MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 8248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017582	GATAA	2	10	91800	91809	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017582	ATC	2	6	91836	91841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017582	AGT	2	6	91846	91851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017582	GGTCT	2	10	91857	91866	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
505	NC_017582	CTA	2	6	92831	92836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017582	TGAT	2	8	92860	92867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017582	AG	3	6	92893	92898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017582	GCA	2	6	92924	92929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017582	TCA	2	6	92995	93000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017582	GAT	2	6	93027	93032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017582	TG	3	6	93046	93051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017582	ACT	2	6	93094	93099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017582	GTG	2	6	93111	93116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017582	A	7	7	93195	93201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017582	TTG	2	6	93222	93227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017582	GTT	2	6	93243	93248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017582	AGG	2	6	93304	93309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017582	CTG	3	9	93847	93855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017582	TGCT	2	8	93865	93872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
520	NC_017582	TAG	2	6	93877	93882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017582	GCT	2	6	93895	93900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017582	TAG	2	6	93921	93926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017582	CAT	2	6	93969	93974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017582	TATT	2	8	93988	93995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017582	GAG	2	6	94963	94968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017582	T	6	6	96964	96969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017582	TGC	2	6	97065	97070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017582	CTGT	2	8	97119	97126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
529	NC_017582	ATA	2	6	100815	100820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017582	GTC	2	6	100834	100839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017582	AGAA	2	8	100866	100873	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017582	CAG	2	6	100874	100879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017582	GCT	2	6	100908	100913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017582	AAAAAG	2	12	101029	101040	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017582	GACTA	2	10	104646	104655	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
536	NC_017582	GCT	2	6	104671	104676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017582	TCA	2	6	104683	104688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017582	TAG	2	6	108419	108424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017582	GAG	2	6	108446	108451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017582	GTC	2	6	108458	108463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017582	TGTA	2	8	108630	108637	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017582	ATT	2	6	108700	108705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017582	TTA	2	6	108706	108711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017582	A	7	7	108713	108719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017582	AATTT	2	10	108728	108737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017582	T	6	6	108747	108752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017582	A	6	6	108753	108758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017582	AT	3	6	108781	108786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017582	GGT	2	6	108813	108818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017582	TAG	2	6	108846	108851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017582	TTGT	2	8	108877	108884	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017582	AATT	2	8	109475	109482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017582	ATT	2	6	109487	109492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017582	TTG	2	6	109498	109503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017582	ATT	2	6	109508	109513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017582	ATA	2	6	109519	109524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017582	T	6	6	109528	109533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017582	T	7	7	109540	109546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017582	T	7	7	109576	109582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017582	AGGT	2	8	109599	109606	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017582	ATT	2	6	109668	109673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017582	GAAA	2	8	109735	109742	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017582	TAA	2	6	109913	109918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017582	TAA	2	6	109928	109933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017582	GA	3	6	109938	109943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017582	T	6	6	111061	111066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017582	TCTT	2	8	111074	111081	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_017582	GAA	2	6	111623	111628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017582	T	6	6	111652	111657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017582	AAC	2	6	111730	111735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017582	AAGC	2	8	111787	111794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_017582	AT	3	6	112599	112604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017582	TAA	2	6	112640	112645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017582	TAC	2	6	112658	112663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017582	AT	3	6	112699	112704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017582	T	6	6	112711	112716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_017582	A	7	7	112754	112760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017582	TGA	2	6	112769	112774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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582	NC_017582	TTTAA	2	10	112824	112833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017582	AAT	2	6	112844	112849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017582	TTA	2	6	112861	112866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017582	ACT	2	6	112893	112898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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588	NC_017582	ATT	2	6	116211	116216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017582	TCTG	2	8	116239	116246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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591	NC_017582	TAC	2	6	116342	116347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017582	ATA	2	6	116376	116381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017582	AAAG	2	8	116415	116422	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017582	A	6	6	116445	116450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_017582	GA	3	6	116738	116743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017582	TAAGG	2	10	116756	116765	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017582	TCA	2	6	119464	119469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017582	GCTA	2	8	123100	123107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_017582	AGC	2	6	123119	123124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017582	CAG	2	6	123154	123159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_017582	CAG	2	6	123187	123192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017582	TC	3	6	123194	123199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_017582	TTTCA	2	10	123271	123280	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
607	NC_017582	TGATA	2	10	123290	123299	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017582	T	6	6	124264	124269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017582	ATA	2	6	124273	124278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017582	AG	3	6	124305	124310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017582	ATA	2	6	125522	125527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017582	A	6	6	125563	125568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017582	TAT	3	9	125630	125638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017582	AAGACA	2	12	125655	125666	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
615	NC_017582	A	6	6	125670	125675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017582	A	6	6	125697	125702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017582	TAATT	2	10	125706	125715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017582	CATT	2	8	125721	125728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
619	NC_017582	T	6	6	125741	125746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017582	AAT	2	6	125857	125862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017582	CTA	2	6	126525	126530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017582	TAA	2	6	126583	126588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017582	ATTAT	2	10	126605	126614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017582	ATA	2	6	126619	126624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017582	T	6	6	126636	126641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017582	TAA	2	6	126661	126666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017582	TGA	2	6	126733	126738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_017582	AGG	2	6	126880	126885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017582	TGA	2	6	126930	126935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017582	GAAT	2	8	126992	126999	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017582	CTG	2	6	132602	132607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_017582	AGC	2	6	132650	132655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_017582	CTAT	2	8	132666	132673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
635	NC_017582	GAA	2	6	132686	132691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017582	T	6	6	132742	132747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017582	ATT	2	6	132768	132773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017582	AATC	2	8	132782	132789	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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