MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 8248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017582	CTT	2	6	213033	213038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017582	GGTC	2	8	213044	213051	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_017582	TAG	2	6	213073	213078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017582	TGC	2	6	213108	213113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017582	TAGCTG	2	12	213117	213128	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1006	NC_017582	AAG	2	6	213176	213181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017582	ATC	2	6	213294	213299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017582	GCT	2	6	213313	213318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017582	A	7	7	213401	213407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017582	GTCT	2	8	213408	213415	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_017582	ATC	2	6	213420	213425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017582	TAA	2	6	213440	213445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017582	AGG	2	6	213465	213470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017582	AG	3	6	214286	214291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017582	AG	4	8	218338	218345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017582	GGC	2	6	218395	218400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_017582	CAG	2	6	218746	218751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_017582	TGC	2	6	218758	218763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017582	TAAGC	2	10	218798	218807	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1020	NC_017582	TC	3	6	220154	220159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_017582	T	6	6	220179	220184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017582	T	14	14	220261	220274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017582	TAA	2	6	220287	220292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017582	T	6	6	220298	220303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017582	TTA	2	6	220421	220426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017582	GAT	2	6	220430	220435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017582	GCT	2	6	220438	220443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017582	TGTC	2	8	220444	220451	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_017582	AGC	2	6	220476	220481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017582	GAT	3	9	220521	220529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017582	CCA	2	6	220624	220629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_017582	AAAG	2	8	220649	220656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017582	AG	3	6	220677	220682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017582	TAGC	2	8	220686	220693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_017582	ATT	2	6	220815	220820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017582	TAAT	2	8	220821	220828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017582	ATAA	2	8	220849	220856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017582	TA	3	6	220857	220862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017582	CCA	2	6	220891	220896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_017582	TAAT	2	8	220935	220942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017582	TAA	2	6	220960	220965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017582	T	7	7	220995	221001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017582	CTT	2	6	221642	221647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_017582	AAAT	2	8	221651	221658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017582	CAA	2	6	221675	221680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017582	A	6	6	221704	221709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017582	ATA	2	6	221740	221745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017582	ACATTA	2	12	221749	221760	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1049	NC_017582	TGA	2	6	221773	221778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017582	GAA	2	6	221817	221822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017582	A	6	6	221835	221840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017582	CTTTT	2	10	221902	221911	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1053	NC_017582	ATT	2	6	221947	221952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017582	T	6	6	221963	221968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017582	TC	3	6	222828	222833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_017582	CTAT	2	8	222919	222926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_017582	T	13	13	222948	222960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017582	TGAT	2	8	222988	222995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017582	GCT	2	6	223034	223039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_017582	AGC	2	6	223040	223045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017582	T	6	6	223048	223053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017582	TGCT	2	8	223075	223082	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_017582	AGA	2	6	223112	223117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017582	AGC	3	9	223152	223160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017582	CGG	2	6	223236	223241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017582	GAA	2	6	223248	223253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017582	T	6	6	223321	223326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017582	AAG	2	6	223354	223359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017582	AAG	2	6	223361	223366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017582	GCT	2	6	223383	223388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_017582	TAG	2	6	223444	223449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017582	TGC	2	6	224747	224752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017582	CCAA	2	8	224831	224838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_017582	A	6	6	224842	224847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017582	TGC	2	6	224924	224929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_017582	ATC	2	6	226944	226949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_017582	TTA	2	6	226950	226955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017582	CTG	2	6	226992	226997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_017582	GTG	2	6	227016	227021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017582	A	6	6	227039	227044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017582	AGG	2	6	227120	227125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017582	GCT	2	6	231104	231109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_017582	GTT	2	6	231110	231115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017582	T	6	6	231169	231174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017582	TAA	2	6	231204	231209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_017582	AGA	2	6	231231	231236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017582	CTG	2	6	232032	232037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_017582	TGC	2	6	232043	232048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_017582	T	6	6	232084	232089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017582	GAA	2	6	232115	232120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017582	A	6	6	233314	233319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017582	A	6	6	233333	233338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017582	GTG	2	6	233367	233372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017582	T	6	6	233383	233388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017582	TAA	2	6	233412	233417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017582	A	6	6	233425	233430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017582	AG	3	6	233442	233447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017582	CAG	2	6	233468	233473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017582	GCT	2	6	233481	233486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_017582	GCT	2	6	233977	233982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017582	AGG	2	6	234017	234022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017582	TGC	2	6	235397	235402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017582	AG	3	6	235503	235508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017582	CAG	3	9	235790	235798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017582	ATT	2	6	235810	235815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017582	TTTG	2	8	235816	235823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017582	TAT	2	6	235850	235855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017582	AGC	2	6	235862	235867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_017582	GCTG	2	8	235905	235912	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_017582	T	9	9	235956	235964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017582	TGCT	2	8	235997	236004	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_017582	GCT	2	6	236033	236038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_017582	GGA	2	6	236201	236206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017582	TTG	2	6	237639	237644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017582	CT	3	6	237645	237650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_017582	TCTGC	2	10	237678	237687	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1118	NC_017582	TGC	2	6	237710	237715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017582	GCA	2	6	237824	237829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_017582	GCT	2	6	237844	237849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_017582	TCA	2	6	237919	237924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_017582	TGA	2	6	237981	237986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017582	CTT	2	6	238227	238232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017582	TAG	2	6	239717	239722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017582	GAT	2	6	239739	239744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017582	ATAA	2	8	239746	239753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017582	CAT	2	6	239754	239759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017582	T	6	6	239800	239805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017582	ACG	2	6	239825	239830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_017582	TAG	2	6	239833	239838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017582	CAG	2	6	239861	239866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017582	TGA	2	6	239885	239890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017582	AT	3	6	239898	239903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1135	NC_017582	ATT	2	6	239942	239947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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