MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis GZ1 chromosome

Total Repeats: 5264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017617	A	6	6	139244	139249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017617	ATAG	2	8	139261	139268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017617	AGA	2	6	139274	139279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017617	AGT	2	6	139327	139332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017617	AGG	2	6	139353	139358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017617	TGA	2	6	139371	139376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017617	AAAG	2	8	139406	139413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017617	A	7	7	139429	139435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017617	TAG	2	6	139449	139454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017617	A	6	6	141469	141474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017617	A	6	6	141503	141508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017617	TTAAG	2	10	141532	141541	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017617	ACC	2	6	141558	141563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_017617	T	6	6	141598	141603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017617	T	6	6	141613	141618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017617	TA	3	6	141663	141668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017617	T	6	6	142825	142830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017617	GTT	2	6	142887	142892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017617	A	7	7	142966	142972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017617	A	6	6	142987	142992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017617	GTAAA	2	10	143014	143023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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523	NC_017617	AGA	2	6	144697	144702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017617	A	7	7	144853	144859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017617	GTT	2	6	144863	144868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017617	T	6	6	144867	144872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017617	TTTG	2	8	144883	144890	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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529	NC_017617	ATT	2	6	144934	144939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017617	AGG	2	6	144965	144970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017617	GAAAA	2	10	144992	145001	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017617	CTATT	2	10	145018	145027	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
533	NC_017617	TAA	2	6	147497	147502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017617	T	6	6	147543	147548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017617	ATAAA	2	10	147571	147580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017617	GTA	2	6	149530	149535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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538	NC_017617	A	6	6	149566	149571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017617	GTCT	2	8	149587	149594	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_017617	GT	3	6	149774	149779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017617	ACTAAG	2	12	149787	149798	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
542	NC_017617	CTA	2	6	149881	149886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_017617	ATT	2	6	149910	149915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017617	A	6	6	149918	149923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017617	AG	3	6	149944	149949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017617	TAA	2	6	150094	150099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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549	NC_017617	CCTG	2	8	152799	152806	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
550	NC_017617	GGT	2	6	152931	152936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017617	GAT	2	6	152980	152985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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553	NC_017617	TTA	2	6	153089	153094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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556	NC_017617	TGA	2	6	158747	158752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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559	NC_017617	CAT	2	6	160966	160971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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561	NC_017617	TA	3	6	161252	161257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017617	ATAA	2	8	161289	161296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017617	AGG	2	6	161331	161336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017617	ATG	2	6	161371	161376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017617	AGG	2	6	161396	161401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017617	GCT	2	6	164010	164015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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570	NC_017617	TTA	2	6	165212	165217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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573	NC_017617	A	6	6	167695	167700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017617	A	7	7	167702	167708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017617	TAG	2	6	167750	167755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017617	TAC	2	6	167758	167763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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580	NC_017617	TCA	2	6	169203	169208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_017617	AGT	2	6	169213	169218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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583	NC_017617	AAC	2	6	169380	169385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017617	GAAA	2	8	169400	169407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017617	GTAG	2	8	169408	169415	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017617	CATTG	2	10	170845	170854	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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589	NC_017617	TGG	2	6	171621	171626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_017617	AGT	2	6	171648	171653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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593	NC_017617	AGG	2	6	171741	171746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017617	CAAAT	2	10	177315	177324	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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598	NC_017617	GTA	2	6	180180	180185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_017617	AGG	2	6	180343	180348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017617	ATG	2	6	181536	181541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017617	AAG	2	6	181542	181547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017617	A	6	6	181577	181582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017617	ACC	2	6	181591	181596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_017617	TA	3	6	181619	181624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017617	ATATA	2	10	181630	181639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017617	TTAAG	2	10	184000	184009	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017617	TGA	2	6	184049	184054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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611	NC_017617	CAC	2	6	185455	185460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_017617	GTTA	2	8	185473	185480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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614	NC_017617	TGATTT	2	12	185673	185684	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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616	NC_017617	ATA	2	6	187983	187988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017617	TAT	2	6	188001	188006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017617	TA	3	6	188044	188049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017617	ACG	2	6	188068	188073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017617	TA	3	6	189923	189928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017617	TTA	2	6	189949	189954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017617	CGA	2	6	189958	189963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017617	G	6	6	190042	190047	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017617	ATT	2	6	192630	192635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017617	AAAT	2	8	192677	192684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017617	A	7	7	192707	192713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017617	AAAT	2	8	192739	192746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017617	TAA	2	6	192762	192767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017617	TATTG	2	10	192785	192794	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017617	A	7	7	193984	193990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017617	TTA	2	6	194425	194430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017617	ATC	2	6	194541	194546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_017617	TGA	2	6	194551	194556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017617	T	6	6	194557	194562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017617	TAAA	2	8	194619	194626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017617	GTT	2	6	194627	194632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017617	ACA	2	6	194633	194638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_017617	T	6	6	195333	195338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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