621	TAC	2	6	21052	21057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017621	CCT	2	6	21140	21145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017621	GGT	2	6	21276	21281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017621	TCG	2	6	21391	21396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017621	CGT	2	6	21471	21476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017621	AGT	2	6	21862	21867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017621	CAG	2	6	21913	21918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017621	AGT	2	6	21939	21944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017621	CGT	2	6	22499	22504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017621	CGC	2	6	22892	22897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017621	GGA	2	6	22996	23001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017621	TCC	2	6	23079	23084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017621	CTA	2	6	23089	23094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017621	AGC	2	6	23106	23111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017621	TCG	2	6	23120	23125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017621	CGG	2	6	23232	23237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017621	TAT	2	6	23280	23285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017621	GGT	2	6	23338	23343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017621	TAA	2	6	24869	24874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017621	GAG	2	6	24930	24935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017621	AGG	2	6	26296	26301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017621	CTT	2	6	27298	27303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017621	TAT	2	6	27326	27331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017621	TGT	2	6	30599	30604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017621	GAA	2	6	31415	31420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017621	ATG	2	6	31516	31521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017621	GGA	2	6	31532	31537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017621	CAG	2	6	31679	31684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017621	GTC	2	6	31711	31716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017621	AGG	2	6	31717	31722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017621	GGT	2	6	31758	31763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017621	GAA	2	6	31770	31775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017621	GCT	2	6	31782	31787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017621	ATT	2	6	31795	31800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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