MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis GZ1 chromosome

Total Repeats: 5264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017617	TCT	2	6	1926716	1926721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_017617	TTA	2	6	1926731	1926736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017617	ACA	2	6	1926806	1926811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_017617	TTA	2	6	1926862	1926867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017617	TAT	2	6	1929409	1929414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017617	TCTT	2	8	1931387	1931394	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5007	NC_017617	TAA	2	6	1931403	1931408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017617	A	6	6	1931410	1931415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017617	TCC	2	6	1933886	1933891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_017617	TCAT	2	8	1933913	1933920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5011	NC_017617	TAAGAT	2	12	1933970	1933981	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017617	CAA	2	6	1933989	1933994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_017617	CTTC	2	8	1934069	1934076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_017617	TAC	2	6	1934148	1934153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_017617	ACT	2	6	1934181	1934186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_017617	AT	3	6	1934188	1934193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017617	ATC	2	6	1934215	1934220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_017617	CTA	2	6	1934274	1934279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_017617	TCC	2	6	1934287	1934292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_017617	ACC	2	6	1934303	1934308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_017617	ATTG	2	8	1934348	1934355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017617	TA	3	6	1935397	1935402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017617	A	7	7	1935416	1935422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017617	T	6	6	1935447	1935452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017617	ATA	2	6	1935456	1935461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017617	AGA	2	6	1935467	1935472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017617	T	6	6	1936158	1936163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5029	NC_017617	A	6	6	1936219	1936224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017617	CATA	2	8	1936235	1936242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_017617	ACCA	2	8	1936244	1936251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_017617	TA	3	6	1936264	1936269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017617	TCT	2	6	1936391	1936396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5038	NC_017617	ACTTG	2	10	1938182	1938191	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5039	NC_017617	TAA	2	6	1938209	1938214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017617	AAC	2	6	1938239	1938244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5042	NC_017617	ACC	2	6	1938476	1938481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_017617	TAT	2	6	1938528	1938533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017617	TAA	2	6	1938542	1938547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017617	A	6	6	1938573	1938578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5049	NC_017617	ACT	2	6	1941566	1941571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_017617	ACAA	2	8	1941576	1941583	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_017617	TTTC	2	8	1941619	1941626	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5052	NC_017617	AACG	2	8	1941656	1941663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5053	NC_017617	AGA	2	6	1941712	1941717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5057	NC_017617	A	7	7	1944416	1944422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017617	TGA	2	6	1944446	1944451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5060	NC_017617	GCAGAT	2	12	1944559	1944570	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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5063	NC_017617	ATT	2	6	1947266	1947271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5065	NC_017617	TAT	2	6	1947432	1947437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5093	NC_017617	AAGA	2	8	1958823	1958830	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5104	NC_017617	AG	3	6	1961165	1961170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017617	TC	3	6	1962352	1962357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5108	NC_017617	A	8	8	1963770	1963777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017617	TAT	2	6	1963782	1963787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5113	NC_017617	ATTTTT	2	12	1963990	1964001	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017617	CCTT	2	8	1964004	1964011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_017617	AGC	2	6	1964026	1964031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5118	NC_017617	TTCCT	2	10	1964888	1964897	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5119	NC_017617	CAG	2	6	1964907	1964912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5122	NC_017617	TTC	2	6	1969192	1969197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_017617	CAAAA	2	10	1969221	1969230	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5124	NC_017617	A	7	7	1969246	1969252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5127	NC_017617	AAC	2	6	1969310	1969315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5129	NC_017617	A	6	6	1969409	1969414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017617	GGCT	2	8	1969429	1969436	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5131	NC_017617	CACC	2	8	1969466	1969473	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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