MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 chromosome

Total Repeats: 16669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017579	TTAAG	2	10	519620	519629	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017579	TTCAA	2	10	520654	520663	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1503	NC_017579	GCA	2	6	520667	520672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_017579	GAAGT	2	10	520713	520722	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017579	ATGG	2	8	520834	520841	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017579	GTT	2	6	520921	520926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017579	TGA	2	6	520960	520965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017579	GTG	2	6	521782	521787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017579	TTA	2	6	521826	521831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017579	GCA	2	6	521849	521854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_017579	TAA	2	6	521914	521919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017579	CAGC	2	8	522611	522618	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_017579	TTGA	2	8	522646	522653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017579	A	6	6	522668	522673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017579	T	6	6	522704	522709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017579	ATTG	2	8	522720	522727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017579	TCC	2	6	523428	523433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_017579	CGT	2	6	523438	523443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_017579	ATT	2	6	523511	523516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017579	GAG	2	6	523545	523550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017579	T	6	6	525708	525713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017579	AAGG	2	8	525760	525767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017579	AGT	2	6	525787	525792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017579	CAT	2	6	528116	528121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_017579	GCC	2	6	528138	528143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_017579	A	6	6	528187	528192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017579	T	8	8	529502	529509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017579	T	7	7	529514	529520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017579	AGT	2	6	529521	529526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017579	TCA	2	6	529530	529535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_017579	ATC	2	6	529572	529577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017579	A	6	6	529590	529595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017579	ATTC	2	8	529724	529731	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_017579	AATC	2	8	531112	531119	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_017579	T	6	6	531157	531162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017579	ATA	2	6	531169	531174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017579	TTG	2	6	531180	531185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017579	TGC	2	6	531214	531219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_017579	TG	3	6	531763	531768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017579	ACA	2	6	532687	532692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_017579	GT	3	6	532708	532713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017579	GAT	2	6	533499	533504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017579	CGG	2	6	533595	533600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_017579	CGTT	2	8	533622	533629	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1545	NC_017579	AGA	2	6	533767	533772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017579	T	6	6	537435	537440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017579	A	6	6	537445	537450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017579	TAT	2	6	537452	537457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017579	A	6	6	537595	537600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017579	ATT	2	6	537649	537654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017579	AATA	2	8	537662	537669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017579	TAAA	2	8	537672	537679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017579	AGC	2	6	537692	537697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_017579	CCT	3	9	537706	537714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_017579	CT	4	8	537713	537720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_017579	T	6	6	537807	537812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017579	AAT	2	6	537836	537841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017579	TGGC	2	8	539499	539506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_017579	ATC	3	9	542720	542728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_017579	CTG	2	6	542772	542777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017579	TG	3	6	542780	542785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017579	TGT	2	6	542875	542880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017579	TTA	2	6	542881	542886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017579	T	7	7	542893	542899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017579	TCT	2	6	543053	543058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_017579	CGC	2	6	543114	543119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_017579	AGT	2	6	543132	543137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017579	AAT	2	6	543147	543152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017579	ATT	2	6	543153	543158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017579	A	6	6	544534	544539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017579	T	6	6	544558	544563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017579	TGG	2	6	544576	544581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017579	GCTT	2	8	544599	544606	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_017579	AT	3	6	544631	544636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017579	AGT	2	6	544647	544652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017579	GGC	2	6	544683	544688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_017579	TAG	2	6	544706	544711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017579	TGATAT	4	24	546254	546277	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017579	CCT	2	6	546703	546708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_017579	TTA	2	6	546711	546716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017579	G	6	6	546792	546797	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017579	CCAA	2	8	546825	546832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_017579	AGC	2	6	546833	546838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_017579	TAG	2	6	546878	546883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017579	GTG	2	6	546918	546923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017579	GAT	2	6	546998	547003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017579	ATT	2	6	547021	547026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017579	T	6	6	547052	547057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017579	TAA	2	6	547065	547070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017579	T	6	6	547097	547102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017579	T	7	7	547160	547166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017579	TCT	2	6	547229	547234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_017579	TGC	2	6	547297	547302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_017579	ATCCC	2	10	547334	547343	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1595	NC_017579	AAG	2	6	547914	547919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017579	AG	3	6	547918	547923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017579	AGGAAA	2	12	560023	560034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017579	TA	3	6	560057	560062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017579	GGC	2	6	560134	560139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_017579	GTT	2	6	563374	563379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017579	TG	3	6	563412	563417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017579	ATA	2	6	563420	563425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017579	GTTAT	2	10	563428	563437	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017579	ATA	2	6	564904	564909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017579	CAT	2	6	565851	565856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_017579	CTG	2	6	568616	568621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_017579	TAGAA	2	10	568645	568654	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017579	CTT	2	6	568749	568754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_017579	TA	3	6	568755	568760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017579	TCG	2	6	568766	568771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_017579	CAT	2	6	568787	568792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_017579	TG	3	6	568893	568898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017579	A	7	7	568915	568921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017579	A	6	6	568936	568941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_017579	AAAG	2	8	569016	569023	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017579	A	6	6	569074	569079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017579	GT	3	6	569139	569144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017579	TG	3	6	569179	569184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017579	GTTT	2	8	569286	569293	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017579	CTT	2	6	569299	569304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_017579	A	6	6	569325	569330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017579	CAA	2	6	569369	569374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_017579	GGC	2	6	569417	569422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_017579	GCG	2	6	569483	569488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_017579	AGG	2	6	569578	569583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017579	CGA	2	6	569658	569663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_017579	GAT	2	6	569683	569688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017579	GCA	2	6	569732	569737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_017579	GT	3	6	569785	569790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017579	GAA	2	6	569791	569796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017579	GGA	2	6	569827	569832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017579	AGC	2	6	569838	569843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_017579	AGA	2	6	569874	569879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017579	CAG	2	6	569900	569905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_017579	G	6	6	570047	570052	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_017579	GGC	2	6	570111	570116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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