MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces cattleya NRRL 8057 = DSM 46488 plasmid pSCATT

Total Repeats: 372

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017585	CACGG	2	10	5227	5236	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017585	CGTCC	2	10	14220	14229	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_017585	TCACC	2	10	15884	15893	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_017585	GTCGA	2	10	17342	17351	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017585	CCGGC	2	10	17885	17894	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_017585	GGGCC	2	10	25436	25445	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017585	CCGCC	2	10	28592	28601	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
8	NC_017585	GTGGA	2	10	45996	46005	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017585	CCTGC	2	10	47106	47115	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_017585	TCGAG	2	10	47197	47206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017585	GTCCG	2	10	47928	47937	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017585	CCCCT	2	10	54540	54549	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
13	NC_017585	ACATG	2	10	54604	54613	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017585	AGATG	2	10	59403	59412	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017585	TCCCG	2	10	61336	61345	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_017585	GCCCT	2	10	63377	63386	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_017585	TCGTT	2	10	74289	74298	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017585	TACCT	2	10	79063	79072	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017585	CACCT	2	10	99187	99196	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017585	CCGGT	2	10	102659	102668	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017585	TGTCG	2	10	110980	110989	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017585	GTGGG	2	10	114371	114380	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017585	CTCTC	2	10	122178	122187	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_017585	CCGTG	2	10	129293	129302	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017585	GACCG	2	10	134952	134961	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017585	CCCGC	2	10	140381	140390	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
27	NC_017585	CACCG	2	10	140492	140501	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_017585	GGCCC	2	10	140502	140511	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_017585	CGGGG	2	10	144720	144729	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017585	ACGGC	2	10	147466	147475	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017585	CCGTC	2	10	148423	148432	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_017585	GCAAC	2	10	153842	153851	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017585	GGCCG	2	10	164771	164780	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017585	GTGGG	2	10	172762	172771	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017585	CCGGC	2	10	174919	174928	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_017585	TGGAG	2	10	175704	175713	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017585	GGGCC	2	10	176476	176485	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017585	CCGTG	2	10	177298	177307	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017585	GTCGG	2	10	190217	190226	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017585	GCCGT	2	10	209220	209229	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017585	CGGGG	2	10	211562	211571	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017585	CAGGC	2	10	212693	212702	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017585	CGCGG	2	10	215628	215637	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017585	GTCCT	2	10	239352	239361	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017585	CCGTG	2	10	252925	252934	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017585	CGGAC	2	10	259365	259374	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017585	CCGGA	2	10	264168	264177	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017585	GTGCC	2	10	264402	264411	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017585	GCGAC	2	10	266204	266213	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017585	TCCGG	2	10	269198	269207	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017585	CGCAC	2	10	279334	279343	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
52	NC_017585	GAAGG	2	10	282405	282414	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017585	CGGGG	2	10	283769	283778	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017585	ACCCG	2	10	299793	299802	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_017585	CGACA	2	10	314769	314778	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017585	ACCGT	2	10	337312	337321	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017585	TGGGA	2	10	340273	340282	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017585	GCGCC	2	10	341206	341215	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
59	NC_017585	TGCGG	2	10	353692	353701	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017585	CAGGT	2	10	354677	354686	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017585	CGGAC	2	10	376025	376034	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017585	CCGTG	2	10	384509	384518	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017585	AGAGA	2	10	389787	389796	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017585	GGCGC	2	10	389981	389990	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017585	CGCCT	2	10	390018	390027	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_017585	TGTGA	2	10	399515	399524	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017585	GCAGC	2	10	399886	399895	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017585	GCGTC	2	10	404599	404608	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017585	CGGCG	2	10	405130	405139	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017585	CGTCG	2	10	406040	406049	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017585	CCACG	2	10	413433	413442	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_017585	GGGCC	2	10	427410	427419	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017585	GGCGT	2	10	435875	435884	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017585	GCGGT	2	10	441406	441415	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017585	GTCGT	2	10	441423	441432	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017585	CGAGC	2	10	441487	441496	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017585	GGGCC	2	10	441531	441540	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017585	CGTGG	2	10	441700	441709	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017585	GTCCC	2	10	443275	443284	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_017585	TTCGG	2	10	443921	443930	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017585	CCGGG	2	10	453046	453055	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017585	GTGCT	2	10	459298	459307	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017585	GGGGC	2	10	460541	460550	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017585	TCGGC	2	10	461539	461548	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017585	CCGCT	2	10	475394	475403	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_017585	AGACG	2	10	475597	475606	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017585	GCCGG	2	10	477423	477432	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017585	CCGCC	2	10	486473	486482	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
89	NC_017585	CCTGG	2	10	486677	486686	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_017585	CCGGG	2	10	495786	495795	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017585	CCGGC	2	10	495830	495839	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_017585	CGCGG	2	10	497675	497684	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017585	CCTAA	2	10	505003	505012	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017585	GGTTA	2	10	507125	507134	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017585	CGTCC	2	10	519080	519089	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_017585	ACCCA	2	10	523055	523064	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_017585	CGGTG	2	10	523225	523234	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017585	GCGGG	2	10	527066	527075	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017585	GAGCC	2	10	530721	530730	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017585	CCAGG	2	10	533067	533076	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017585	TCCGC	2	10	534885	534894	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_017585	GGTGG	2	10	545273	545282	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017585	CGGCC	2	10	560270	560279	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
104	NC_017585	GGTGG	2	10	560521	560530	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017585	CCGTT	2	10	560641	560650	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017585	CATCG	2	10	560666	560675	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017585	CCGCA	2	10	560747	560756	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_017585	GCGCC	2	10	573495	573504	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
109	NC_017585	CGGGG	2	10	573524	573533	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017585	GGTGG	2	10	584182	584191	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017585	ATTGT	2	10	590452	590461	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017585	GCCGG	2	10	592205	592214	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017585	CCGGG	2	10	593929	593938	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017585	CCCGG	2	10	596977	596986	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
115	NC_017585	TGACG	2	10	598395	598404	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017585	GCCGG	2	10	604965	604974	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
117	NC_017585	GTGGG	2	10	605617	605626	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017585	CGGAA	2	10	608577	608586	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017585	GGTCC	2	10	612594	612603	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017585	GCCGC	2	10	612605	612614	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_017585	CCCGG	2	10	618244	618253	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_017585	CGCCT	2	10	620532	620541	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_017585	AGTCC	2	10	620736	620745	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017585	CGACG	2	10	625476	625485	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017585	CACCG	2	10	625537	625546	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_017585	CCGAG	2	10	630047	630056	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017585	GGAGC	2	10	634649	634658	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017585	GCCCG	2	10	636946	636955	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
129	NC_017585	CGGCC	2	10	638503	638512	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_017585	GGTGC	2	10	639566	639575	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017585	ACGCG	2	10	645809	645818	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017585	CGCAC	2	10	646777	646786	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_017585	ACCGG	2	10	648469	648478	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_017585	GCTCC	2	10	649619	649628	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_017585	GCCGG	2	10	660814	660823	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
136	NC_017585	GGCCG	2	10	662863	662872	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017585	CCGGC	3	15	664277	664291	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_017585	CCCGG	2	10	664857	664866	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
139	NC_017585	TGCCT	2	10	666970	666979	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_017585	GTGGG	2	10	675444	675453	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017585	CGGGC	2	10	678457	678466	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017585	CGGGC	2	10	685111	685120	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
143	NC_017585	GCCCG	2	10	685129	685138	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_017585	CCGGC	2	10	700867	700876	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
145	NC_017585	CCCCG	2	10	703692	703701	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
146	NC_017585	CCCGG	2	10	716780	716789	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
147	NC_017585	CGTCC	2	10	719597	719606	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
148	NC_017585	CGGCG	2	10	727456	727465	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
149	NC_017585	GGGCA	2	10	729731	729740	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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153	NC_017585	GATCG	2	10	735879	735888	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_017585	GGCCG	2	10	739573	739582	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
156	NC_017585	CCGTG	2	10	742505	742514	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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158	NC_017585	ACCCC	2	10	743224	743233	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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251	NC_017585	CGCAC	2	10	1135105	1135114	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
252	NC_017585	GGGGA	2	10	1136088	1136097	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_017585	CGGGC	2	10	1144255	1144264	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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267	NC_017585	ACGGC	2	10	1213425	1213434	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
268	NC_017585	CGGCG	2	10	1213986	1213995	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
269	NC_017585	GCCGT	2	10	1217632	1217641	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
270	NC_017585	CCTTC	2	10	1221741	1221750	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
271	NC_017585	CCGCC	2	10	1240688	1240697	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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274	NC_017585	CGTGC	2	10	1255666	1255675	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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276	NC_017585	CCGGG	2	10	1276688	1276697	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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281	NC_017585	GCCCG	2	10	1295141	1295150	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
282	NC_017585	AGGCG	2	10	1304345	1304354	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
283	NC_017585	CACGG	2	10	1310235	1310244	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
284	NC_017585	CGCGG	2	10	1316263	1316272	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
285	NC_017585	TGATC	2	10	1345877	1345886	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
286	NC_017585	TCCCC	2	10	1352709	1352718	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
287	NC_017585	CCGCG	2	10	1367626	1367635	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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289	NC_017585	GCCCG	2	10	1381138	1381147	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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291	NC_017585	TCGTC	2	10	1391878	1391887	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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293	NC_017585	GCCCC	2	10	1393914	1393923	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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332	NC_017585	CGCGC	2	10	1671364	1671373	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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371	NC_017585	AGCGC	2	10	1808552	1808561	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
372	NC_017585	CCGGC	2	10	1811236	1811245	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.