MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 5788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_017619	TAAGAT	2	12	137200	137211	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017619	GAAGC	2	10	137246	137255	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
504	NC_017619	CAAT	2	8	137267	137274	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_017619	T	6	6	137397	137402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017619	TCTA	2	8	139727	139734	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
507	NC_017619	ACCT	2	8	139736	139743	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_017619	T	7	7	139755	139761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017619	ACG	2	6	139765	139770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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511	NC_017619	AGT	2	6	139905	139910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017619	CGA	2	6	139927	139932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017619	AAAC	2	8	140152	140159	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_017619	TA	3	6	140173	140178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017619	A	6	6	140236	140241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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517	NC_017619	ACT	2	6	140354	140359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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520	NC_017619	AAAT	2	8	140483	140490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017619	ATT	2	6	140498	140503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017619	TTTG	2	8	140513	140520	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017619	A	6	6	140532	140537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017619	ATAG	2	8	140549	140556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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526	NC_017619	AGT	2	6	140615	140620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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531	NC_017619	A	6	6	142791	142796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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551	NC_017619	AGG	2	6	146253	146258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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558	NC_017619	GTA	2	6	150818	150823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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560	NC_017619	A	6	6	150854	150859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017619	GTCT	2	8	150875	150882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
562	NC_017619	GT	3	6	151062	151067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_017619	TCA	2	6	171101	171106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017619	AGT	2	6	171111	171116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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609	NC_017619	GAAA	2	8	171298	171305	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017619	GTAG	2	8	171306	171313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017619	CATTG	2	10	172743	172752	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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620	NC_017619	T	6	6	179254	179259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017619	TTCA	2	8	179266	179273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
622	NC_017619	TGA	2	6	179297	179302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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625	NC_017619	TATAA	2	10	181663	181672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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628	NC_017619	A	6	6	182936	182941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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630	NC_017619	AAT	3	9	182971	182979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017619	AT	3	6	182978	182983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017619	ATA	2	6	184567	184572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017619	GTT	2	6	184651	184656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017619	TTGAT	2	10	184660	184669	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017619	TGATTT	2	12	184810	184821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017619	T	6	6	187111	187116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017619	ATA	2	6	187120	187125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017619	TAT	2	6	187138	187143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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