MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus ND03 chromosome

Total Repeats: 7695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017563	A	7	7	940816	940822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017563	A	6	6	940846	940851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017563	ACTCAA	2	12	940933	940944	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_017563	TAT	2	6	940956	940961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017563	GCAT	2	8	940993	941000	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_017563	ACT	2	6	941035	941040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_017563	CGA	2	6	941048	941053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_017563	T	7	7	941218	941224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017563	ATA	2	6	941577	941582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017563	TTC	2	6	941621	941626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_017563	CAT	2	6	942357	942362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_017563	TTG	3	9	942423	942431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017563	AGG	2	6	942437	942442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017563	T	6	6	942474	942479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017563	A	6	6	942503	942508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017563	CTA	2	6	942549	942554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_017563	AC	3	6	944521	944526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_017563	ATA	2	6	944549	944554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017563	TTC	2	6	944591	944596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_017563	AAGA	2	8	944611	944618	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017563	TAA	2	6	944675	944680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017563	ATT	2	6	944681	944686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017563	T	8	8	945924	945931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017563	TA	3	6	945962	945967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017563	A	6	6	945972	945977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017563	T	6	6	946055	946060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017563	TGAT	2	8	946066	946073	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017563	TA	3	6	946091	946096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017563	AT	3	6	946130	946135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017563	CTT	2	6	949592	949597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_017563	A	7	7	949644	949650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017563	TAA	2	6	949734	949739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017563	TCA	2	6	949786	949791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_017563	GGC	2	6	949811	949816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_017563	TAA	2	6	949863	949868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017563	CTACCA	2	12	949878	949889	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_017563	TCA	2	6	949890	949895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_017563	AGA	2	6	950865	950870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017563	ACC	2	6	951067	951072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_017563	TGGT	2	8	951134	951141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017563	ATT	2	6	951165	951170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017563	TAT	2	6	951258	951263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017563	A	6	6	951286	951291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017563	TTA	2	6	952498	952503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017563	AAT	2	6	953083	953088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017563	TTC	2	6	953123	953128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017563	CTT	2	6	953146	953151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_017563	ACA	2	6	953213	953218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_017563	GAT	2	6	953330	953335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017563	GTA	2	6	953373	953378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017563	CCA	2	6	953385	953390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_017563	CT	3	6	953548	953553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_017563	CTTG	2	8	953590	953597	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_017563	TAAA	2	8	953711	953718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017563	CT	4	8	954150	954157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_017563	CCTT	2	8	954191	954198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4057	NC_017563	ACC	2	6	954294	954299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_017563	T	6	6	954301	954306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017563	CTA	2	6	954325	954330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_017563	ACC	2	6	954909	954914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_017563	ACC	2	6	954917	954922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_017563	GAA	2	6	955020	955025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017563	TAA	2	6	955077	955082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017563	AG	3	6	955105	955110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017563	TCA	2	6	955299	955304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_017563	AT	3	6	955935	955940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017563	GTA	2	6	955957	955962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017563	AACCA	2	10	956038	956047	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4069	NC_017563	GAA	2	6	956055	956060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017563	CTA	2	6	956277	956282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4072	NC_017563	CGT	2	6	956295	956300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4074	NC_017563	ATA	2	6	957365	957370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017563	T	6	6	958370	958375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017563	TC	3	6	958386	958391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_017563	TCC	2	6	958403	958408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4078	NC_017563	AAC	2	6	958422	958427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_017563	AT	3	6	958460	958465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017563	ATAAA	2	10	958493	958502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_017563	ATA	2	6	958618	958623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017563	GTT	2	6	958626	958631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017563	CAT	2	6	958666	958671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4086	NC_017563	CT	3	6	958727	958732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_017563	TA	3	6	958733	958738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017563	CTC	2	6	958739	958744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4089	NC_017563	T	6	6	958793	958798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017563	A	6	6	962013	962018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017563	ATA	2	6	962040	962045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017563	T	6	6	962057	962062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017563	ATT	2	6	962063	962068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017563	TA	3	6	962069	962074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017563	TA	3	6	962080	962085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017563	A	7	7	962109	962115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017563	AATT	2	8	962123	962130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017563	A	7	7	962136	962142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017563	AATT	2	8	962150	962157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017563	TAA	2	6	962191	962196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017563	CAA	2	6	962958	962963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_017563	TC	3	6	962975	962980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_017563	AG	3	6	963248	963253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017563	TTA	2	6	963422	963427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017563	AAG	2	6	963454	963459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017563	TATT	2	8	963479	963486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017563	T	8	8	963512	963519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017563	ATA	2	6	963594	963599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017563	TTC	2	6	963665	963670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_017563	TA	3	6	963680	963685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017563	CGT	2	6	963754	963759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_017563	GAT	2	6	963775	963780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4114	NC_017563	GCT	2	6	963951	963956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4116	NC_017563	CTT	2	6	964097	964102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_017563	ATA	2	6	964109	964114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017563	GTA	2	6	964152	964157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017563	GTA	2	6	964226	964231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017563	AAT	2	6	964244	964249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017563	T	6	6	964257	964262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017563	CT	3	6	964299	964304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_017563	T	6	6	964308	964313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017563	T	6	6	964336	964341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017563	TTA	2	6	964393	964398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017563	TA	3	6	964441	964446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017563	TTA	2	6	964450	964455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017563	AGG	2	6	964470	964475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017563	TCCT	2	8	964489	964496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_017563	TA	3	6	964499	964504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017563	TTA	2	6	964532	964537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017563	CAGT	2	8	966117	966124	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4133	NC_017563	AAT	2	6	966179	966184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017563	AT	3	6	966189	966194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_017563	ATC	2	6	966221	966226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_017563	A	6	6	966264	966269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_017563	AG	3	6	966317	966322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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