MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus salivarius JIM8777

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017595	GAAGTG	2	12	19614	19625	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017595	ACTAAT	2	12	19644	19655	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017595	AGGTTA	2	12	24438	24449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017595	TCATAT	2	12	44709	44720	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017595	GAAGTG	2	12	70679	70690	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017595	ACTAAT	2	12	70709	70720	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017595	TTCGGG	2	12	71596	71607	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017595	ATTAAA	2	12	110470	110481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017595	GAAGTG	2	12	129811	129822	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017595	ACTAAT	2	12	129841	129852	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017595	GAAGTG	2	12	135614	135625	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017595	ACTAAT	2	12	135644	135655	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017595	CAAATA	2	12	150659	150670	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017595	TTTTTC	2	12	159059	159070	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017595	GTAACA	2	12	178785	178796	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017595	GAAAAA	2	12	198838	198849	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017595	TAAAAT	2	12	210129	210140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017595	ACTCTT	2	12	291536	291547	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017595	ATTTTT	2	12	301618	301629	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017595	GAAGTG	2	12	342691	342702	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017595	ACTAAT	2	12	342721	342732	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017595	AAAAGG	2	12	373066	373077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017595	AGAATA	2	12	377805	377816	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017595	TGTAAA	2	12	387450	387461	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017595	TATGTT	2	12	447640	447651	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017595	TAGTAA	2	12	464347	464358	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017595	CAAAAA	2	12	487192	487203	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017595	TTTTGA	2	12	509896	509907	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017595	CAATAT	2	12	521747	521758	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017595	AAAAGT	2	12	522982	522993	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017595	AGTTAA	2	12	526302	526313	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017595	CATGTA	2	12	526597	526608	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017595	CAATTA	2	12	540433	540444	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017595	TTGACT	2	12	558589	558600	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017595	TTCGGG	2	12	611532	611543	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017595	GAAAAG	2	12	613256	613267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017595	TTTTTG	2	12	641798	641809	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017595	AGAACA	2	12	671537	671548	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017595	AAATCA	2	12	714577	714588	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017595	GTTTTT	2	12	759687	759698	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017595	GAAAAT	2	12	800416	800427	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017595	AAAATG	2	12	800507	800518	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017595	AGGCTT	2	12	802680	802691	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017595	CTTTTT	2	12	811447	811458	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017595	CTTCGG	2	12	827885	827896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017595	TAATCT	2	12	854821	854832	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017595	TTCTTT	2	12	912568	912579	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017595	TCCGTG	2	12	936439	936450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017595	TTCGCA	2	12	936601	936612	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017595	AAATAA	2	12	965274	965285	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017595	AAAAAC	2	12	992229	992240	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017595	TAGTTT	2	12	1037792	1037803	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017595	TAAAAA	2	12	1039930	1039941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017595	TAATTT	2	12	1041297	1041308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017595	ATGAGA	2	12	1103996	1104007	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017595	TATATT	2	12	1163581	1163592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017595	ACCTTG	2	12	1281875	1281886	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017595	AAAAAG	2	12	1307080	1307091	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017595	GATTAG	2	12	1327865	1327876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017595	AAAAGG	2	12	1402576	1402587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017595	TAAAAA	2	12	1412350	1412361	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017595	TAAATA	2	12	1420312	1420323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017595	GGAAAA	2	12	1471496	1471507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017595	GATTAG	2	12	1489025	1489036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017595	AGCATA	2	12	1489313	1489324	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017595	TTTTTA	2	12	1507375	1507386	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017595	TTCTTT	2	12	1622296	1622307	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017595	ACTAAC	2	12	1622940	1622951	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017595	GCAAGT	2	12	1628129	1628140	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017595	ATAGGG	2	12	1732659	1732670	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017595	TGTTTT	2	12	1745767	1745778	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017595	GAAATA	2	12	1770879	1770890	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017595	AAAAAG	2	12	1882576	1882587	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017595	GATTTT	2	12	1887424	1887435	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017595	GTGATG	2	12	1902753	1902764	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017595	AAGCAC	2	12	1918644	1918655	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017595	TTTTTC	2	12	1964164	1964175	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017595	ATTTAT	2	12	1970377	1970388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017595	TTACAA	2	12	1970498	1970509	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017595	AAAAGA	2	12	1988271	1988282	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017595	CAAGTC	2	12	2004188	2004199	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017595	TAAAAA	2	12	2006107	2006118	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017595	TATTAG	2	12	2008646	2008657	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017595	CAAAAA	2	12	2015064	2015075	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017595	CATAAA	2	12	2028777	2028788	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017595	AAATAG	2	12	2058093	2058104	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017595	CAAGGG	2	12	2127119	2127130	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017595	AATTGA	2	12	2147974	2147985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017595	AAAAAT	2	12	2159626	2159637	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017595	AATAAA	2	12	2202151	2202162	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.