MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 5788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017619	A	7	7	1965901	1965907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017619	T	6	6	1967929	1967934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_017619	TAT	2	6	1967948	1967953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_017619	AAAT	2	8	1967993	1968000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_017619	AGT	2	6	1968048	1968053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_017619	CTC	2	6	1968094	1968099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5507	NC_017619	AG	3	6	1968114	1968119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017619	TCC	2	6	1969228	1969233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_017619	CAA	2	6	1969275	1969280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_017619	A	8	8	1969279	1969286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017619	TCC	2	6	1971024	1971029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_017619	CCCGT	2	10	1971037	1971046	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5513	NC_017619	TAA	2	6	1971078	1971083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017619	TTA	2	6	1971084	1971089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_017619	ATT	2	6	1971101	1971106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_017619	TACAT	2	10	1971115	1971124	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5517	NC_017619	TCA	2	6	1971769	1971774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_017619	T	7	7	1971827	1971833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_017619	CA	3	6	1971834	1971839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_017619	T	6	6	1974094	1974099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_017619	GGGA	2	8	1974620	1974627	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_017619	TATTT	2	10	1974941	1974950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_017619	T	6	6	1976449	1976454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_017619	TAT	2	6	1976474	1976479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_017619	TCC	2	6	1976576	1976581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5526	NC_017619	TAA	2	6	1976607	1976612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_017619	AATA	2	8	1976615	1976622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5529	NC_017619	GGTT	2	8	1976655	1976662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_017619	AACC	2	8	1976666	1976673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_017619	TCT	2	6	1976674	1976679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5533	NC_017619	CTC	2	6	1983076	1983081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5534	NC_017619	ATAA	2	8	1983085	1983092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_017619	TA	3	6	1983114	1983119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_017619	CTA	2	6	1983178	1983183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_017619	AATA	2	8	1983198	1983205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_017619	CTT	2	6	1983213	1983218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_017619	A	7	7	1983243	1983249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_017619	CTC	2	6	1984200	1984205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5542	NC_017619	TTA	2	6	1984276	1984281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017619	TA	3	6	1984280	1984285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017619	TATT	2	8	1984287	1984294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017619	TA	3	6	1984417	1984422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017619	A	6	6	1984445	1984450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5549	NC_017619	AT	3	6	1986855	1986860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017619	T	6	6	1986860	1986865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_017619	A	7	7	1986907	1986913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_017619	CTAT	2	8	1987581	1987588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5553	NC_017619	AG	3	6	1987608	1987613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_017619	A	7	7	1987686	1987692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_017619	TAGTGT	2	12	1987723	1987734	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017619	ATT	2	6	1987736	1987741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017619	AAACC	2	10	1987775	1987784	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5558	NC_017619	T	6	6	1989278	1989283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017619	A	6	6	1990390	1990395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_017619	CTC	2	6	1990396	1990401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5563	NC_017619	TCCC	2	8	1996367	1996374	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5564	NC_017619	TCT	2	6	1996378	1996383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_017619	TTA	2	6	1996393	1996398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5601	NC_017619	A	6	6	2008235	2008240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5605	NC_017619	ACT	2	6	2011228	2011233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5607	NC_017619	TTTC	2	8	2011281	2011288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5608	NC_017619	TTG	2	6	2011295	2011300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5613	NC_017619	T	6	6	2013867	2013872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_017619	T	6	6	2013880	2013885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_017619	CT	3	6	2013897	2013902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5616	NC_017619	TTTATA	2	12	2013956	2013967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5622	NC_017619	T	7	7	2014726	2014732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_017619	AAC	2	6	2014737	2014742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_017619	CTTTT	2	10	2017203	2017212	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5625	NC_017619	TAT	2	6	2017230	2017235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5631	NC_017619	AG	3	6	2017771	2017776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_017619	TAA	2	6	2018640	2018645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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