MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus ND03 chromosome

Total Repeats: 7695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017563	AC	3	6	88243	88248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_017563	TAA	2	6	88282	88287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017563	AAT	2	6	88294	88299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017563	T	6	6	88368	88373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017563	TAT	2	6	88428	88433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017563	CAA	2	6	88435	88440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017563	TGGG	2	8	88480	88487	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017563	GAG	2	6	88509	88514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017563	T	6	6	88522	88527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017563	GGGGC	2	10	89363	89372	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
511	NC_017563	CAGCC	2	10	89374	89383	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
512	NC_017563	AAAT	2	8	89397	89404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017563	AAAAG	2	10	90477	90486	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017563	AATC	2	8	90497	90504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
515	NC_017563	CTT	2	6	90509	90514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017563	T	6	6	90513	90518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017563	GTG	2	6	91101	91106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017563	A	7	7	91123	91129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017563	CTA	2	6	91139	91144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017563	TAA	2	6	91241	91246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017563	GGA	2	6	91272	91277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017563	AT	3	6	91746	91751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017563	CCA	2	6	94354	94359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_017563	GAA	2	6	94369	94374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017563	CTT	2	6	94378	94383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017563	CTT	2	6	94386	94391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017563	TAGG	2	8	94428	94435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017563	TGGT	2	8	94514	94521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017563	TGTT	2	8	94535	94542	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017563	T	6	6	94557	94562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017563	ATA	2	6	94565	94570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017563	CAG	2	6	94590	94595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017563	CTTG	2	8	94599	94606	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
534	NC_017563	ATG	2	6	94760	94765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017563	ATA	2	6	94772	94777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017563	AGG	2	6	94809	94814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017563	TGT	2	6	94979	94984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017563	TTC	2	6	95020	95025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017563	ATT	2	6	95050	95055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017563	ATT	2	6	95068	95073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017563	TCA	2	6	95133	95138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017563	GAG	2	6	95225	95230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017563	T	6	6	95492	95497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017563	CTG	2	6	95503	95508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017563	AAG	2	6	95541	95546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017563	ATA	2	6	95550	95555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017563	T	6	6	95567	95572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017563	TAT	2	6	95605	95610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017563	TC	3	6	96981	96986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_017563	TAT	2	6	96996	97001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017563	ATGA	2	8	97109	97116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017563	TAT	2	6	100187	100192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017563	A	6	6	100203	100208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017563	TAA	2	6	100209	100214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017563	AAT	2	6	100228	100233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017563	GAAA	2	8	100875	100882	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017563	T	6	6	101002	101007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017563	A	6	6	101058	101063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017563	T	6	6	101081	101086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017563	TTTTA	2	10	101091	101100	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017563	TA	3	6	101099	101104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017563	A	6	6	101219	101224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017563	AATT	2	8	101233	101240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017563	CTG	2	6	102998	103003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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566	NC_017563	GTT	2	6	103019	103024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017563	A	6	6	103110	103115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017563	T	6	6	103196	103201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017563	AAG	2	6	103228	103233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017563	GAG	2	6	103269	103274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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573	NC_017563	AGT	2	6	106201	106206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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575	NC_017563	A	6	6	106383	106388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017563	AAT	2	6	106390	106395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017563	TTTA	2	8	107024	107031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017563	TTTA	2	8	107037	107044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017563	TAGC	2	8	107045	107052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
580	NC_017563	TCC	2	6	107077	107082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_017563	TGA	2	6	107092	107097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017563	T	6	6	107108	107113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017563	AGG	2	6	107121	107126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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586	NC_017563	A	6	6	108123	108128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_017563	T	7	7	108167	108173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017563	TA	4	8	108282	108289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_017563	TAT	2	6	109274	109279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017563	T	7	7	109279	109285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_017563	ATT	2	6	109536	109541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017563	TTA	2	6	109609	109614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017563	TTTAC	2	10	109623	109632	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
600	NC_017563	GGA	2	6	109633	109638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_017563	ATTTT	2	10	110042	110051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017563	ATA	2	6	110052	110057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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607	NC_017563	AAAT	2	8	110098	110105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017563	TAT	2	6	110116	110121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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610	NC_017563	TGG	2	6	110221	110226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017563	GTT	2	6	110241	110246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017563	ATTG	2	8	110265	110272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017563	T	7	7	110301	110307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017563	AAT	2	6	110394	110399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017563	T	6	6	110409	110414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017563	A	6	6	110482	110487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017563	TA	3	6	110488	110493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017563	ATC	2	6	110596	110601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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622	NC_017563	AT	3	6	110707	110712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017563	TAAG	2	8	110788	110795	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017563	ATTT	2	8	110797	110804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017563	GAA	2	6	113236	113241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017563	AGA	2	6	116543	116548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017563	AGT	2	6	116553	116558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_017563	AAAAG	2	10	116631	116640	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017563	T	7	7	116800	116806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017563	CCA	2	6	116826	116831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_017563	CCA	2	6	116838	116843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_017563	CCA	2	6	116849	116854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_017563	TAAAAA	2	12	118371	118382	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017563	AGA	2	6	118383	118388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017563	CTG	2	6	118402	118407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_017563	ATTA	2	8	119776	119783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017563	TAA	2	6	119818	119823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017563	ATT	2	6	119838	119843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017563	CCA	2	6	120398	120403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
641	NC_017563	GA	3	6	120418	120423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
642	NC_017563	ATG	2	6	120485	120490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_017563	CAA	2	6	120507	120512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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