MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus ATCC 43143

Total Repeats: 380

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017576	CTTTT	2	10	2906	2915	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017576	GGAAA	2	10	5386	5395	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017576	TCGTG	2	10	17752	17761	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017576	GTTAA	2	10	18500	18509	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017576	GGGAG	2	10	19018	19027	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017576	AGGGA	2	10	21226	21235	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017576	ATGGA	2	10	23019	23028	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017576	GTTTT	2	10	23210	23219	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017576	ATGAC	2	10	35309	35318	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017576	CTTTA	2	10	41486	41495	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017576	TGAAC	2	10	46385	46394	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017576	ATATT	2	10	49628	49637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017576	AAAAG	2	10	50027	50036	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017576	ATTTT	2	10	61165	61174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017576	AAGGA	2	10	67939	67948	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017576	AAAAT	2	10	73136	73145	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017576	TCGTG	2	10	78764	78773	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017576	GTTAA	2	10	79512	79521	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017576	GGGAG	2	10	80030	80039	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017576	AGGGA	2	10	82238	82247	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017576	AATGA	2	10	85059	85068	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017576	AGCTA	2	10	88417	88426	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017576	GTAAA	2	10	105146	105155	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017576	GTAAA	2	10	105169	105178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017576	GTAAA	2	10	105192	105201	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017576	GTAAA	2	10	105215	105224	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017576	GTAAA	2	10	106820	106829	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017576	TAATC	2	10	111541	111550	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017576	AAATA	2	10	129396	129405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017576	TTATA	2	10	132359	132368	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017576	TTTTA	2	10	136151	136160	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017576	ATGAA	2	10	136177	136186	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017576	ATTTG	2	10	141533	141542	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017576	TAAAA	2	10	144379	144388	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017576	AAGTT	2	10	147821	147830	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017576	CTTTT	2	10	159917	159926	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017576	TTTAT	2	10	164191	164200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017576	ATTAA	2	10	172091	172100	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017576	GTTTT	2	10	175473	175482	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017576	ATTTT	2	10	179714	179723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017576	GAAGT	2	10	191231	191240	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017576	AACAT	2	10	191396	191405	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017576	AAAAG	2	10	193189	193198	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017576	TATTC	2	10	193278	193287	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017576	GTTAA	2	10	194425	194434	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017576	AGTAG	2	10	197369	197378	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017576	AAGGA	2	10	198171	198180	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017576	ATTGA	2	10	199315	199324	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017576	ATCTA	2	10	224783	224792	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017576	TTGAT	2	10	228637	228646	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017576	TTTCA	2	10	232128	232137	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017576	AACTT	2	10	238438	238447	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017576	AAAAT	2	10	238697	238706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017576	TTGAT	2	10	261062	261071	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017576	AAAAT	2	10	269089	269098	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017576	CCTTA	2	10	281591	281600	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017576	AAAAG	2	10	281613	281622	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017576	TATAA	2	10	281636	281645	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017576	CTATT	2	10	294474	294483	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017576	ATGAT	2	10	296176	296185	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017576	TATAT	2	10	296758	296767	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017576	TCACT	2	10	296908	296917	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017576	TTGTC	2	10	297226	297235	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017576	CTTTT	2	10	299116	299125	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017576	TCGTG	2	10	310044	310053	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017576	GTTAA	2	10	310792	310801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017576	GGGAG	2	10	311310	311319	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017576	AGGGA	2	10	313518	313527	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017576	TAAAC	2	10	328041	328050	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017576	GCAGA	2	10	333193	333202	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017576	TTTGT	2	10	334906	334915	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017576	TTTAT	2	10	337236	337245	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017576	TAAAA	2	10	341364	341373	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017576	GAAAT	2	10	343872	343881	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017576	TCGTG	2	10	367294	367303	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017576	GTTAA	2	10	368042	368051	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017576	GGGAG	2	10	368560	368569	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017576	AGGGA	2	10	370768	370777	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017576	ATAAA	2	10	380104	380113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017576	ATTAA	2	10	393273	393282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017576	TTTAT	2	10	402804	402813	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017576	AAAGG	2	10	404228	404237	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017576	GGGAT	2	10	417908	417917	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017576	GGAAA	2	10	419051	419060	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017576	CTAGT	2	10	421595	421604	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017576	AAAAT	2	10	424875	424884	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017576	ATATA	2	10	429669	429678	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017576	GCCTA	2	10	431381	431390	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017576	GAAAA	2	10	459135	459144	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017576	ATATA	2	10	487863	487872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017576	TTTCC	2	10	487957	487966	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017576	TCGTG	2	10	495726	495735	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017576	GTTAA	2	10	496474	496483	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017576	GGGAG	2	10	496992	497001	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017576	AGGGA	2	10	499200	499209	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017576	TATTT	2	10	500174	500183	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017576	TAGTA	2	10	500431	500440	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017576	TAAAA	2	10	511912	511921	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017576	TTTTA	2	10	520599	520608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017576	TAAAT	2	10	525063	525072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017576	ATAAA	2	10	537656	537665	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017576	CATTG	2	10	541141	541150	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017576	ATTTT	2	10	541499	541508	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017576	CTTGT	2	10	550899	550908	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017576	ATAAA	2	10	565917	565926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017576	CTAAT	2	10	566120	566129	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017576	AATCA	2	10	578506	578515	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017576	AAGAA	2	10	578602	578611	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017576	GTAAA	2	10	578730	578739	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017576	AAATC	2	10	582796	582805	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017576	CTTTT	2	10	584061	584070	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017576	AATTG	2	10	589294	589303	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017576	AGCAG	2	10	603591	603600	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017576	TCGCT	2	10	607005	607014	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017576	ATATA	2	10	617491	617500	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017576	GATAG	2	10	630427	630436	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017576	TAGTG	2	10	636815	636824	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017576	AAAAG	2	10	654423	654432	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017576	ATTAG	2	10	661829	661838	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017576	TAATA	2	10	689951	689960	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017576	AATCA	2	10	691120	691129	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017576	GGGGT	2	10	692342	692351	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017576	TCAAA	2	10	713161	713170	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017576	TCACC	2	10	718250	718259	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_017576	GTTGT	2	10	720927	720936	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017576	TAAAA	2	10	723949	723958	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017576	TCTTT	2	10	736107	736116	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017576	TAAAA	2	10	742045	742054	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017576	TAGCT	2	10	752434	752443	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017576	GTAAT	2	10	761582	761591	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017576	GCTGT	2	10	761920	761929	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017576	AATAA	2	10	763078	763087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017576	AACTT	2	10	786601	786610	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017576	TGAAT	2	10	815951	815960	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017576	GAAAG	2	10	839028	839037	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017576	ATATC	2	10	839345	839354	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017576	ATTTT	2	10	841780	841789	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017576	AGTTT	2	10	845514	845523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017576	ATTTC	2	10	846158	846167	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017576	TCAGT	2	10	857992	858001	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017576	GTTAT	2	10	859785	859794	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017576	TTTTA	2	10	859851	859860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017576	AATAA	2	10	861793	861802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017576	ATCAT	2	10	867246	867255	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017576	CTTTT	2	10	874578	874587	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017576	ATAAA	2	10	877398	877407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017576	CTAAA	2	10	936384	936393	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017576	TTTAT	2	10	947085	947094	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_017576	AGAAA	2	10	2356042	2356051	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.