MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus LGA251

Total Repeats: 255

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017349	ATAAAT	2	12	3294	3305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017349	TTTAAA	2	12	3471	3482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017349	TAAATC	2	12	17163	17174	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017349	GTGGGA	2	12	24614	24625	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017349	TAAAAT	2	12	40041	40052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017349	AAATAT	2	12	51035	51046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017349	TTACAT	2	12	56515	56526	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017349	AAAAAT	2	12	65660	65671	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017349	AATATA	2	12	92455	92466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017349	TTAAAT	2	12	103624	103635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017349	AATTAT	2	12	123333	123344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017349	GTTTTT	2	12	141362	141373	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017349	TGAAAG	2	12	142233	142244	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017349	ATTAAT	2	12	166594	166605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017349	TTTATA	2	12	188015	188026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017349	ATTAAT	2	12	188038	188049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017349	AAATTT	2	12	215198	215209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017349	AAAACT	2	12	238573	238584	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017349	TGAAAC	2	12	238599	238610	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017349	AGTGGA	2	12	250069	250080	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017349	ATATAG	2	12	271301	271312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017349	ATAATT	2	12	277568	277579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017349	AATTAT	2	12	284990	285001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017349	AACGAT	2	12	287828	287839	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017349	TAACTT	2	12	296205	296216	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017349	TAAAAT	2	12	344851	344862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017349	ATATGA	2	12	344895	344906	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017349	TTGTAA	2	12	353362	353373	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017349	TAATAT	2	12	361775	361786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017349	AATTAA	2	12	366482	366493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017349	AATTTG	2	12	393273	393284	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017349	TAAAGA	2	12	395502	395513	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017349	AAAAGC	2	12	413655	413666	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017349	TGAAAT	2	12	418108	418119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017349	TGTATA	2	12	432566	432577	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017349	TTTTTA	2	12	444104	444115	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017349	AAAATG	2	12	449536	449547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017349	ACGTTG	2	12	469959	469970	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017349	AAAAAT	2	12	470681	470692	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017349	TTATAA	2	12	490674	490685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017349	AAATTT	2	12	497433	497444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017349	TTATAA	2	12	558614	558625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017349	GTTATA	2	12	559285	559296	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017349	CTTAAA	2	12	567717	567728	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017349	ACATGT	2	12	577687	577698	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017349	TTAAAA	2	12	585703	585714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017349	TACATT	2	12	585753	585764	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017349	GATTCA	2	12	587278	587289	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017349	TCAGAC	2	12	587299	587310	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017349	GATTCA	2	12	587314	587325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017349	GATTCA	2	12	587332	587343	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017349	GACTCA	2	12	587350	587361	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017349	GACTCA	2	12	587368	587379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017349	TCAGAT	2	12	587389	587400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017349	GATTCA	2	12	587440	587451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017349	GACTCA	2	12	587458	587469	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017349	GATTCA	2	12	587476	587487	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017349	GACTCA	2	12	587530	587541	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017349	GATTCA	2	12	587596	587607	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017349	TCAGAT	2	12	587617	587628	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017349	GACTCA	2	12	587692	587703	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017349	TCAGAT	2	12	587713	587724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017349	GACTCA	2	12	587728	587739	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017349	TCAGAT	2	12	587773	587784	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017349	AAAGCA	2	12	587839	587850	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017349	TAAATG	2	12	588182	588193	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017349	ATTGCG	2	12	607103	607114	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017349	TAAAAT	2	12	626443	626454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017349	ATATTT	2	12	630830	630841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017349	TTTTAA	2	12	633422	633433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017349	CATTAT	2	12	649968	649979	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017349	CATCAA	2	12	660500	660511	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017349	TAATTT	2	12	664740	664751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017349	TGAATA	2	12	681220	681231	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017349	GGATTC	2	12	692571	692582	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017349	TAGTTA	2	12	712144	712155	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017349	TCCCAC	2	12	720634	720645	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017349	TAATTA	2	12	723096	723107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017349	TTTTTA	2	12	730492	730503	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017349	AATGAT	2	12	767114	767125	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017349	ATGTGA	2	12	807034	807045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017349	CCCAAC	2	12	812520	812531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017349	TAAAAA	2	12	826996	827007	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017349	TATCAA	2	12	833751	833762	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017349	ATATAA	2	12	835124	835135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017349	TTTTGA	2	12	837572	837583	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017349	TAAAAA	2	12	846654	846665	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017349	AAATTA	2	12	867688	867699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017349	AAAATA	2	12	876301	876312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017349	CATATA	2	12	915843	915854	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017349	AAGCAC	2	12	920591	920602	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017349	ATGATT	2	12	920741	920752	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017349	ATGATT	2	12	920784	920795	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017349	TAAAAT	2	12	928526	928537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017349	TTTAAT	2	12	1001732	1001743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017349	AAAAAG	2	12	1019060	1019071	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017349	AACGGA	2	12	1033653	1033664	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017349	CATTTA	2	12	1061867	1061878	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017349	ATCATA	2	12	1063771	1063782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017349	TCAAAA	2	12	1070277	1070288	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017349	TATGTA	2	12	1083853	1083864	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017349	TTTTCT	2	12	1083948	1083959	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017349	TTTATA	2	12	1119665	1119676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017349	GAATTA	2	12	1126238	1126249	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017349	ATAATT	2	12	1144425	1144436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017349	TCATTA	2	12	1149690	1149701	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017349	TAATGA	2	12	1157781	1157792	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017349	AGTTCT	2	12	1167519	1167530	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017349	TAATAT	2	12	1170369	1170380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017349	TTTTCA	2	12	1170462	1170473	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017349	AATAGA	2	12	1170889	1170900	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017349	ATTTAT	2	12	1176900	1176911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017349	ATAATT	2	12	1180825	1180836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017349	AAATTT	2	12	1181637	1181648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017349	AAGTAA	2	12	1203330	1203341	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017349	TTAATT	2	12	1217247	1217258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017349	AATTAA	2	12	1219983	1219994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017349	TGATTT	2	12	1224946	1224957	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017349	GAAATT	2	12	1264427	1264438	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017349	AATGAT	2	12	1277202	1277213	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017349	TATATT	2	12	1312147	1312158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017349	ATGTAT	2	12	1337857	1337868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017349	TTAAAG	2	12	1341090	1341101	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017349	ATTAAA	2	12	1366830	1366841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017349	GTATAT	2	12	1374233	1374244	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017349	ATATAA	2	12	1374510	1374521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017349	TTAATT	2	12	1378974	1378985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017349	GTTTTA	2	12	1405988	1405999	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017349	TTACAA	2	12	1415312	1415323	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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252	NC_017349	ATTTTA	2	12	2724152	2724163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_017349	ATTCGA	2	12	2724375	2724386	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_017349	GATTTT	2	12	2741713	2741724	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
255	NC_017349	ATATAA	2	12	2744834	2744845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.