MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius ED99 chromosome

Total Repeats: 5313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017568	GTG	2	6	42	47	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017568	ATT	2	6	157	162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017568	TAA	2	6	1716	1721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017568	CCA	2	6	3024	3029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017568	ATT	2	6	3111	3116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017568	GGA	2	6	3159	3164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017568	TAA	2	6	3949	3954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017568	TGA	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017568	AGG	2	6	7300	7305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017568	ATC	2	6	9991	9996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017568	GCG	2	6	10042	10047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017568	GTA	2	6	10102	10107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017568	TAA	2	6	10115	10120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017568	TTA	2	6	10134	10139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017568	CCT	2	6	11026	11031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017568	ATT	2	6	11045	11050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017568	ACA	2	6	11051	11056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017568	TGA	2	6	11342	11347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017568	GGA	2	6	11356	11361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017568	AGT	2	6	12938	12943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017568	TCC	2	6	13143	13148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017568	AGG	2	6	14519	14524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017568	CCT	2	6	14544	14549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017568	ATT	2	6	14622	14627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017568	ATA	2	6	14660	14665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017568	TCA	2	6	14666	14671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017568	TGT	2	6	14738	14743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017568	TAA	2	6	14748	14753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017568	AAT	2	6	14755	14760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017568	ACA	2	6	15841	15846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017568	TTA	2	6	15852	15857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017568	TTA	2	6	15867	15872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017568	GAT	2	6	15958	15963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017568	AAG	2	6	17074	17079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017568	ATA	2	6	17093	17098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017568	GAA	2	6	20588	20593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017568	CAT	2	6	20626	20631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017568	ATC	2	6	20722	20727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017568	AAT	2	6	20784	20789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017568	TCT	2	6	20815	20820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017568	ATG	2	6	20886	20891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017568	TTA	2	6	20985	20990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017568	GAG	2	6	21021	21026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017568	AAC	2	6	22503	22508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017568	AAT	2	6	22520	22525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017568	TAA	2	6	22642	22647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017568	ATG	2	6	22750	22755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017568	TGG	2	6	24168	24173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017568	TGT	2	6	24208	24213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017568	ACA	3	9	24265	24273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017568	AAC	2	6	25217	25222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017568	CGG	2	6	25347	25352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017568	TGA	2	6	25528	25533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017568	GTT	2	6	25543	25548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017568	AGG	2	6	25630	25635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017568	TAT	2	6	25655	25660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017568	ATT	2	6	25673	25678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017568	TGG	2	6	25697	25702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017568	TTA	2	6	26368	26373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017568	GGT	2	6	31046	31051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017568	AAG	2	6	31949	31954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017568	CAA	2	6	31995	32000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017568	GTA	2	6	32008	32013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017568	AAG	2	6	32106	32111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017568	ATT	2	6	32194	32199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017568	TAA	3	9	32291	32299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017568	TAA	2	6	32381	32386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017568	AGG	2	6	32548	32553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017568	TAT	2	6	33130	33135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017568	TAA	2	6	33178	33183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017568	ATT	2	6	33230	33235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017568	TAT	2	6	35046	35051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017568	TTA	2	6	35986	35991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017568	CAT	2	6	36011	36016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017568	ATA	2	6	36071	36076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017568	TAT	2	6	36167	36172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017568	TAA	2	6	36278	36283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017568	TCA	2	6	36322	36327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017568	AGT	2	6	36383	36388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017568	ATA	2	6	36434	36439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017568	TAT	2	6	36586	36591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017568	ATA	2	6	36636	36641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017568	TCA	2	6	36700	36705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017568	TTA	2	6	36867	36872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017568	TTG	2	6	37004	37009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017568	TCT	2	6	37016	37021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017568	CTT	2	6	37112	37117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017568	TGA	2	6	37143	37148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017568	ATA	2	6	37167	37172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017568	GTA	2	6	37249	37254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017568	GTG	2	6	37298	37303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017568	CTT	2	6	37447	37452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017568	CTG	2	6	37511	37516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017568	GAT	2	6	37543	37548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017568	CTT	2	6	37724	37729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017568	ATA	2	6	37781	37786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017568	TAT	2	6	37865	37870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017568	TCT	3	9	37919	37927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017568	TCT	2	6	38143	38148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017568	GCC	2	6	38173	38178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017568	ATA	2	6	38211	38216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017568	ATA	2	6	38232	38237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017568	TGA	2	6	38260	38265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017568	AAG	2	6	39480	39485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017568	GTT	2	6	39503	39508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017568	AAT	2	6	39521	39526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017568	TTC	2	6	39535	39540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017568	ATG	2	6	39558	39563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017568	TAT	3	9	39569	39577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017568	CAC	2	6	39581	39586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017568	GCT	2	6	39597	39602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017568	TGC	2	6	39606	39611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017568	GTT	2	6	39617	39622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017568	AGG	2	6	39627	39632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017568	CGA	2	6	39900	39905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017568	GAT	2	6	39945	39950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017568	GAG	2	6	40279	40284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017568	GAT	2	6	41435	41440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017568	GTT	2	6	43895	43900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017568	AGG	2	6	44050	44055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017568	TGA	2	6	46275	46280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017568	ATG	2	6	46992	46997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017568	TTG	2	6	47028	47033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017568	TAA	2	6	47075	47080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017568	ATC	3	9	47169	47177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017568	ATT	2	6	47218	47223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017568	CAT	2	6	47721	47726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017568	AGG	2	6	47733	47738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017568	TAG	2	6	48992	48997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017568	TAA	2	6	49202	49207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017568	ATG	2	6	49267	49272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017568	TAA	2	6	49392	49397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017568	AAT	2	6	49453	49458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017568	ATG	2	6	49474	49479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017568	ATA	2	6	49486	49491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017568	GTT	2	6	50982	50987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017568	CTC	2	6	51061	51066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017568	CCT	2	6	51113	51118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017568	ATT	2	6	51129	51134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017568	TTA	2	6	51135	51140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017568	ATT	2	6	51155	51160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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