MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae OXC141

Total Repeats: 386

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017592	TGAAA	2	10	3159	3168	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017592	TCGTG	2	10	16410	16419	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017592	GTTAA	2	10	17131	17140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017592	GGGAG	2	10	17649	17658	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017592	AGGGA	2	10	19860	19869	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017592	TTGAA	2	10	20064	20073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017592	CTTTT	2	10	23618	23627	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017592	GAAGA	2	10	33279	33288	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017592	ATTTT	2	10	57712	57721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017592	AATCA	2	10	64699	64708	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017592	AGAGG	2	10	76568	76577	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017592	TTATT	2	10	97030	97039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017592	ATTCA	2	10	102946	102955	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017592	TTAAA	2	10	105393	105402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017592	TTATC	2	10	105467	105476	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017592	TATCA	2	10	108667	108676	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017592	GAAAG	2	10	110478	110487	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017592	ATAAA	2	10	119203	119212	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017592	TAACC	2	10	119301	119310	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017592	GGCTT	2	10	135351	135360	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017592	TCTTT	2	10	143341	143350	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017592	GCTTT	2	10	153286	153295	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017592	TATTG	2	10	153323	153332	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017592	TAAAA	2	10	159148	159157	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017592	TTCTA	2	10	159733	159742	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017592	ATTAA	2	10	162804	162813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017592	ACATG	2	10	169681	169690	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017592	GAAAA	2	10	170273	170282	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017592	ATGTT	2	10	180649	180658	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017592	ACAAA	2	10	181164	181173	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017592	TTTTC	2	10	182576	182585	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017592	GAAAT	2	10	183386	183395	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017592	TGAAA	2	10	197353	197362	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017592	ATTTC	2	10	198879	198888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017592	CCCTG	2	10	206129	206138	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_017592	ATGAT	2	10	221353	221362	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017592	AAGGA	2	10	233595	233604	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017592	GTTCA	2	10	235229	235238	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017592	AAAAT	2	10	239036	239045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017592	ATCGA	2	10	239784	239793	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017592	TTTTA	2	10	244408	244417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017592	ATTCT	2	10	249178	249187	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017592	CTATC	2	10	250400	250409	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017592	CTTTT	2	10	263458	263467	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017592	CTTAA	2	10	265815	265824	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017592	AAGCC	2	10	279482	279491	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017592	AATAG	2	10	281028	281037	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017592	TGATA	2	10	290160	290169	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017592	TTTAT	2	10	308089	308098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017592	TAAAG	2	10	313062	313071	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017592	CTTTT	2	10	316744	316753	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017592	ATGGA	2	10	318128	318137	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017592	AAAAG	2	10	320014	320023	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017592	AAATA	2	10	331771	331780	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017592	TGCTT	2	10	344917	344926	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017592	ACTTC	2	10	346444	346453	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017592	ATACT	2	10	347193	347202	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017592	GTTTT	2	10	352572	352581	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017592	TTCTT	2	10	354995	355004	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017592	ATAAA	2	10	369013	369022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017592	TTTTC	2	10	383067	383076	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017592	TTCTG	2	10	389399	389408	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017592	TAAAA	2	10	401357	401366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017592	AAAGA	2	10	414406	414415	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017592	AGCTT	2	10	414588	414597	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017592	GACTG	2	10	428312	428321	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017592	TGATT	2	10	430369	430378	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017592	CTGAC	2	10	435999	436008	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017592	TCCAG	2	10	436024	436033	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017592	ATATA	2	10	437132	437141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017592	AAATA	2	10	439419	439428	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017592	AGAAA	2	10	439440	439449	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017592	GGAAT	2	10	444807	444816	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017592	AAGAG	2	10	449740	449749	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017592	CAGGG	2	10	453068	453077	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017592	TGAAA	2	10	458385	458394	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017592	CTATT	2	10	460455	460464	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017592	AATAA	2	10	465712	465721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017592	CTTTT	2	10	466980	466989	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017592	TAAAA	2	10	466993	467002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017592	TGTTT	2	10	469859	469868	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017592	CAGCC	2	10	473137	473146	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_017592	GCATA	2	10	473605	473614	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017592	ATAGA	2	10	473862	473871	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017592	CTTTC	2	10	475947	475956	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017592	ATAAA	2	10	478327	478336	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017592	AGCGA	2	10	481463	481472	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017592	TTGCC	2	10	485202	485211	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017592	ATTCA	2	10	485792	485801	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017592	TACTG	2	10	486565	486574	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017592	ATATA	2	10	486582	486591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017592	TTCTT	2	10	489146	489155	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017592	GATAA	2	10	491820	491829	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017592	GTTTG	2	10	494043	494052	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017592	AAAAG	2	10	494411	494420	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017592	CAATA	2	10	496827	496836	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017592	ATTGG	2	10	508300	508309	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017592	TATAA	2	10	508396	508405	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017592	TTTTA	2	10	511120	511129	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017592	CTTTT	2	10	511211	511220	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017592	TTTTA	2	10	511292	511301	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017592	TTTTA	2	10	519796	519805	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017592	TTTAT	2	10	524037	524046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017592	CTTAG	2	10	524121	524130	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017592	AGGAA	2	10	527824	527833	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017592	TGTCT	2	10	536298	536307	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017592	GCTAA	2	10	543023	543032	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017592	ATATA	2	10	547778	547787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017592	TAGTA	2	10	551008	551017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017592	AGTAA	2	10	551719	551728	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017592	CATTT	2	10	552460	552469	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017592	TAAAA	2	10	560833	560842	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017592	ATTAT	2	10	570993	571002	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017592	AAACA	2	10	590333	590342	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017592	ATATA	2	10	593117	593126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017592	GAAAA	2	10	630943	630952	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017592	GTTAT	2	10	630982	630991	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017592	GTTTG	2	10	646451	646460	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017592	ATTTT	2	10	668208	668217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017592	ACGAA	2	10	670205	670214	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017592	AGGGG	2	10	671663	671672	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017592	CCCTG	2	10	671749	671758	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_017592	ATGGA	2	10	693182	693191	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017592	TTATT	2	10	695477	695486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017592	ATAAA	2	10	703082	703091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017592	AAAAG	2	10	706363	706372	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017592	GGAAA	2	10	712024	712033	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017592	TAAAA	2	10	722803	722812	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017592	TAAAA	2	10	735692	735701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017592	ATTTT	2	10	736944	736953	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017592	CAAGA	2	10	742609	742618	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017592	CAAAT	2	10	744738	744747	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017592	AAAAT	2	10	744783	744792	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017592	TCTGA	2	10	748311	748320	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017592	TGATT	2	10	748949	748958	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017592	TTCTC	2	10	749147	749156	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017592	CTGAA	2	10	751157	751166	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017592	ATAAA	2	10	751327	751336	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017592	TTTGA	2	10	751355	751364	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017592	AAATA	2	10	758983	758992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017592	TATTT	2	10	775928	775937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017592	TCTTT	2	10	777513	777522	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017592	TTGCC	2	10	796743	796752	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017592	TTTTG	2	10	802649	802658	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017592	TTGAA	2	10	808042	808051	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017592	ATTTG	2	10	810539	810548	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017592	TATAT	2	10	814837	814846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017592	ATCTA	2	10	821329	821338	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017592	TATGA	2	10	823395	823404	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017592	TTTTC	2	10	826906	826915	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017592	CTGTT	2	10	830688	830697	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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157	NC_017592	CTTTT	2	10	844321	844330	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_017592	TAATA	2	10	845333	845342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017592	TTTTC	2	10	846417	846426	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_017592	ATAGA	2	10	854208	854217	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017592	TAAAA	2	10	859400	859409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017592	CTTTT	2	10	866005	866014	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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168	NC_017592	AGGCT	2	10	895143	895152	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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173	NC_017592	TCCTT	2	10	916263	916272	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
174	NC_017592	TCATT	2	10	916907	916916	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_017592	TATAT	2	10	958120	958129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017592	AAAAT	2	10	959186	959195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017592	ATTAA	2	10	971492	971501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017592	ATATT	2	10	975724	975733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_017592	AAAAT	2	10	977818	977827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_017592	TAAAA	2	10	978929	978938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_017592	AGTAA	2	10	1003006	1003015	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_017592	TTTAT	2	10	1024124	1024133	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_017592	ATACT	2	10	1447187	1447196	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
282	NC_017592	GAAAA	2	10	1448987	1448996	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_017592	CAAGA	2	10	1470509	1470518	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
287	NC_017592	GCTTG	2	10	1471015	1471024	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.