MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis JS14 chromosome

Total Repeats: 6460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017618	TCA	2	6	1817812	1817817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_017618	A	7	7	1817837	1817843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_017618	TAA	2	6	1817888	1817893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_017618	AGA	2	6	1820243	1820248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_017618	TTAC	2	8	1820252	1820259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5506	NC_017618	T	7	7	1820279	1820285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_017618	A	8	8	1820291	1820298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017618	CTTT	2	8	1820571	1820578	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5509	NC_017618	T	6	6	1820576	1820581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017618	T	6	6	1820637	1820642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017618	TTTC	2	8	1822821	1822828	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5512	NC_017618	TATT	2	8	1822831	1822838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017618	TAT	3	9	1822875	1822883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017618	T	6	6	1822905	1822910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_017618	T	7	7	1822912	1822918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_017618	ATGA	2	8	1822928	1822935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017618	A	6	6	1822954	1822959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017618	A	6	6	1822991	1822996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_017618	TCC	2	6	1823068	1823073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_017618	CCA	2	6	1823077	1823082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_017618	T	6	6	1824117	1824122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_017618	TTA	2	6	1824239	1824244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_017618	TCC	2	6	1826434	1826439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_017618	CTA	2	6	1826458	1826463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_017618	AAAT	2	8	1829026	1829033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_017618	TTG	2	6	1829080	1829085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_017618	TTTC	2	8	1829128	1829135	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5528	NC_017618	GAA	2	6	1829171	1829176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_017618	ATT	2	6	1831748	1831753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_017618	AAC	2	6	1832344	1832349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_017618	AAG	2	6	1832371	1832376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_017618	ATCA	2	8	1832469	1832476	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5533	NC_017618	A	6	6	1832511	1832516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_017618	AT	3	6	1832544	1832549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_017618	CTA	2	6	1833536	1833541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_017618	TACTT	2	10	1833560	1833569	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5537	NC_017618	T	7	7	1833568	1833574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_017618	T	6	6	1833576	1833581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017618	GCT	2	6	1833595	1833600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5541	NC_017618	AAC	2	6	1833774	1833779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_017618	CCT	2	6	1833801	1833806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_017618	GTC	2	6	1833830	1833835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_017618	CA	3	6	1833838	1833843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_017618	TAT	2	6	1835998	1836003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017618	ATC	2	6	1837270	1837275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_017618	TTA	2	6	1837293	1837298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_017618	TATTT	2	10	1837314	1837323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_017618	CTA	2	6	1837418	1837423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_017618	CCT	2	6	1837857	1837862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_017618	AGG	2	6	1837869	1837874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_017618	TTTTA	2	10	1837876	1837885	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017618	AATAGA	2	12	1837892	1837903	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_017618	CCT	2	6	1839113	1839118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_017618	CCAT	2	8	1839148	1839155	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_017618	AGA	2	6	1839156	1839161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017618	TAA	2	6	1839300	1839305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017618	A	6	6	1839337	1839342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017618	CTTT	2	8	1840538	1840545	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5560	NC_017618	TCA	2	6	1840745	1840750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_017618	TCC	2	6	1845175	1845180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5562	NC_017618	T	6	6	1845181	1845186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017618	A	6	6	1845199	1845204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_017618	TCA	2	6	1845232	1845237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_017618	T	6	6	1845351	1845356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_017618	AGT	2	6	1846782	1846787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5568	NC_017618	TA	3	6	1846841	1846846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_017618	ATAAA	2	10	1846852	1846861	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_017618	CTT	2	6	1846895	1846900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_017618	CAA	2	6	1847087	1847092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_017618	TTG	2	6	1847107	1847112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5574	NC_017618	TCA	2	6	1847165	1847170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_017618	T	7	7	1848681	1848687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_017618	TAT	2	6	1850609	1850614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_017618	ATT	2	6	1850625	1850630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5579	NC_017618	A	6	6	1850724	1850729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_017618	A	6	6	1850765	1850770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_017618	TTCT	2	8	1853558	1853565	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5589	NC_017618	TGG	2	6	1854288	1854293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5592	NC_017618	AT	3	6	1854531	1854536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_017618	TCT	2	6	1854603	1854608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5595	NC_017618	TAA	2	6	1854642	1854647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5601	NC_017618	CTTG	2	8	1855093	1855100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5602	NC_017618	CTT	2	6	1855103	1855108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_017618	CAA	2	6	1855181	1855186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_017618	ACC	2	6	1855239	1855244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5605	NC_017618	GAA	2	6	1855311	1855316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_017618	AT	3	6	1855416	1855421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_017618	TGAA	2	8	1855433	1855440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_017618	TGG	2	6	1855509	1855514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5611	NC_017618	TCC	2	6	1855604	1855609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5613	NC_017618	CATTGC	2	12	1855626	1855637	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5618	NC_017618	TGA	2	6	1855929	1855934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_017618	ATC	2	6	1855939	1855944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5621	NC_017618	AT	3	6	1855988	1855993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_017618	TTC	2	6	1855994	1855999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5626	NC_017618	ATA	2	6	1856189	1856194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_017618	TTC	2	6	1857532	1857537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_017618	CTTTC	2	10	1857673	1857682	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5629	NC_017618	TA	3	6	1857695	1857700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_017618	TTA	2	6	1857717	1857722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_017618	A	7	7	1857728	1857734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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