MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica BA175 plasmid pSBAL17501

Total Repeats: 364

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017570	TGG	2	6	375	380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017570	TCC	2	6	714	719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017570	TAAA	2	8	744	751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017570	CAA	2	6	863	868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017570	CCG	2	6	1026	1031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017570	CGC	2	6	1053	1058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017570	A	7	7	1124	1130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017570	GGAA	2	8	1139	1146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017570	T	6	6	1305	1310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017570	TAA	2	6	6033	6038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017570	CCG	2	6	6042	6047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017570	GAA	2	6	6063	6068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017570	TAA	2	6	6105	6110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017570	T	6	6	6151	6156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017570	A	7	7	6228	6234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017570	ACA	2	6	6273	6278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017570	TGT	2	6	6289	6294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017570	TAA	2	6	7308	7313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017570	CA	3	6	7314	7319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017570	GTCT	2	8	7363	7370	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017570	AAT	2	6	7385	7390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017570	TTA	2	6	7478	7483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017570	TAA	2	6	7530	7535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017570	ATT	2	6	7553	7558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017570	GCAA	2	8	7629	7636	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017570	AACTA	2	10	7669	7678	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017570	TTTA	2	8	7813	7820	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017570	GATT	2	8	11720	11727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017570	CG	3	6	11738	11743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017570	TAT	2	6	11789	11794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017570	TGA	2	6	11800	11805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017570	ATT	2	6	11818	11823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017570	TATT	2	8	11832	11839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017570	A	6	6	11876	11881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017570	TTA	2	6	11984	11989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017570	GTG	2	6	11995	12000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017570	TTC	2	6	12142	12147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017570	TG	3	6	12250	12255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017570	TAA	2	6	12275	12280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017570	TCC	2	6	14652	14657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017570	AAT	2	6	14661	14666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017570	ACA	2	6	14775	14780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017570	AG	3	6	15049	15054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017570	CTTA	2	8	15117	15124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017570	TA	3	6	15170	15175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017570	ATT	2	6	15196	15201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017570	TTC	2	6	15217	15222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017570	T	6	6	15265	15270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017570	TAA	2	6	15424	15429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017570	TAA	2	6	15442	15447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017570	A	6	6	15463	15468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017570	TAA	2	6	15513	15518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017570	ATAC	2	8	15523	15530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017570	AG	3	6	15593	15598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017570	TTAT	2	8	15645	15652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017570	GCC	2	6	15672	15677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017570	AC	4	8	16437	16444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017570	TGAC	2	8	16479	16486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017570	TGC	2	6	16516	16521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017570	AGC	2	6	16526	16531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017570	AAT	2	6	16537	16542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017570	TAATG	2	10	16605	16614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017570	A	7	7	16665	16671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017570	T	7	7	16693	16699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017570	AC	3	6	16732	16737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017570	TAAC	2	8	16767	16774	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017570	TGC	2	6	16800	16805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017570	TACTA	2	10	17124	17133	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017570	TA	3	6	17164	17169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017570	AGG	2	6	17215	17220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017570	ACAT	2	8	17603	17610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017570	T	8	8	17616	17623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017570	ATT	2	6	17652	17657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017570	ATT	2	6	17673	17678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017570	A	6	6	17707	17712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017570	GAA	2	6	17735	17740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017570	TAA	2	6	17745	17750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017570	ATG	2	6	18717	18722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017570	CG	3	6	38752	38757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017570	GGC	2	6	38815	38820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017570	CTA	2	6	38829	38834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017570	GAA	2	6	38842	38847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017570	AGC	2	6	38883	38888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017570	AAG	2	6	38897	38902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017570	AGAGC	2	10	38925	38934	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017570	GCG	2	6	39137	39142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017570	GCG	2	6	39208	39213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017570	GAA	2	6	39307	39312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017570	CACT	2	8	39331	39338	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017570	GC	4	8	39375	39382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017570	AGC	2	6	39388	39393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017570	GGC	2	6	39406	39411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017570	ATC	2	6	39412	39417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017570	TAA	2	6	39528	39533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017570	TTTG	2	8	39534	39541	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017570	GCG	2	6	39637	39642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017570	CGC	2	6	39810	39815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017570	CG	3	6	39832	39837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017570	CG	3	6	39911	39916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017570	GCC	2	6	40018	40023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017570	AACC	2	8	40038	40045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017570	AG	3	6	40050	40055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017570	AAAG	2	8	40137	40144	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017570	CAT	2	6	40260	40265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017570	CA	6	12	40363	40374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017570	CAG	2	6	40377	40382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017570	CAA	2	6	40398	40403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017570	CAAG	2	8	40527	40534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017570	A	6	6	40567	40572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017570	CCA	2	6	40601	40606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017570	AC	3	6	40701	40706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017570	GCA	2	6	40839	40844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017570	GTC	2	6	40852	40857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017570	CAG	2	6	40918	40923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017570	AAC	2	6	40954	40959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017570	CAG	2	6	41007	41012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017570	TCA	2	6	41084	41089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017570	CAAA	2	8	41121	41128	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017570	ACAGC	2	10	41187	41196	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017570	CCA	2	6	41243	41248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017570	CAC	2	6	41278	41283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017570	AT	3	6	41360	41365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017570	CAA	2	6	41380	41385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017570	TGA	2	6	41388	41393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017570	CAT	2	6	41435	41440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017570	GCA	2	6	41511	41516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017570	AAG	2	6	41599	41604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017570	ATC	2	6	41687	41692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017570	GC	3	6	41733	41738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017570	ACG	2	6	41763	41768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017570	AGAC	2	8	41818	41825	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017570	CGC	2	6	41872	41877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017570	TCAAAA	2	12	41890	41901	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017570	CAC	3	9	41938	41946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017570	AC	3	6	42048	42053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017570	AC	3	6	42095	42100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017570	GCC	2	6	42101	42106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017570	ACA	2	6	42278	42283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017570	GC	5	10	42285	42294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017570	AAG	2	6	42330	42335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017570	CAAT	2	8	42372	42379	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017570	AACAG	2	10	42408	42417	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017570	CAA	2	6	42485	42490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017570	ACG	2	6	42525	42530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017570	ATCA	2	8	42563	42570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017570	GAA	2	6	42616	42621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017570	CAA	2	6	42724	42729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017570	CGA	2	6	42736	42741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_017570	AC	3	6	61634	61639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
293	NC_017570	AC	3	6	61644	61649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
294	NC_017570	ATTT	2	8	61656	61663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_017570	TGCT	2	8	61670	61677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
296	NC_017570	GACA	2	8	63667	63674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
297	NC_017570	GC	3	6	63678	63683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
298	NC_017570	GCG	2	6	63685	63690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_017570	AAG	2	6	63730	63735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
300	NC_017570	GGC	2	6	64299	64304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_017570	T	7	7	64307	64313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_017570	GGC	2	6	64449	64454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_017570	TGC	2	6	64472	64477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_017570	CGG	2	6	64723	64728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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309	NC_017570	GCA	2	6	64824	64829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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311	NC_017570	TTTTG	2	10	65636	65645	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
312	NC_017570	GTCA	2	8	65779	65786	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
313	NC_017570	CTTT	2	8	66184	66191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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315	NC_017570	TGT	2	6	66467	66472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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319	NC_017570	CAA	2	6	66606	66611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
320	NC_017570	GTA	2	6	66989	66994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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323	NC_017570	GCA	2	6	67158	67163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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326	NC_017570	ATT	2	6	67550	67555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
327	NC_017570	AAT	2	6	67591	67596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
328	NC_017570	ATC	2	6	67606	67611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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331	NC_017570	AAT	2	6	69448	69453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_017570	TAA	2	6	69457	69462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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336	NC_017570	A	6	6	69559	69564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
337	NC_017570	TTG	2	6	69647	69652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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349	NC_017570	CA	3	6	70116	70121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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359	NC_017570	GAT	2	6	71578	71583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.