MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Serratia sp. AS13 chromosome

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017573	TCGCTA	2	12	75918	75929	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017573	CACCAT	2	12	84409	84420	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017573	AAACCT	2	12	95161	95172	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017573	AGGTTT	2	12	95211	95222	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017573	CTGTGC	2	12	103865	103876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017573	CGCTTG	2	12	139462	139473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017573	GAAATG	2	12	144646	144657	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017573	CCTTGT	15	90	160264	160353	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017573	CAGTGA	2	12	224701	224712	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017573	TAAGAC	2	12	257689	257700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017573	GGAAGG	2	12	262830	262841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017573	TAAGAC	2	12	300372	300383	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017573	TTTGTT	2	12	322502	322513	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017573	AACAGC	2	12	360425	360436	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017573	GGTATC	2	12	360519	360530	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017573	AATTAA	2	12	374186	374197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017573	TGAAAA	2	12	391524	391535	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017573	ATTTTT	2	12	411319	411330	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017573	GGCAGT	2	12	455375	455386	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017573	TTAACC	2	12	708317	708328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017573	CCCACG	2	12	746269	746280	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017573	GTAACG	2	12	800981	800992	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017573	ATCGGC	2	12	812606	812617	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017573	CGGCAG	2	12	815888	815899	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017573	GTGCGG	2	12	816267	816278	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017573	TAAGAC	2	12	912435	912446	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017573	CTTTCT	2	12	970989	971000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017573	AAAAAG	2	12	971126	971137	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017573	TCATTT	2	12	998179	998190	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017573	TTTGAT	2	12	1012707	1012718	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017573	TCGTTA	2	12	1016136	1016147	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017573	GCCGTC	2	12	1058927	1058938	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017573	TTTTAC	2	12	1125816	1125827	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017573	CTATTA	2	12	1140652	1140663	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017573	GCGCTG	2	12	1212355	1212366	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017573	TTCAAT	2	12	1212529	1212540	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017573	GTCAAT	2	12	1215794	1215805	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017573	ATAAAA	2	12	1231169	1231180	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017573	TGTTGA	2	12	1259831	1259842	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017573	TTGTGC	2	12	1261874	1261885	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017573	GTTAAT	2	12	1277780	1277791	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017573	CTGTCA	2	12	1283411	1283422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017573	AGTAAA	2	12	1295633	1295644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017573	TGCTGT	2	12	1347980	1347991	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017573	CCCATC	2	12	1392150	1392161	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017573	CTGCGT	2	12	1449940	1449951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017573	ATAAAT	2	12	1459094	1459105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017573	AATAAG	2	12	1602879	1602890	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017573	AAGGAG	2	12	1701303	1701314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017573	TTTTGT	2	12	1725720	1725731	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017573	CAAAGG	2	12	1774722	1774733	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017573	CGTTGC	2	12	1801847	1801858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017573	CAATAA	2	12	1801931	1801942	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017573	GTGCCG	2	12	1828330	1828341	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017573	CAAAAA	2	12	1845031	1845042	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017573	TCCTTT	2	12	1858122	1858133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017573	AAAGGG	2	12	1874340	1874351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017573	ACTAAC	2	12	1876380	1876391	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017573	CAAGTG	2	12	1884166	1884177	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017573	TTGGTG	2	12	1921661	1921672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017573	ATAAGG	2	12	1925732	1925743	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017573	CTTTTT	2	12	1940199	1940210	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017573	AGGCTA	2	12	1940413	1940424	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017573	ACGTTA	2	12	1965615	1965626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017573	GCGGCA	2	12	1990237	1990248	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017573	TGACAA	2	12	2050221	2050232	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017573	AATTAA	2	12	2052247	2052258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017573	AGCATG	2	12	2066518	2066529	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017573	GCTTTT	2	12	2097173	2097184	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017573	ATAAAA	2	12	2139331	2139342	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017573	CAGAAA	2	12	2161693	2161704	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017573	CACCCG	2	12	2170523	2170534	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017573	GTTAAC	2	12	2179723	2179734	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017573	GTTAAC	2	12	2179787	2179798	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017573	TATTTT	2	12	2193800	2193811	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017573	TTTGTT	2	12	2193890	2193901	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017573	ATGAGA	2	12	2216514	2216525	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017573	AAATGA	2	12	2228138	2228149	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017573	TAGCGG	2	12	2237436	2237447	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017573	AGAGGA	2	12	2242668	2242679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017573	CTTTTT	2	12	2246404	2246415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017573	GCAAAT	2	12	2290119	2290130	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017573	CAATAA	2	12	2304712	2304723	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017573	GGAGCG	2	12	2355370	2355381	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017573	GCAACG	2	12	2443649	2443660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017573	CGGCTT	2	12	2449640	2449651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017573	CATTTT	2	12	2455810	2455821	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017573	CTTTTT	2	12	2462680	2462691	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017573	ATTATC	2	12	2467033	2467044	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017573	TGGCGC	2	12	2468215	2468226	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017573	GTTTCC	2	12	2533088	2533099	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017573	AATAAA	2	12	2585781	2585792	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017573	AATATC	2	12	2586574	2586585	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017573	TAATTT	2	12	2597919	2597930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017573	CAATTG	2	12	2606120	2606131	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017573	ACCTTC	2	12	2630229	2630240	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017573	CCGCGC	2	12	2669114	2669125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017573	AACGTT	2	12	2678256	2678267	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017573	CTATTA	2	12	2686411	2686422	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017573	GCTTGC	2	12	2728096	2728107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017573	GTTTGA	2	12	2828972	2828983	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017573	TTTACC	2	12	2855897	2855908	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017573	ACAAAA	2	12	2877257	2877268	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017573	TAATTT	2	12	2931035	2931046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017573	TGAAGA	2	12	2943178	2943189	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017573	AGTAAT	2	12	3027870	3027881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017573	AAAAGG	2	12	3039384	3039395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017573	TAAAAA	2	12	3044539	3044550	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017573	CTAAAA	2	12	3082160	3082171	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017573	AACAAA	2	12	3166439	3166450	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017573	ATAAAA	2	12	3187606	3187617	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017573	CTACTC	2	12	3198293	3198304	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017573	ATTTTT	2	12	3198327	3198338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017573	TAAATA	2	12	3199929	3199940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017573	TGCCAA	2	12	3227806	3227817	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017573	AAAGGT	2	12	3252529	3252540	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017573	TTTTAA	2	12	3271680	3271691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017573	GAAAGA	2	12	3361037	3361048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017573	AAAATA	2	12	3373479	3373490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017573	GAGCCT	2	12	3385393	3385404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017573	AATGGC	2	12	3434073	3434084	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017573	CATTTC	2	12	3473917	3473928	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017573	TTATCC	2	12	3474621	3474632	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017573	GGAAAT	2	12	3475900	3475911	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017573	GATCAC	2	12	3523480	3523491	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017573	ATCAGG	2	12	3530753	3530764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.