MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius ED99 chromosome

Total Repeats: 10270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017568	TGG	2	6	820060	820065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_017568	TAC	2	6	820068	820073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_017568	GCA	2	6	820099	820104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_017568	CCT	2	6	820156	820161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_017568	TCAT	2	8	820208	820215	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_017568	GGT	2	6	820292	820297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_017568	CGT	2	6	820487	820492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_017568	CGT	2	6	820513	820518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_017568	GAG	2	6	820536	820541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017568	TATG	2	8	820620	820627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_017568	C	6	6	820663	820668	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3512	NC_017568	GAGAT	2	10	820671	820680	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017568	GAT	2	6	820711	820716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_017568	ATCG	2	8	820772	820779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3515	NC_017568	TACT	2	8	820828	820835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_017568	CAA	2	6	820860	820865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_017568	ATT	2	6	821010	821015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017568	T	6	6	821026	821031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017568	CA	3	6	821062	821067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_017568	TCAA	2	8	821090	821097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3521	NC_017568	TCC	2	6	821132	821137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_017568	GT	3	6	821140	821145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_017568	TCT	2	6	821163	821168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_017568	TTCAAC	2	12	821200	821211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_017568	ATA	2	6	821249	821254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_017568	ACT	2	6	821290	821295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_017568	TC	3	6	822597	822602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_017568	ATC	2	6	822620	822625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_017568	TTCA	2	8	828436	828443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3530	NC_017568	A	6	6	828450	828455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_017568	ATA	2	6	829477	829482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017568	CCT	2	6	833436	833441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_017568	A	6	6	833455	833460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_017568	CTA	2	6	833543	833548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_017568	TAA	3	9	833567	833575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_017568	ATA	2	6	833580	833585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_017568	TCA	2	6	833608	833613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_017568	TG	3	6	833716	833721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_017568	AGAA	2	8	833755	833762	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017568	AAG	2	6	833805	833810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_017568	A	7	7	833824	833830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017568	A	6	6	833862	833867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_017568	GTG	2	6	833876	833881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_017568	CGAA	2	8	833963	833970	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_017568	GTT	2	6	836531	836536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_017568	AAT	2	6	836676	836681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_017568	T	6	6	836721	836726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_017568	ATG	2	6	836739	836744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_017568	CGA	2	6	837017	837022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_017568	ATA	2	6	837105	837110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_017568	CTG	2	6	837147	837152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_017568	AAG	2	6	837228	837233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_017568	AGTC	2	8	837237	837244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3554	NC_017568	C	6	6	837298	837303	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3555	NC_017568	CAA	2	6	837319	837324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_017568	ATG	2	6	839145	839150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_017568	GTA	2	6	839208	839213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_017568	TG	3	6	839266	839271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017568	AAG	2	6	839322	839327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017568	CCA	2	6	839448	839453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_017568	TTAT	2	8	841430	841437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017568	ACA	2	6	841441	841446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_017568	TTA	2	6	841479	841484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017568	TA	3	6	841483	841488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_017568	AC	5	10	841506	841515	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_017568	AT	3	6	841531	841536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017568	GGA	2	6	841550	841555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_017568	TCA	2	6	842264	842269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_017568	GA	3	6	842313	842318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_017568	T	6	6	842329	842334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_017568	AAC	2	6	842359	842364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_017568	ATC	2	6	844022	844027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_017568	TAA	2	6	844049	844054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_017568	TAT	3	9	844055	844063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_017568	TGT	2	6	844076	844081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_017568	AGT	2	6	844084	844089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3578	NC_017568	TTA	3	9	844118	844126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_017568	GGAG	2	8	844158	844165	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_017568	TAC	2	6	846103	846108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_017568	AAT	2	6	846142	846147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_017568	TA	3	6	846154	846159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_017568	A	6	6	846194	846199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_017568	AAT	2	6	846246	846251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_017568	TAAAT	2	10	846301	846310	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_017568	AATAAA	2	12	846334	846345	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_017568	A	6	6	846343	846348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_017568	ATT	3	9	846358	846366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_017568	TACAGT	2	12	846443	846454	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3590	NC_017568	AATT	2	8	846467	846474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_017568	TAA	2	6	846481	846486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_017568	GAA	3	9	846573	846581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_017568	CGA	2	6	846611	846616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3595	NC_017568	TTAAT	2	10	846756	846765	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_017568	AT	3	6	846790	846795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_017568	ATTTT	2	10	846798	846807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_017568	AT	3	6	846809	846814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_017568	T	6	6	846849	846854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_017568	T	7	7	846968	846974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_017568	TGA	2	6	847045	847050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_017568	AGG	2	6	848045	848050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_017568	AT	3	6	850538	850543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017568	AC	3	6	851269	851274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_017568	AC	3	6	852578	852583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_017568	CTC	2	6	853307	853312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_017568	A	6	6	853480	853485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_017568	TGT	2	6	853488	853493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_017568	TCA	3	9	853501	853509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_017568	TTAAG	2	10	853577	853586	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_017568	TTC	2	6	853609	853614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_017568	CAA	2	6	853639	853644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_017568	TTTA	2	8	853663	853670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_017568	AGG	2	6	853678	853683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_017568	GCA	2	6	853695	853700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_017568	ATA	2	6	853766	853771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_017568	CTTA	2	8	853806	853813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_017568	TAA	2	6	853862	853867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_017568	T	6	6	853885	853890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_017568	TAAT	2	8	853893	853900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017568	TAAA	2	8	853928	853935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_017568	GAA	2	6	853951	853956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_017568	TCCC	2	8	853965	853972	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3624	NC_017568	A	7	7	854009	854015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_017568	AG	3	6	854036	854041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_017568	TCA	2	6	854863	854868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_017568	ATG	2	6	854901	854906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_017568	AT	3	6	854941	854946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_017568	GGT	2	6	854954	854959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3631	NC_017568	A	6	6	856390	856395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_017568	GTC	2	6	856418	856423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_017568	A	6	6	856443	856448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_017568	ATT	2	6	857360	857365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_017568	AATTA	2	10	857370	857379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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