MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces cattleya NRRL 8057 = DSM 46488 plasmid pSCATT

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017585	AGGTCG	2	12	3669	3680	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017585	CTTCTC	2	12	5265	5276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017585	CCGCCC	2	12	11125	11136	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
4	NC_017585	CGGCTG	2	12	22102	22113	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017585	CACCGC	2	12	46160	46171	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017585	TGTCTT	2	12	74274	74285	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017585	GTCCGC	2	12	121140	121151	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017585	GGGACG	2	12	125614	125625	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017585	TCCCCC	2	12	128767	128778	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
10	NC_017585	CGGCGC	2	12	129320	129331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017585	CGTCGG	2	12	137763	137774	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017585	TCCGGC	2	12	140466	140477	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017585	CGTCGG	2	12	151945	151956	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017585	CCCGCG	2	12	163050	163061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017585	GCCGGG	2	12	172847	172858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017585	CCGGCT	2	12	175633	175644	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017585	GAGGGC	2	12	176545	176556	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017585	CGGGGC	2	12	176584	176595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017585	CGCTGA	2	12	181101	181112	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017585	CCCGGG	2	12	202068	202079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017585	CGTCGG	2	12	266916	266927	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017585	GGGGTT	2	12	279202	279213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017585	CGGGCC	2	12	279290	279301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017585	CCCCTC	2	12	346063	346074	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
25	NC_017585	CGGGGA	2	12	383895	383906	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017585	CGCGGG	2	12	390810	390821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017585	GGGCAG	3	18	399774	399791	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017585	CACCGG	2	12	399945	399956	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017585	GCCCCC	2	12	400096	400107	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
30	NC_017585	GACCAG	3	18	413415	413432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017585	CGGTGC	2	12	414873	414884	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017585	CGCGGG	2	12	527203	527214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017585	GACGGC	2	12	530705	530716	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017585	GCCGGC	2	12	533290	533301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017585	TGCCGG	2	12	579636	579647	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017585	AACCAT	2	12	580332	580343	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017585	GGGTGG	2	12	593821	593832	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017585	CGCGCC	2	12	608460	608471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017585	TTTTCA	2	12	615478	615489	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017585	CGGCCC	2	12	643289	643300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017585	CGGGGG	2	12	668373	668384	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017585	GAAGTC	2	12	681595	681606	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017585	CGGGCC	2	12	681693	681704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017585	ATCACG	2	12	731150	731161	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017585	GACGGG	2	12	731646	731657	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017585	GCCACC	2	12	734533	734544	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017585	GGACGA	2	12	734950	734961	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017585	GGTCGG	2	12	748472	748483	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017585	GGACGG	2	12	753629	753640	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017585	GCCGGG	2	12	763663	763674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017585	CCGGCC	2	12	797637	797648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017585	GCCGAC	2	12	806174	806185	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017585	CGAGCG	2	12	811094	811105	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017585	TGACGT	2	12	812337	812348	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017585	AGAGGG	2	12	812363	812374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017585	GGCCCG	2	12	828003	828014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017585	GCGGCA	2	12	833227	833238	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017585	GGGCGC	2	12	858135	858146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017585	CCCCGA	2	12	883331	883342	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017585	CTACGC	2	12	917794	917805	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017585	CCGACG	2	12	932215	932226	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017585	GAGGTG	2	12	933156	933167	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017585	GGTGGA	2	12	933321	933332	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017585	CGGCCC	2	12	951322	951333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017585	CGGGGG	2	12	989110	989121	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017585	CTCCGC	2	12	996547	996558	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017585	GAGGGC	2	12	999199	999210	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017585	GCGGTA	2	12	1001205	1001216	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017585	CGGGCG	2	12	1002149	1002160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017585	GCGCCG	2	12	1025901	1025912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017585	CTTGAC	2	12	1048331	1048342	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017585	TGGGTG	2	12	1049739	1049750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017585	CCGCTC	2	12	1053240	1053251	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017585	CACGAG	2	12	1053332	1053343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017585	GGCCGG	2	12	1067507	1067518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017585	CACCGG	2	12	1115027	1115038	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017585	CGGCCT	2	12	1137809	1137820	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017585	CCACCT	2	12	1182483	1182494	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017585	TCGGCC	2	12	1190203	1190214	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017585	CGGTGC	2	12	1200872	1200883	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017585	CGGGGC	2	12	1218076	1218087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017585	CCCCGC	2	12	1269860	1269871	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
83	NC_017585	GCGGGG	2	12	1275463	1275474	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017585	CCGACC	2	12	1280966	1280977	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017585	GCCCGT	2	12	1281952	1281963	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017585	CGGGCG	2	12	1293972	1293983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017585	CGGACG	2	12	1310039	1310050	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017585	CCCGGA	2	12	1336102	1336113	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017585	CACCGC	2	12	1336576	1336587	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017585	GCGGGG	2	12	1341489	1341500	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017585	ACCGGC	2	12	1376011	1376022	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017585	CCGGCC	2	12	1384190	1384201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017585	CCGGGG	2	12	1387428	1387439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017585	GGGCCC	2	12	1389966	1389977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017585	GCGTCG	2	12	1417596	1417607	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017585	CCACCC	2	12	1525013	1525024	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
97	NC_017585	TCCAGA	2	12	1557953	1557964	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017585	CGGTGC	2	12	1561526	1561537	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017585	GCCGGG	2	12	1576804	1576815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017585	CCCGGC	2	12	1576823	1576834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017585	CGGGAG	2	12	1588109	1588120	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017585	ACGATC	2	12	1592853	1592864	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017585	CCCGAG	2	12	1610443	1610454	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017585	GCAGCC	2	12	1671477	1671488	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017585	CCGGTC	2	12	1697904	1697915	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017585	GCTGCG	2	12	1732230	1732241	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017585	CTTCGA	2	12	1734795	1734806	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017585	GGTCAC	2	12	1744465	1744476	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017585	GGGACG	2	12	1747040	1747051	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017585	CGGGCG	2	12	1757777	1757788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017585	ACCCGC	2	12	1758583	1758594	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017585	CATGCA	2	12	1760482	1760493	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017585	CCCGGC	2	12	1761866	1761877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017585	ATTTTC	2	12	1767587	1767598	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017585	CTGGAC	2	12	1768084	1768095	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017585	GCCGTC	2	12	1769518	1769529	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017585	CGTTCC	2	12	1783962	1783973	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017585	CCTGGA	2	12	1791420	1791431	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017585	TCGACC	2	12	1797741	1797752	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017585	GGCACG	2	12	1801836	1801847	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017585	CCCCCA	2	12	1804624	1804635	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.