MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis JS14 chromosome

Total Repeats: 6460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_017618	CCT	2	6	1986548	1986553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_017618	TCC	2	6	1987566	1987571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_017618	A	6	6	1987572	1987577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_017618	ACA	2	6	1987584	1987589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_017618	TA	6	12	1987594	1987605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_017618	A	7	7	1987627	1987633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6009	NC_017618	TAT	2	6	1987662	1987667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_017618	TAA	2	6	1988430	1988435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_017618	TCC	2	6	1989830	1989835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_017618	ATA	2	6	1989847	1989852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017618	T	7	7	1989871	1989877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_017618	ATTT	2	8	1989898	1989905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6018	NC_017618	TCC	2	6	1990633	1990638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_017618	CACG	2	8	1990651	1990658	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_017618	TAT	2	6	1991246	1991251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_017618	CTT	2	6	1991281	1991286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_017618	GCT	2	6	1991292	1991297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_017618	AATC	2	8	1991303	1991310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6024	NC_017618	ACT	2	6	1991315	1991320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_017618	CA	3	6	1991331	1991336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6026	NC_017618	TTTC	2	8	1991337	1991344	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6031	NC_017618	TAT	2	6	1993520	1993525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6039	NC_017618	A	8	8	1994851	1994858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6049	NC_017618	T	6	6	1999666	1999671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6102	NC_017618	ATC	2	6	2021018	2021023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6104	NC_017618	T	7	7	2021179	2021185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_017618	CATAT	2	10	2021192	2021201	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6106	NC_017618	TTGG	2	8	2021250	2021257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6110	NC_017618	TTTG	2	8	2021427	2021434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_017618	GCT	2	6	2021454	2021459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_017618	TGCT	2	8	2021471	2021478	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6113	NC_017618	T	7	7	2021521	2021527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_017618	GATAAT	2	12	2021626	2021637	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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6125	NC_017618	TCT	2	6	2023558	2023563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6129	NC_017618	TAT	2	6	2026251	2026256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_017618	TCTT	2	8	2028229	2028236	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6131	NC_017618	TAA	2	6	2028245	2028250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_017618	A	6	6	2028252	2028257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_017618	TCC	2	6	2030728	2030733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6135	NC_017618	TAAGAT	2	12	2030812	2030823	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_017618	CAA	2	6	2030831	2030836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6137	NC_017618	CTTC	2	8	2030911	2030918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6138	NC_017618	TAC	2	6	2030990	2030995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6141	NC_017618	ATC	2	6	2031057	2031062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6144	NC_017618	TA	3	6	2032239	2032244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6145	NC_017618	A	7	7	2032258	2032264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6146	NC_017618	T	6	6	2032289	2032294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6150	NC_017618	AAAT	2	8	2033012	2033019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6151	NC_017618	TC	4	8	2034072	2034079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6168	NC_017618	AACG	2	8	2038498	2038505	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6401	NC_017618	CTT	2	6	2118235	2118240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6402	NC_017618	TTC	2	6	2118271	2118276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6422	NC_017618	A	6	6	2124732	2124737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6426	NC_017618	A	7	7	2124831	2124837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6434	NC_017618	CGT	2	6	2126566	2126571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6435	NC_017618	A	7	7	2126582	2126588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6452	NC_017618	T	6	6	2133728	2133733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6453	NC_017618	TAAAA	2	10	2133763	2133772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6459	NC_017618	ATTT	2	8	2137245	2137252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6460	NC_017618	T	6	6	2137387	2137392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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