MICAS: Microsatellite Analysis Server

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017619	TA	3	6	2732	2737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017619	AT	3	6	17679	17684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017619	CT	3	6	17710	17715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017619	AC	3	6	18200	18205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017619	AC	3	6	18369	18374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017619	AG	3	6	19274	19279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017619	CT	3	6	19388	19393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017619	TC	3	6	19766	19771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017619	TG	3	6	20157	20162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017619	GA	3	6	20308	20313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017619	GA	3	6	20604	20609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017619	CT	3	6	20720	20725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017619	GA	3	6	20927	20932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017619	GA	3	6	21742	21747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017619	TA	3	6	22945	22950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017619	AT	3	6	23036	23041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017619	AT	3	6	23562	23567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017619	GA	3	6	24958	24963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017619	AT	3	6	26337	26342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017619	TG	3	6	30664	30669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017619	AC	3	6	46653	46658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017619	TA	3	6	52810	52815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017619	TC	3	6	55296	55301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017619	AT	3	6	55464	55469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017619	CT	3	6	56782	56787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017619	CA	3	6	58477	58482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017619	GT	3	6	68979	68984	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017619	GA	3	6	78841	78846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017619	CA	3	6	79235	79240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017619	CA	3	6	79317	79322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017619	AG	3	6	84666	84671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017619	AT	3	6	88567	88572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017619	CT	3	6	88598	88603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017619	AC	3	6	89088	89093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017619	AC	3	6	89257	89262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017619	AG	3	6	90162	90167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017619	CT	3	6	90276	90281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017619	TC	3	6	90654	90659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017619	TG	3	6	91045	91050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017619	GA	3	6	91196	91201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017619	GA	3	6	91492	91497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017619	CT	3	6	91608	91613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017619	GA	3	6	91815	91820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017619	GA	3	6	92630	92635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017619	GA	3	6	93544	93549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017619	CT	4	8	93613	93620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017619	TA	3	6	98480	98485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017619	TA	3	6	100102	100107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50	NC_017619	TA	3	6	110585	110590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017619	TG	3	6	110800	110805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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53	NC_017619	AT	4	8	118456	118463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017619	AT	3	6	119236	119241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57	NC_017619	AG	3	6	126777	126782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017619	AG	3	6	129306	129311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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60	NC_017619	AC	3	6	136117	136122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017619	TA	3	6	136166	136171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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67	NC_017619	GA	3	6	160143	160148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_017619	AT	3	6	182978	182983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73	NC_017619	AT	4	8	205779	205786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017619	AT	3	6	207433	207438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017619	AT	3	6	209384	209389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017619	GA	3	6	209422	209427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017619	TC	3	6	209432	209437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017619	TG	3	6	217198	217203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017619	AT	3	6	218694	218699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017619	CT	4	8	220455	220462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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83	NC_017619	TA	3	6	230934	230939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_017619	AT	3	6	253087	253092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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92	NC_017619	TA	3	6	264217	264222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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98	NC_017619	GA	3	6	288385	288390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_017619	TA	3	6	325339	325344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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105	NC_017619	AT	3	6	325708	325713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017619	AT	3	6	327130	327135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_017619	AG	3	6	327647	327652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017619	TA	3	6	327698	327703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017619	AT	3	6	328763	328768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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114	NC_017619	AC	3	6	329453	329458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017619	AG	3	6	330358	330363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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118	NC_017619	TG	3	6	331241	331246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017619	GA	3	6	331392	331397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017619	GA	3	6	331688	331693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017619	CT	3	6	331804	331809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017619	GA	3	6	332011	332016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017619	GA	3	6	332826	332831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017619	AC	3	6	335439	335444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017619	GA	3	6	338424	338429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017619	TA	3	6	340932	340937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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134	NC_017619	AT	3	6	360328	360333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017619	TA	3	6	366420	366425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017619	TA	3	6	380211	380216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_017619	TA	3	6	385279	385284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017619	AT	3	6	387943	387948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017619	TA	3	6	401780	401785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_017619	TA	3	6	421829	421834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017619	AT	3	6	422804	422809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_017619	AC	3	6	423494	423499	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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