MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 7045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017621	TTAT	2	8	2164483	2164490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_017621	TTCT	2	8	2165591	2165598	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7003	NC_017621	CTTTT	2	10	2167281	2167290	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7004	NC_017621	T	6	6	2169887	2169892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_017621	A	6	6	2169905	2169910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_017621	AAG	2	6	2170040	2170045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_017621	AAG	2	6	2170149	2170154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_017621	A	6	6	2170170	2170175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_017621	TTG	2	6	2170204	2170209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_017621	A	6	6	2170245	2170250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_017621	TAAG	2	8	2170262	2170269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_017621	T	6	6	2170274	2170279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_017621	AGT	2	6	2173077	2173082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_017621	AGT	2	6	2173103	2173108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_017621	T	6	6	2174169	2174174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_017621	TTAGC	2	10	2174177	2174186	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7017	NC_017621	T	6	6	2174281	2174286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_017621	GT	3	6	2174287	2174292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_017621	CA	3	6	2174318	2174323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7020	NC_017621	ATAC	2	8	2174327	2174334	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7021	NC_017621	TGA	2	6	2174366	2174371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_017621	TGA	2	6	2175946	2175951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_017621	GA	3	6	2176125	2176130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_017621	TAT	2	6	2177414	2177419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_017621	T	7	7	2178973	2178979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_017621	ATT	2	6	2179002	2179007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_017621	T	6	6	2179026	2179031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_017621	GTA	2	6	2179048	2179053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_017621	A	6	6	2179103	2179108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_017621	CAT	2	6	2179170	2179175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_017621	GAA	2	6	2179214	2179219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_017621	CCG	2	6	2179250	2179255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7033	NC_017621	TTTG	2	8	2179328	2179335	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_017621	T	6	6	2179344	2179349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_017621	T	6	6	2179352	2179357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_017621	TAAAA	2	10	2179387	2179396	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_017621	CTG	2	6	2179466	2179471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_017621	AAT	2	6	2180665	2180670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_017621	GATT	2	8	2180769	2180776	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_017621	AAGA	2	8	2180800	2180807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_017621	T	8	8	2182069	2182076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_017621	AGAATA	2	12	2182080	2182091	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_017621	ATTT	2	8	2182869	2182876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_017621	ATT	2	6	2182903	2182908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_017621	T	6	6	2183011	2183016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.