MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11701

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017577	ATTA	2	8	42	49	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017577	AAAT	2	8	1377	1384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017577	TATC	2	8	1417	1424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017577	TAAA	2	8	1437	1444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017577	CAAT	2	8	1656	1663	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017577	GATA	2	8	1840	1847	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017577	TCAA	2	8	3838	3845	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017577	ATGA	2	8	11918	11925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017577	TCAT	2	8	16534	16541	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017577	CTTG	2	8	16709	16716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017577	AACC	2	8	24441	24448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017577	TTGA	2	8	24539	24546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017577	ACTC	2	8	24597	24604	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017577	ATAA	2	8	24697	24704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017577	TAAC	2	8	27225	27232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017577	TGCT	2	8	30470	30477	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017577	GCAA	2	8	30500	30507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017577	TAAA	2	8	30561	30568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017577	ATAA	2	8	31079	31086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017577	TAAT	2	8	31102	31109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017577	ATTA	2	8	31618	31625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017577	TAGA	2	8	32693	32700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017577	AATT	2	8	36581	36588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017577	ACTT	2	8	36632	36639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017577	TCTA	2	8	36645	36652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017577	GATT	2	8	36820	36827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017577	AGTT	2	8	36843	36850	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017577	TTGA	2	8	37127	37134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017577	TTAA	2	8	38934	38941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017577	TAAA	2	8	39065	39072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017577	ATAA	2	8	39263	39270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017577	TCAT	2	8	40126	40133	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017577	AAGA	2	8	40153	40160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017577	AGTA	2	8	41593	41600	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017577	TTTA	2	8	42926	42933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017577	CAGG	2	8	43009	43016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017577	ATTT	2	8	43017	43024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017577	AGAA	2	8	43091	43098	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017577	TGTT	2	8	54737	54744	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017577	GTTT	2	8	54786	54793	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017577	AATA	2	8	55250	55257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017577	GTTT	2	8	55342	55349	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017577	AATT	2	8	55410	55417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017577	GTTT	2	8	55435	55442	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017577	TACT	2	8	66061	66068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017577	ATTA	2	8	67063	67070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017577	TCAC	2	8	67105	67112	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017577	TTAA	2	8	68042	68049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017577	TTAG	2	8	68893	68900	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017577	TATT	2	8	76350	76357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017577	TAAA	2	8	76396	76403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017577	TAAC	2	8	76960	76967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017577	CTAT	2	8	78911	78918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017577	TATT	2	8	79536	79543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017577	GAAC	2	8	79919	79926	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017577	TAAT	2	8	79984	79991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017577	TTAA	2	8	82142	82149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017577	GGCC	2	8	83949	83956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017577	ACAA	3	12	84143	84154	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017577	AAAG	2	8	84185	84192	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017577	TGAG	2	8	84330	84337	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017577	ATTC	2	8	85471	85478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017577	TAAT	2	8	85824	85831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017577	ATGC	2	8	87247	87254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017577	GCTT	2	8	87274	87281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017577	AAAT	2	8	88421	88428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017577	AATT	2	8	89915	89922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017577	TAAG	2	8	89950	89957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017577	TTTG	2	8	89983	89990	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017577	AAGT	2	8	90029	90036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017577	ATTT	2	8	90083	90090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017577	TCAA	2	8	90562	90569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017577	CATC	2	8	90710	90717	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017577	ATTC	2	8	91403	91410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017577	GGAA	2	8	91432	91439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017577	TCGA	2	8	91601	91608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017577	ATTT	2	8	93550	93557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017577	TTGG	2	8	93809	93816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017577	CCAT	2	8	95184	95191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017577	CTCA	2	8	108869	108876	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017577	ATGT	2	8	111002	111009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017577	CAAA	2	8	111099	111106	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017577	ACTT	2	8	111161	111168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017577	AACA	3	12	112754	112765	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017577	ACTC	2	8	113278	113285	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017577	ACAA	2	8	113305	113312	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017577	ACTC	2	8	114421	114428	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017577	ACAA	2	8	116528	116535	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017577	ACTC	2	8	117559	117566	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017577	AATT	2	8	118830	118837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017577	GAGG	2	8	119358	119365	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.