MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus LGA251

Total Repeats: 13257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017349	CTT	2	6	255643	255648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017349	ATT	2	6	257239	257244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017349	AT	4	8	257276	257283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017349	TTG	2	6	257342	257347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017349	TTG	2	6	257354	257359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017349	CAC	2	6	257526	257531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_017349	ATAA	2	8	257532	257539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017349	AAC	2	6	257559	257564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017349	AT	3	6	257578	257583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017349	TTAA	2	8	258528	258535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017349	ATGT	2	8	258631	258638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017349	A	6	6	258651	258656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017349	AT	3	6	258671	258676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017349	A	6	6	258718	258723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017349	TGT	2	6	258741	258746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017349	ATG	2	6	258759	258764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017349	TGA	2	6	258818	258823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017349	AGG	2	6	258846	258851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017349	GGA	2	6	261417	261422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017349	AT	3	6	261745	261750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017349	TTG	2	6	261786	261791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017349	AT	3	6	261911	261916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017349	AGGG	2	8	261920	261927	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017349	AAT	2	6	265564	265569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017349	TG	3	6	265608	265613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017349	GTT	2	6	265632	265637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017349	TAA	2	6	265710	265715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017349	TAT	2	6	265724	265729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017349	AT	3	6	265731	265736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017349	ATG	2	6	265743	265748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017349	TAA	2	6	265753	265758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017349	AAC	2	6	265835	265840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017349	A	6	6	265874	265879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017349	TAA	2	6	265912	265917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017349	ATG	2	6	265982	265987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017349	GGA	2	6	266000	266005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017349	AT	3	6	269468	269473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017349	AAG	2	6	269511	269516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017349	ATG	2	6	269546	269551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017349	TCAA	2	8	269607	269614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_017349	TAAAA	2	10	269648	269657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017349	AATC	2	8	269659	269666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_017349	T	6	6	269722	269727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017349	ATG	2	6	269803	269808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017349	A	6	6	271073	271078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017349	ATTA	2	8	271085	271092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017349	ATAA	2	8	271103	271110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017349	TTA	2	6	271134	271139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017349	AAT	2	6	271292	271297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017349	ATATAG	2	12	271301	271312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017349	GGA	2	6	271319	271324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017349	TA	3	6	274781	274786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017349	GAG	2	6	276659	276664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017349	CAG	2	6	277384	277389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_017349	ATT	2	6	277431	277436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017349	T	7	7	277514	277520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017349	AAT	2	6	277521	277526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017349	TAT	2	6	277550	277555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017349	ATAAA	2	10	277557	277566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017349	ATAATT	2	12	277568	277579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017349	T	8	8	280102	280109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017349	AGG	2	6	280197	280202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017349	ATA	2	6	281362	281367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017349	TTA	2	6	281384	281389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017349	A	7	7	281394	281400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017349	TATG	2	8	281440	281447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017349	CGTT	2	8	281481	281488	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_017349	AATT	2	8	281523	281530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017349	TCA	2	6	281614	281619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_017349	A	7	7	281629	281635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017349	ATC	2	6	283975	283980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_017349	GT	3	6	284000	284005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017349	ATGT	2	8	284191	284198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017349	ATT	2	6	284934	284939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017349	AATTAT	2	12	284990	285001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017349	AT	3	6	285010	285015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017349	TAT	2	6	285024	285029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017349	GT	3	6	285845	285850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017349	TAATA	2	10	287339	287348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017349	AAT	2	6	287408	287413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017349	AAAT	2	8	287658	287665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017349	A	7	7	287739	287745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017349	ACTA	2	8	287753	287760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_017349	GTAT	2	8	287762	287769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017349	TGA	2	6	287812	287817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017349	CTA	2	6	287819	287824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_017349	AACGAT	2	12	287828	287839	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1088	NC_017349	GAT	2	6	287851	287856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017349	CCT	2	6	288692	288697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_017349	ATT	2	6	288709	288714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017349	A	6	6	288767	288772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017349	TCA	2	6	288802	288807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017349	ATT	2	6	288827	288832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017349	GAT	2	6	288840	288845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017349	A	6	6	288859	288864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017349	TCATA	2	10	288909	288918	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1097	NC_017349	ATTT	2	8	291193	291200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017349	ATGC	2	8	291248	291255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_017349	ATT	3	9	291304	291312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017349	AAT	2	6	291328	291333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017349	ATG	2	6	291380	291385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017349	TAAT	2	8	292432	292439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017349	TA	3	6	292448	292453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017349	ATT	2	6	292458	292463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017349	TCA	2	6	292468	292473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017349	TGA	2	6	292490	292495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017349	GA	3	6	292565	292570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017349	AT	3	6	292571	292576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017349	TGA	2	6	292635	292640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017349	ATT	2	6	292655	292660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017349	A	6	6	292686	292691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017349	A	6	6	292697	292702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017349	ATG	2	6	292712	292717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017349	A	6	6	292738	292743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017349	TTAA	2	8	292747	292754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017349	AG	3	6	292771	292776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017349	AAT	3	9	293190	293198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017349	GAA	2	6	293209	293214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017349	A	6	6	293219	293224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017349	TTC	2	6	293227	293232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_017349	TTC	2	6	293295	293300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_017349	TAT	2	6	293301	293306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017349	GAT	2	6	294748	294753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017349	TCAC	2	8	294757	294764	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_017349	GAAT	2	8	294808	294815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017349	AATT	2	8	294819	294826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017349	TGAT	2	8	294834	294841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017349	T	6	6	294841	294846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017349	GATG	2	8	295944	295951	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017349	GTT	2	6	296000	296005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017349	GA	3	6	296043	296048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017349	TAACTT	2	12	296205	296216	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1133	NC_017349	GGA	2	6	296221	296226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017349	T	7	7	297229	297235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017349	TAA	2	6	297241	297246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017349	CTC	2	6	300004	300009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1138	NC_017349	ATT	2	6	301602	301607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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