MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica BA175 plasmid pSBAL17502

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017572	CTA	2	6	68	73	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017572	A	7	7	7333	7339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017572	TTTG	2	8	7375	7382	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017572	TGTC	2	8	7407	7414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017572	ATTAG	2	10	7510	7519	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017572	GCT	2	6	7539	7544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017572	CT	3	6	7543	7548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017572	ACC	2	6	7683	7688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017572	CTC	2	6	7737	7742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017572	TCA	2	6	7808	7813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017572	TAA	2	6	7829	7834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017572	TAC	2	6	7852	7857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017572	CAT	2	6	7912	7917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017572	CCT	2	6	7944	7949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017572	GTTAA	2	10	8071	8080	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017572	TAATT	2	10	8164	8173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017572	AAT	2	6	8254	8259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017572	AGA	2	6	8264	8269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017572	CAT	2	6	9438	9443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017572	AAAGC	2	10	9452	9461	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017572	A	6	6	9969	9974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017572	GCAA	2	8	10060	10067	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017572	CTG	2	6	10121	10126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017572	A	6	6	10129	10134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017572	AGA	2	6	10142	10147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017572	TTGC	2	8	10201	10208	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017572	CGC	2	6	10335	10340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017572	GC	3	6	10342	10347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017572	TGTC	2	8	10351	10358	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017572	A	6	6	12362	12367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017572	TAT	2	6	12396	12401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017572	G	6	6	12434	12439	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017572	GCG	2	6	13444	13449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017572	CGC	2	6	13454	13459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017572	ATA	2	6	13477	13482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017572	TAGC	2	8	13488	13495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017572	GTG	2	6	13509	13514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017572	ATTC	2	8	13523	13530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017572	GCT	2	6	13544	13549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017572	TGA	2	6	13576	13581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017572	TCGG	2	8	13597	13604	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017572	TCGCT	2	10	13610	13619	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017572	GCAA	2	8	13646	13653	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017572	ACC	2	6	13697	13702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017572	ACC	2	6	13705	13710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017572	CAT	2	6	13775	13780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017572	CAC	2	6	13833	13838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017572	TTCGC	2	10	13856	13865	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017572	GC	3	6	13870	13875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017572	GCGA	2	8	13896	13903	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017572	GAT	2	6	13927	13932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017572	AGCA	2	8	13946	13953	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017572	TTA	2	6	14941	14946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017572	TGA	2	6	14955	14960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017572	GCC	2	6	15279	15284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017572	T	8	8	15316	15323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017572	GCC	2	6	15364	15369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017572	A	6	6	15392	15397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017572	A	6	6	15402	15407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017572	GTT	2	6	15499	15504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017572	TTA	2	6	15607	15612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017572	ATAA	2	8	15672	15679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017572	TAA	2	6	15689	15694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017572	TTA	2	6	15698	15703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017572	TATT	2	8	15721	15728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017572	A	7	7	16203	16209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017572	AG	3	6	16227	16232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017572	TTG	2	6	16465	16470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017572	ATTA	2	8	16478	16485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017572	GTGTTG	2	12	16493	16504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017572	GCC	2	6	16530	16535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017572	TTTG	2	8	16540	16547	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017572	CG	3	6	22535	22540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017572	CTT	2	6	35190	35195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017572	CAT	2	6	43276	43281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017572	A	7	7	44021	44027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017572	AG	3	6	44209	44214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017572	GAT	2	6	44229	44234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017572	A	9	9	45016	45024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017572	ATTT	2	8	45031	45038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017572	ATAA	2	8	45039	45046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017572	TAT	2	6	45049	45054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017572	CTA	2	6	45094	45099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017572	TCT	2	6	45105	45110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017572	T	6	6	45204	45209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017572	AATGA	2	10	45223	45232	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017572	AGC	2	6	45297	45302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017572	GCA	2	6	45356	45361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017572	TCT	2	6	45417	45422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017572	GT	3	6	45447	45452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017572	GGC	2	6	46268	46273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017572	TC	3	6	46300	46305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017572	AAG	2	6	46403	46408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017572	CTTT	2	8	46425	46432	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017572	TAG	2	6	46449	46454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017572	ATT	2	6	46465	46470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017572	GCAA	2	8	46504	46511	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017572	CAG	2	6	46614	46619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017572	T	6	6	46727	46732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017572	TAG	2	6	46903	46908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017572	AGG	2	6	46922	46927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017572	GGA	2	6	47100	47105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017572	T	6	6	47198	47203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017572	ACCGT	2	10	47348	47357	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017572	CT	3	6	47508	47513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017572	TTA	2	6	47918	47923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017572	TGAT	2	8	49088	49095	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017572	ATTAAA	2	12	49113	49124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017572	GGT	2	6	49287	49292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017572	T	6	6	49321	49326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017572	T	6	6	49329	49334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017572	ATTC	2	8	49729	49736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017572	TA	3	6	49747	49752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017572	ACC	2	6	50405	50410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017572	GAG	2	6	50580	50585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017572	ATT	2	6	50614	50619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017572	TA	3	6	50765	50770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017572	TGA	2	6	50785	50790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017572	TCCA	2	8	52252	52259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017572	AAT	2	6	52295	52300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017572	GAG	2	6	52362	52367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017572	ATT	2	6	52403	52408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017572	GA	3	6	52589	52594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017572	TCC	2	6	52599	52604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_017572	ATG	2	6	52641	52646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017572	TAT	2	6	52677	52682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017572	AGG	2	6	52882	52887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017572	GCT	2	6	53771	53776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017572	A	6	6	53836	53841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017572	TAACC	2	10	53946	53955	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017572	T	6	6	54072	54077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017572	TGA	2	6	54112	54117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017572	GAT	2	6	54122	54127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017572	TG	3	6	54159	54164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017572	CAA	2	6	54224	54229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017572	CTC	2	6	54351	54356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017572	ATA	2	6	54370	54375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017572	CGG	2	6	54376	54381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017572	GAC	2	6	54393	54398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017572	TCA	2	6	54400	54405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017572	GAT	2	6	54485	54490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017572	T	6	6	54538	54543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017572	CTT	2	6	54647	54652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017572	TG	3	6	54670	54675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017572	CT	3	6	54712	54717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017572	CCA	2	6	54718	54723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_017572	AAT	2	6	54772	54777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017572	CCT	2	6	54878	54883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_017572	TTC	2	6	54966	54971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017572	GAC	2	6	55032	55037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017572	GCA	2	6	55148	55153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017572	GAT	2	6	55164	55169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017572	TTG	2	6	55198	55203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017572	CTG	2	6	55380	55385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017572	AAC	2	6	55482	55487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_017572	TAT	2	6	56206	56211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017572	TTTAA	2	10	56254	56263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017572	CTT	2	6	56268	56273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017572	GTA	2	6	56302	56307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_017572	TCA	2	6	56445	56450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_017572	TTG	2	6	57987	57992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_017572	AAT	2	6	59410	59415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017572	CTGA	2	8	59485	59492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
169	NC_017572	TTG	2	6	59505	59510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_017572	ATT	2	6	59806	59811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_017572	A	6	6	59898	59903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017572	AAT	2	6	59913	59918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017572	GTT	2	6	59939	59944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_017572	CATC	2	8	59988	59995	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
179	NC_017572	TA	3	6	60007	60012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017572	ATTC	2	8	60681	60688	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
182	NC_017572	A	7	7	60695	60701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017572	GGAA	2	8	60710	60717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.