MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus JIM 8232

Total Repeats: 839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017581	TAAG	2	8	8476	8483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017581	TTCT	2	8	15880	15887	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017581	TAGA	2	8	15938	15945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017581	CAGT	2	8	17347	17354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017581	ATTT	2	8	17925	17932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017581	GTGA	2	8	18135	18142	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017581	AGCG	2	8	18306	18313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017581	TGGT	2	8	18971	18978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017581	AGCC	2	8	19187	19194	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017581	GTAA	2	8	19462	19469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017581	ATAG	2	8	19476	19483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017581	GCGA	2	8	19790	19797	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017581	ATTC	2	8	20655	20662	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017581	CTAA	2	8	21009	21016	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017581	CTGA	2	8	21282	21289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017581	TAGG	2	8	21664	21671	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017581	GCGT	2	8	23649	23656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017581	ATTT	2	8	27245	27252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017581	GTTT	2	8	33009	33016	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017581	GAGT	2	8	37563	37570	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017581	TGAA	2	8	40787	40794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017581	AGAA	2	8	40813	40820	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017581	CTTT	2	8	42437	42444	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017581	ACCT	2	8	44635	44642	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017581	GCGA	2	8	46219	46226	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017581	AGTT	2	8	46406	46413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017581	AAAC	2	8	48272	48279	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017581	AATA	2	8	49406	49413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017581	AGGA	2	8	50980	50987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017581	ATGA	2	8	51076	51083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017581	AGTC	2	8	57820	57827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017581	AAAG	2	8	60805	60812	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017581	TTGA	2	8	61987	61994	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017581	AAAC	2	8	62022	62029	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017581	AGAA	2	8	63361	63368	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017581	ATTT	2	8	65706	65713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017581	GTGA	2	8	65916	65923	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017581	AGCG	2	8	66087	66094	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017581	TGGT	2	8	66752	66759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017581	AGCC	2	8	66968	66975	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017581	GTAA	2	8	67243	67250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017581	ATAG	2	8	67257	67264	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017581	GCGA	2	8	67572	67579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017581	ATTC	2	8	68437	68444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017581	CTAA	2	8	68791	68798	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017581	CTGA	2	8	69064	69071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017581	TAGG	2	8	69446	69453	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017581	GCGT	2	8	70833	70840	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017581	ATTT	2	8	71022	71029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017581	TCCC	2	8	71104	71111	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_017581	GAAC	2	8	75097	75104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017581	AAAT	2	8	75240	75247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017581	ATTC	2	8	75808	75815	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017581	AATT	2	8	76036	76043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017581	TTTG	2	8	77300	77307	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017581	TAAA	2	8	77376	77383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017581	GTAA	2	8	77386	77393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017581	ATAG	2	8	77394	77401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017581	AGTC	2	8	82092	82099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017581	TTTG	2	8	82111	82118	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017581	ATAA	2	8	85159	85166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017581	ATTA	2	8	85197	85204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017581	AAAT	2	8	88481	88488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017581	AATC	2	8	89581	89588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017581	ATGA	2	8	96192	96199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017581	GAAA	2	8	99958	99965	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017581	AATT	2	8	100316	100323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017581	TGAA	2	8	102359	102366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017581	TTTA	2	8	106107	106114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017581	TAGC	2	8	106115	106122	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017581	GGTA	2	8	107211	107218	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017581	TTTG	2	8	111775	111782	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017581	CCAC	2	8	111924	111931	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_017581	ATCT	2	8	112175	112182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017581	TTAT	2	8	123882	123889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017581	ATTG	2	8	125225	125232	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017581	TCTT	3	12	127605	127616	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017581	ATTT	2	8	129829	129836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017581	AAGA	2	8	133139	133146	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017581	AATT	2	8	135450	135457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017581	AGAA	2	8	136069	136076	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017581	TTTA	2	8	142321	142328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017581	TGAA	2	8	142470	142477	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017581	CAAA	2	8	143911	143918	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017581	TTAT	2	8	145503	145510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017581	ATTA	2	8	146856	146863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017581	TAAA	2	8	147663	147670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017581	GCTA	2	8	151745	151752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017581	AGAA	2	8	155534	155541	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017581	AGAA	2	8	157452	157459	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017581	ATTT	2	8	161598	161605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017581	GTGA	2	8	161808	161815	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017581	AGCG	2	8	161979	161986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017581	TGGT	2	8	162644	162651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017581	AGCC	2	8	162860	162867	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017581	GTAA	2	8	163135	163142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017581	ATAG	2	8	163149	163156	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017581	GCGA	2	8	163463	163470	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017581	ATTC	2	8	164328	164335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017581	CTAA	2	8	164682	164689	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017581	CTGA	2	8	164955	164962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017581	TAGG	2	8	165337	165344	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017581	ATTT	2	8	167404	167411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017581	GTGA	2	8	167614	167621	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017581	AGCG	2	8	167785	167792	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017581	TGGT	2	8	168450	168457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017581	AGCC	2	8	168666	168673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017581	GTAA	2	8	168941	168948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017581	ATAG	2	8	168955	168962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017581	GCGA	2	8	169269	169276	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017581	ATTC	2	8	170134	170141	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017581	CTAA	2	8	170488	170495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017581	CTGA	2	8	170761	170768	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017581	TAGG	2	8	171143	171150	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017581	TATG	2	8	172341	172348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017581	CAAG	2	8	174538	174545	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017581	GTGA	2	8	174588	174595	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017581	ATTG	2	8	175344	175351	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017581	GTGG	2	8	175748	175755	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017581	TTAT	2	8	175795	175802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017581	GTTT	2	8	176414	176421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017581	AATC	2	8	179697	179704	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017581	AAGA	2	8	181424	181431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017581	AAAG	2	8	184171	184178	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017581	TCTA	2	8	187293	187300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017581	TGTT	2	8	187308	187315	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017581	TTAC	2	8	187394	187401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017581	GAAG	2	8	187437	187444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017581	TAGA	2	8	190228	190235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017581	AACT	2	8	191321	191328	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017581	AATA	2	8	192284	192291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017581	AAAG	2	8	196558	196565	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017581	TGAA	2	8	198188	198195	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017581	AGCT	2	8	198265	198272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017581	CCTT	2	8	198984	198991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017581	AAAG	2	8	199031	199038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017581	ATCA	2	8	199504	199511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017581	CAAA	2	8	199758	199765	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017581	TAAA	2	8	209854	209861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017581	TCAG	2	8	221928	221935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017581	TGTC	2	8	221946	221953	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017581	TTGT	2	8	225299	225306	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017581	ATAA	2	8	226226	226233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017581	CTTG	2	8	228595	228602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017581	ATCT	2	8	234016	234023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017581	AGCT	2	8	234214	234221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017581	ATAA	2	8	234355	234362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017581	GAGT	2	8	237746	237753	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017581	AAGA	2	8	239383	239390	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017581	AATC	2	8	240082	240089	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_017581	GTTT	2	8	241394	241401	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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