MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis GZ1 chromosome

Total Repeats: 5264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017617	CATA	2	8	487707	487714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_017617	TG	3	6	487731	487736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017617	T	7	7	487750	487756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017617	T	6	6	487760	487765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017617	TTG	2	6	487778	487783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017617	TTGGT	2	10	487796	487805	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017617	ATATT	2	10	487829	487838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017617	TGAT	2	8	487858	487865	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017617	AT	3	6	487892	487897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017617	GA	3	6	487927	487932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017617	GAA	2	6	487934	487939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017617	AGGA	2	8	488836	488843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017617	ATA	2	6	490431	490436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017617	TGA	2	6	491595	491600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017617	ATT	2	6	491601	491606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017617	AAT	2	6	491623	491628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017617	AAG	2	6	491634	491639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017617	ATTT	2	8	492662	492669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017617	ACA	2	6	492773	492778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017617	TTA	2	6	494255	494260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017617	A	7	7	494487	494493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017617	GAA	2	6	494495	494500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017617	A	6	6	494585	494590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017617	GAA	2	6	494595	494600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017617	TTC	2	6	494621	494626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_017617	ATTAT	2	10	494996	495005	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017617	GAG	2	6	495048	495053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017617	GAAG	2	8	495279	495286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017617	AAC	2	6	495909	495914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_017617	TAA	2	6	495939	495944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017617	TA	3	6	495951	495956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017617	ACCTAT	2	12	495986	495997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_017617	AAT	2	6	496003	496008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017617	A	7	7	496009	496015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017617	A	6	6	498300	498305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017617	TAT	2	6	498330	498335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017617	ACA	2	6	498340	498345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_017617	T	6	6	501499	501504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017617	AATT	2	8	501510	501517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017617	ATAAA	2	10	501538	501547	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017617	CAA	2	6	502939	502944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017617	TTG	2	6	502959	502964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017617	CT	3	6	502970	502975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_017617	ATT	2	6	502979	502984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017617	TCG	2	6	503136	503141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_017617	AAAC	2	8	503215	503222	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_017617	TAG	2	6	503249	503254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017617	T	6	6	503324	503329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017617	TACTT	2	10	503338	503347	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1550	NC_017617	ATG	2	6	503394	503399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017617	CCA	2	6	503413	503418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_017617	TCCT	2	8	504960	504967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_017617	TCA	2	6	504994	504999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_017617	TCA	2	6	505114	505119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_017617	GTAAG	2	10	505123	505132	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017617	ATT	2	6	505173	505178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017617	ACC	2	6	505206	505211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_017617	CCT	2	6	505447	505452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_017617	GACTT	2	10	505519	505528	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1560	NC_017617	TTC	2	6	505587	505592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017617	GCC	2	6	505676	505681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_017617	GGTTT	2	10	505695	505704	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017617	TGT	2	6	505719	505724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017617	CTT	2	6	505729	505734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_017617	T	7	7	505733	505739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017617	GCCA	2	8	507083	507090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_017617	A	6	6	507127	507132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017617	TGA	2	6	507191	507196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017617	TAC	2	6	507264	507269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_017617	CTA	2	6	507321	507326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_017617	TGT	2	6	507364	507369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017617	GCCA	2	8	507393	507400	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_017617	CCT	2	6	508182	508187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_017617	GGTC	2	8	508531	508538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_017617	CCTT	2	8	508569	508576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_017617	T	6	6	508587	508592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017617	AAAGA	2	10	508599	508608	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017617	AT	3	6	508620	508625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017617	CCG	2	6	508648	508653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_017617	AT	3	6	510575	510580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017617	ATA	2	6	510588	510593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017617	TAT	2	6	510604	510609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017617	AAGC	2	8	511482	511489	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_017617	ATAG	2	8	511501	511508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017617	CACTA	2	10	511517	511526	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1587	NC_017617	TCCC	2	8	511608	511615	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1588	NC_017617	TA	3	6	511622	511627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017617	TTTC	2	8	511628	511635	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1590	NC_017617	ACA	2	6	511670	511675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_017617	CCAA	2	8	511704	511711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_017617	GCA	2	6	511717	511722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_017617	GAA	2	6	511779	511784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017617	ATA	2	6	511826	511831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017617	A	6	6	511853	511858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017617	TAAA	2	8	511877	511884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017617	T	6	6	511942	511947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_017617	CTG	2	6	512076	512081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_017617	GGA	2	6	512112	512117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017617	AG	3	6	514109	514114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017617	AGC	2	6	514985	514990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017617	TCCT	2	8	516718	516725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_017617	TGT	2	6	516743	516748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017617	AGG	2	6	520125	520130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017617	CTACCG	2	12	520141	520152	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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1608	NC_017617	A	6	6	520196	520201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017617	TC	3	6	520225	520230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_017617	CCT	2	6	520713	520718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_017617	CCT	2	6	521566	521571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_017617	TCC	2	6	521997	522002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_017617	TTG	2	6	527431	527436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1615	NC_017617	CGG	2	6	527467	527472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_017617	CTTG	2	8	527510	527517	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_017617	TCC	2	6	539040	539045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_017617	CACTG	2	10	539693	539702	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1619	NC_017617	CT	3	6	539732	539737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_017617	GTT	2	6	539787	539792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017617	TTTC	2	8	540005	540012	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_017617	AAG	2	6	540027	540032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017617	GCC	2	6	540038	540043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_017617	ATA	2	6	540045	540050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017617	ATT	2	6	544401	544406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017617	A	6	6	545156	545161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017617	TTTTGC	2	12	545204	545215	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1628	NC_017617	TTA	2	6	545252	545257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017617	GATA	2	8	545260	545267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017617	CAG	2	6	545295	545300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_017617	TA	4	8	545313	545320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017617	TCC	2	6	547083	547088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_017617	ATC	2	6	547396	547401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_017617	A	7	7	547571	547577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_017617	GCC	2	6	547578	547583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1636	NC_017617	CGG	2	6	547612	547617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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