MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae INV104

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017591	TAAGGA	2	12	16882	16893	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017591	GAAGTG	2	12	19970	19981	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017591	ACTAAT	2	12	20000	20011	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017591	GATAGA	2	12	20589	20600	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017591	TCTTGT	2	12	21235	21246	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017591	CATCTC	2	12	21780	21791	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017591	AGTTGA	2	12	21899	21910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017591	TTGTTT	2	12	28270	28281	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017591	TAAAAA	2	12	40016	40027	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017591	AAAAAT	2	12	56165	56176	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017591	TTCTAT	2	12	63745	63756	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017591	TCCCAT	2	12	69644	69655	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017591	TAAAAT	2	12	72022	72033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017591	ACATCA	2	12	80276	80287	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017591	TAAAAA	2	12	88084	88095	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017591	ATAAAA	2	12	112720	112731	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017591	TTTGCT	2	12	121654	121665	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017591	ATAAAA	2	12	122043	122054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017591	ATAAAT	2	12	126955	126966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017591	TTTTAC	2	12	184585	184596	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017591	CATAAT	2	12	213040	213051	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017591	TCTTAA	2	12	228517	228528	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017591	GGTTGC	2	12	246542	246553	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017591	TCTTTT	2	12	267175	267186	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017591	GAATTA	2	12	273566	273577	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017591	AAAAGG	2	12	275693	275704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017591	TATTCC	2	12	275876	275887	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017591	GAAAAA	2	12	305816	305827	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017591	CTATAG	2	12	308342	308353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017591	AATCAG	2	12	313862	313873	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017591	GAAAAT	2	12	316708	316719	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017591	TCAACT	2	12	317523	317534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017591	ACAAGA	2	12	324816	324827	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017591	AGTTGA	2	12	325893	325904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017591	TCTATC	2	12	326937	326948	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017591	GCCAAA	2	12	344638	344649	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017591	GCAGTT	2	12	362899	362910	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017591	AGAAAT	2	12	416396	416407	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017591	ATGAAG	2	12	427061	427072	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017591	AGTTGA	2	12	439730	439741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017591	TCTTAT	2	12	440369	440380	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017591	GCTTGC	2	12	458860	458871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017591	TACAAA	2	12	460515	460526	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017591	GTTTTT	2	12	484152	484163	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017591	TAAAAA	2	12	507627	507638	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017591	TGCTTT	2	12	513198	513209	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017591	AAAATG	2	12	532607	532618	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017591	GAAAAG	2	12	543285	543296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017591	TCTTTT	2	12	543835	543846	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017591	AATTGA	2	12	554991	555002	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017591	AAAGTT	2	12	594660	594671	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017591	ACTTCT	2	12	613100	613111	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017591	GAGATG	2	12	615556	615567	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017591	CTTGCT	2	12	654314	654325	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017591	TAAGAT	2	12	654531	654542	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017591	AGAGGA	2	12	688837	688848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017591	AGATTG	2	12	700422	700433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017591	TTCAAT	2	12	716658	716669	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017591	TTTTCA	2	12	745136	745147	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017591	GAACAA	2	12	757114	757125	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017591	TTTGTT	2	12	757126	757137	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017591	GATAGA	2	12	757483	757494	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017591	GAAGTT	2	12	769830	769841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017591	AAAAAC	2	12	770561	770572	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017591	TTCGGG	2	12	793822	793833	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017591	TTAAAA	2	12	829152	829163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017591	TTAGAT	2	12	832031	832042	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017591	AAAAAT	2	12	852495	852506	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017591	TATAAA	2	12	855692	855703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017591	TCAAGT	2	12	875525	875536	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017591	CTTTTC	2	12	876053	876064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017591	AAAAAG	2	12	906443	906454	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017591	ACCAAG	2	12	907306	907317	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017591	ACAAAC	2	12	913831	913842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017591	TTTTTA	2	12	926333	926344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017591	CTATTT	2	12	937809	937820	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017591	AAAAAG	2	12	937858	937869	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017591	AATTGA	2	12	953859	953870	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017591	ATGGTT	2	12	958299	958310	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017591	TAAAAA	2	12	984989	985000	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017591	TGTCAA	2	12	991852	991863	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017591	ATTCGA	2	12	998157	998168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017591	CAAAAG	2	12	999486	999497	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017591	TTTTGG	2	12	1000346	1000357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017591	TAACAG	2	12	1000420	1000431	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017591	AAATTT	2	12	1002474	1002485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017591	TTCAAT	2	12	1053641	1053652	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017591	AGGAGC	2	12	1068543	1068554	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017591	ACAAGA	2	12	1080010	1080021	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017591	TCTATC	2	12	1080660	1080671	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017591	AATTTT	2	12	1113089	1113100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017591	TACATT	2	12	1113185	1113196	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017591	TTTTTG	2	12	1125324	1125335	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017591	GTTTGT	2	12	1134423	1134434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017591	ACTTGA	2	12	1136244	1136255	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017591	TACTTC	2	12	1136283	1136294	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017591	TGAAAA	2	12	1150042	1150053	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017591	GTTGAA	2	12	1155573	1155584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017591	AGAAAA	2	12	1187887	1187898	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017591	TAAAAA	2	12	1228522	1228533	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017591	CTCTTC	2	12	1236683	1236694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017591	TAATTT	2	12	1246505	1246516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017591	AATCTA	2	12	1257989	1258000	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017591	TAGGTA	2	12	1275916	1275927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017591	TTGAAA	2	12	1286892	1286903	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017591	AGCAAG	2	12	1287133	1287144	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017591	TTTCAC	2	12	1287493	1287504	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017591	GATGGT	2	12	1315638	1315649	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017591	TTTTAT	3	18	1327204	1327221	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017591	TTTCCT	2	12	1330652	1330663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017591	AATTGA	2	12	1367021	1367032	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017591	AATTGA	2	12	1385085	1385096	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017591	TGCTTC	2	12	1386328	1386339	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017591	ACTAAA	2	12	1387669	1387680	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017591	AAATTT	2	12	1402430	1402441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017591	AATTTA	2	12	1493831	1493842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017591	GATTGC	2	12	1513760	1513771	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017591	ATGGTC	2	12	1528427	1528438	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017591	CTTTTC	2	12	1529738	1529749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017591	CACTTC	2	12	1530187	1530198	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017591	TTAAAA	2	12	1562820	1562831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017591	AACTTG	2	12	1597978	1597989	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017591	ATTTGA	2	12	1621026	1621037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017591	TAATCA	2	12	1629207	1629218	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017591	ATAAAA	2	12	1642796	1642807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017591	AAAATC	2	12	1679038	1679049	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017591	CACTTC	2	12	1680388	1680399	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017591	AATTGA	2	12	1685448	1685459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_017591	TAGGCT	2	12	1737213	1737224	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.