MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 chromosome

Total Repeats: 751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017579	TGAAT	2	10	11246	11255	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017579	CATTC	2	10	19509	19518	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017579	CTGGG	2	10	38151	38160	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017579	GGTCA	2	10	44471	44480	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017579	TTGAA	2	10	44605	44614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017579	AGTCG	2	10	47984	47993	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017579	AGGCT	2	10	48311	48320	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017579	ATCCC	2	10	49962	49971	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017579	TGCGC	2	10	63595	63604	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017579	CTTAA	2	10	63745	63754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017579	ATAAC	2	10	85474	85483	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017579	TAGTC	2	10	118961	118970	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017579	TAAAA	2	10	122073	122082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017579	GATTT	2	10	148957	148966	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017579	CTAAA	2	10	153343	153352	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017579	GCGCA	2	10	155810	155819	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017579	ATATT	2	10	173549	173558	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017579	TAACT	2	10	177434	177443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017579	AGGCA	2	10	180247	180256	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017579	CGAGT	2	10	183307	183316	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017579	TCAGG	2	10	183333	183342	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017579	CCTGA	2	10	183348	183357	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017579	ATAAA	2	10	190711	190720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017579	ATTTG	2	10	203403	203412	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017579	TTACT	2	10	213284	213293	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017579	GAAAT	2	10	216211	216220	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017579	ATTAA	2	10	249224	249233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017579	TGTTT	2	10	263047	263056	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017579	AATAT	2	10	263475	263484	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017579	CAAAG	2	10	271240	271249	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017579	AGGCG	2	10	285613	285622	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017579	TGCGG	2	10	301726	301735	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017579	CAGCT	2	10	302416	302425	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017579	TTAAT	2	10	302488	302497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017579	CTAAG	2	10	314288	314297	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017579	TTAAT	2	10	315520	315529	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017579	ATGAT	2	10	333644	333653	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017579	ACGAG	2	10	341950	341959	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017579	TCAAA	2	10	351347	351356	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017579	AGTCG	2	10	377768	377777	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017579	AGGCT	2	10	378095	378104	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017579	ATCCC	2	10	379746	379755	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_017579	TCCGC	2	10	379932	379941	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_017579	GTCCA	2	10	380019	380028	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017579	ATTCA	2	10	405436	405445	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017579	TGGTT	2	10	407962	407971	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017579	TTATT	2	10	408458	408467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017579	TGGCT	2	10	416053	416062	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017579	AAGTT	2	10	421594	421603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017579	CTTAT	2	10	421637	421646	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017579	ATAAG	2	10	430011	430020	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017579	TTTGT	2	10	431331	431340	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017579	TTTAA	2	10	471774	471783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017579	GCTTT	2	10	507282	507291	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017579	GCGGT	2	10	509767	509776	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017579	TTGAA	2	10	510073	510082	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017579	TTAAG	2	10	519620	519629	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017579	TTCAA	2	10	520654	520663	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017579	GAAGT	2	10	520713	520722	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017579	ATCCC	2	10	547334	547343	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_017579	GTTAT	2	10	563428	563437	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017579	TAGAA	2	10	568645	568654	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017579	AGTCG	2	10	572776	572785	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017579	AGGCT	2	10	573103	573112	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017579	ATCCC	2	10	574755	574764	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_017579	ATCCC	2	10	575019	575028	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_017579	ATGAG	2	10	580638	580647	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017579	AACAG	2	10	588429	588438	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017579	GTGAC	2	10	588595	588604	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017579	GCGTG	2	10	594599	594608	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017579	AAAAT	2	10	594836	594845	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017579	GAAAA	2	10	596985	596994	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017579	TTCAA	2	10	601074	601083	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017579	ATTGT	2	10	617160	617169	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017579	GAAGG	2	10	625364	625373	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017579	TGAGC	2	10	628072	628081	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017579	TGATT	2	10	628164	628173	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017579	TCTTA	2	10	630728	630737	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017579	AAAAG	2	10	632857	632866	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017579	AGTGA	2	10	632899	632908	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017579	GTGTG	2	10	633136	633145	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017579	GACGT	2	10	633148	633157	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017579	TAGCT	2	10	635154	635163	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017579	AAAAC	2	10	636699	636708	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017579	AGCTA	2	10	636760	636769	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017579	AAAAC	2	10	652196	652205	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017579	TGATG	2	10	660895	660904	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017579	GCTTA	2	10	684167	684176	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017579	TTCAC	2	10	693753	693762	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_017579	GTTTT	2	10	695097	695106	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017579	TTCAA	2	10	700645	700654	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017579	CGATC	2	10	716290	716299	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017579	CCGAT	2	10	733245	733254	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017579	GTAAC	2	10	757484	757493	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017579	AGGCG	2	10	779971	779980	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017579	ATTCT	2	10	797304	797313	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017579	TCCAA	2	10	797910	797919	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017579	CAAAT	2	10	803157	803166	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017579	AAATG	2	10	803313	803322	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017579	AGGAA	2	10	804018	804027	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017579	ACGAT	2	10	816908	816917	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017579	GTCAA	2	10	820128	820137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017579	TCGTT	2	10	820322	820331	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017579	CCTCA	2	10	822922	822931	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
105	NC_017579	ATCGT	2	10	825743	825752	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017579	AGTTT	2	10	828043	828052	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017579	TGGTA	2	10	831380	831389	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017579	TTCAA	2	10	847643	847652	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017579	GCAAC	2	10	860444	860453	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017579	ATTAA	2	10	861916	861925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017579	CGCTT	2	10	862050	862059	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017579	TCTCT	2	10	862500	862509	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017579	TAAAT	2	10	868785	868794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017579	TGAGT	2	10	871107	871116	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017579	CTAAG	2	10	873611	873620	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017579	ACACA	2	10	876061	876070	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_017579	GGTGA	2	10	883732	883741	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017579	TAAGG	2	10	890720	890729	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017579	AAGGC	2	10	910946	910955	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017579	TCAAT	2	10	922020	922029	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017579	CTAAT	2	10	931831	931840	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017579	AAATA	2	10	941197	941206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017579	AAATC	2	10	948240	948249	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017579	GCGTA	2	10	962565	962574	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017579	TTCAT	2	10	962989	962998	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017579	CCACA	2	10	963150	963159	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_017579	GTTTC	2	10	976346	976355	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017579	TTCAA	2	10	976586	976595	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017579	CCTTT	2	10	986106	986115	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017579	GACCC	2	10	986528	986537	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_017579	TTAAG	2	10	1005365	1005374	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017579	AGGCA	2	10	1007391	1007400	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017579	TTGAA	2	10	1007547	1007556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017579	TTGGT	2	10	1013072	1013081	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017579	TCGTT	2	10	1015462	1015471	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017579	GGATT	2	10	1037517	1037526	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017579	GAGTT	2	10	1040131	1040140	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017579	TAAAT	2	10	1050762	1050771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017579	CTTTA	2	10	1052513	1052522	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017579	GGGCT	2	10	1052530	1052539	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017579	ATTTT	2	10	1053400	1053409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017579	TTTAT	2	10	1053444	1053453	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017579	AGTTA	2	10	1055259	1055268	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017579	TTATC	2	10	1057142	1057151	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017579	TTGCT	2	10	1059811	1059820	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017579	GAAAA	2	10	1062727	1062736	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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